MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pneumoniae AR39

Total Repeats: 25624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002179	TTA	2	6	22772	22777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16753066
502	NC_002179	TGC	2	6	22801	22806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16753066
503	NC_002179	TA	3	6	22863	22868	50 %	50 %	0 %	0 %	16753066
504	NC_002179	TAA	2	6	23003	23008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_002179	ATTA	2	8	23030	23037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_002179	T	9	9	23049	23057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_002179	T	6	6	23059	23064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_002179	ATA	2	6	23065	23070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_002179	TAT	2	6	23086	23091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_002179	T	6	6	23091	23096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_002179	GCA	2	6	23192	23197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752312
512	NC_002179	TCT	2	6	23354	23359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752312
513	NC_002179	CCT	2	6	23408	23413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16752312
514	NC_002179	CCAC	2	8	23414	23421	25 %	0 %	0 %	75 %	16752312
515	NC_002179	TGA	2	6	23425	23430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752312
516	NC_002179	GCT	2	6	23498	23503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16752312
517	NC_002179	TGA	2	6	23554	23559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752312
518	NC_002179	GC	3	6	23616	23621	0 %	0 %	50 %	50 %	16752312
519	NC_002179	CTTC	2	8	23688	23695	0 %	50 %	0 %	50 %	16752312
520	NC_002179	GCT	2	6	23708	23713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16752312
521	NC_002179	AGC	2	6	23743	23748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752312
522	NC_002179	CTT	2	6	23753	23758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752312
523	NC_002179	AGT	2	6	23779	23784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752312
524	NC_002179	CAGA	2	8	23825	23832	50 %	0 %	25 %	25 %	16752312
525	NC_002179	TAA	2	6	23929	23934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16752312
526	NC_002179	AGC	2	6	23962	23967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752312
527	NC_002179	TTC	2	6	24027	24032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752312
528	NC_002179	AAG	2	6	24033	24038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752312
529	NC_002179	CAA	2	6	24140	24145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16752312
530	NC_002179	AGT	2	6	24149	24154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752312
531	NC_002179	GTA	2	6	24159	24164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752312
532	NC_002179	GAT	2	6	24185	24190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752312
533	NC_002179	GAT	2	6	24235	24240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752312
534	NC_002179	GCA	2	6	24293	24298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752312
535	NC_002179	AGC	2	6	24307	24312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752312
536	NC_002179	TGC	3	9	24334	24342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16752312
537	NC_002179	CAA	2	6	24395	24400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16752312
538	NC_002179	CTG	3	9	24435	24443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16752312
539	NC_002179	TCC	2	6	24460	24465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16752312
540	NC_002179	GCA	2	6	24470	24475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752312
541	NC_002179	CAG	2	6	24552	24557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752312
542	NC_002179	ATG	2	6	24561	24566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752312
543	NC_002179	ATG	2	6	24582	24587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752312
544	NC_002179	ATG	2	6	24606	24611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752312
545	NC_002179	GTGAT	2	10	24618	24627	20 %	40 %	40 %	0 %	16752312
546	NC_002179	A	6	6	24696	24701	100 %	0 %	0 %	0 %	16752312
547	NC_002179	ATC	2	6	24794	24799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752312
548	NC_002179	AAT	2	6	24818	24823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16752312
549	NC_002179	GAG	2	6	24824	24829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16752312
550	NC_002179	GTTT	2	8	24936	24943	0 %	75 %	25 %	0 %	16752312
551	NC_002179	CAG	2	6	24960	24965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752312
552	NC_002179	CAG	2	6	25010	25015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752312
553	NC_002179	CT	3	6	25033	25038	0 %	50 %	0 %	50 %	16752312
554	NC_002179	AAC	2	6	25059	25064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16752312
555	NC_002179	GA	3	6	25082	25087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
556	NC_002179	TTA	2	6	25088	25093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_002179	TTG	2	6	25112	25117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_002179	AC	3	6	25129	25134	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
559	NC_002179	AATA	2	8	25148	25155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_002179	CTT	2	6	25174	25179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_002179	T	6	6	25230	25235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_002179	TGAT	2	8	25251	25258	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
563	NC_002179	CAG	2	6	25278	25283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_002179	TTCT	2	8	25295	25302	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
565	NC_002179	GAA	2	6	25342	25347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_002179	CTG	2	6	25504	25509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16752313
567	NC_002179	TAAA	2	8	25557	25564	75 %	25 %	0 %	0 %	16752313
568	NC_002179	CCT	2	6	25574	25579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16752313
569	NC_002179	AGC	2	6	25624	25629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752313
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572	NC_002179	TTA	2	6	25688	25693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752313
573	NC_002179	ATA	2	6	25780	25785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16752313
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576	NC_002179	AG	3	6	25999	26004	50 %	0 %	50 %	0 %	16752313
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582	NC_002179	TGTAAT	2	12	26276	26287	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16752313
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586	NC_002179	TTTGA	2	10	26548	26557	20 %	60 %	20 %	0 %	16752313
587	NC_002179	ACC	2	6	26644	26649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16752313
588	NC_002179	AAC	2	6	26650	26655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16752313
589	NC_002179	TCA	2	6	26705	26710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752313
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592	NC_002179	TTA	2	6	26795	26800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752313
593	NC_002179	TTG	2	6	26860	26865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752313
594	NC_002179	GTT	2	6	26899	26904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752313
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596	NC_002179	GTA	2	6	27105	27110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752313
597	NC_002179	CCA	2	6	27131	27136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16752313
598	NC_002179	CAT	2	6	27159	27164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752313
599	NC_002179	AGG	2	6	27235	27240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16752313
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601	NC_002179	TCAT	2	8	27266	27273	25 %	50 %	0 %	25 %	16752313
602	NC_002179	ATGT	2	8	27306	27313	25 %	50 %	25 %	0 %	16752313
603	NC_002179	GAA	2	6	27337	27342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752313
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606	NC_002179	CAG	2	6	27453	27458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752313
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611	NC_002179	TGT	2	6	27772	27777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752313
612	NC_002179	TAA	2	6	27802	27807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16752313
613	NC_002179	AGC	2	6	27808	27813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752313
614	NC_002179	TGA	2	6	27942	27947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752313
615	NC_002179	ATAA	2	8	28011	28018	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_002179	TATTTT	2	12	28019	28030	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_002179	TTTGT	2	10	28041	28050	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
618	NC_002179	T	7	7	28050	28056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_002179	A	6	6	28075	28080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_002179	T	6	6	28131	28136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_002179	A	7	7	28142	28148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_002179	TTAATG	2	12	28156	28167	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_002179	TTAA	2	8	28168	28175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_002179	A	6	6	28243	28248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_002179	CT	4	8	28249	28256	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
626	NC_002179	GCGA	2	8	28381	28388	25 %	0 %	50 %	25 %	16752314
627	NC_002179	CAG	2	6	28529	28534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752314
628	NC_002179	TAT	2	6	28558	28563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752314
629	NC_002179	TAAAT	2	10	28677	28686	60 %	40 %	0 %	0 %	16752314
630	NC_002179	AAT	2	6	28717	28722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16752314
631	NC_002179	AGA	2	6	28728	28733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752314
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