MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pneumoniae CWL029 chromosome

Total Repeats: 25646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_000922	GGA	2	6	143692	143697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618034
3002	NC_000922	GAC	2	6	143701	143706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618034
3003	NC_000922	TTTA	2	8	143708	143715	25 %	75 %	0 %	0 %	15618034
3004	NC_000922	GTT	2	6	143725	143730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618034
3005	NC_000922	GATT	2	8	143774	143781	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_000922	ATT	2	6	143904	143909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_000922	TTTTC	2	10	144199	144208	0 %	80 %	0 %	20 %	15618035
3008	NC_000922	AAG	2	6	144265	144270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618035
3009	NC_000922	AGA	2	6	144348	144353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618035
3010	NC_000922	ACA	2	6	144361	144366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618035
3011	NC_000922	TGA	2	6	144391	144396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618035
3012	NC_000922	AAG	2	6	144410	144415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618035
3013	NC_000922	AAG	2	6	144425	144430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618035
3014	NC_000922	GAT	2	6	144462	144467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618035
3015	NC_000922	GTT	2	6	144490	144495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618035
3016	NC_000922	AAAC	2	8	144506	144513	75 %	0 %	0 %	25 %	15618035
3017	NC_000922	AAG	2	6	144658	144663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618035
3018	NC_000922	ATA	2	6	144736	144741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_000922	A	8	8	144770	144777	100 %	0 %	0 %	0 %	15618036
3020	NC_000922	ACCC	2	8	144779	144786	25 %	0 %	0 %	75 %	15618036
3021	NC_000922	TTC	2	6	144814	144819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618036
3022	NC_000922	TTTG	2	8	144833	144840	0 %	75 %	25 %	0 %	15618036
3023	NC_000922	A	6	6	144861	144866	100 %	0 %	0 %	0 %	15618036
3024	NC_000922	TATGT	2	10	144897	144906	20 %	60 %	20 %	0 %	15618036
3025	NC_000922	CTT	2	6	144918	144923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618036
3026	NC_000922	T	6	6	144931	144936	0 %	100 %	0 %	0 %	15618036
3027	NC_000922	AAG	2	6	144947	144952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618036
3028	NC_000922	TTG	2	6	144954	144959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618036
3029	NC_000922	GGTAG	2	10	144968	144977	20 %	20 %	60 %	0 %	15618036
3030	NC_000922	GAA	2	6	145034	145039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618036
3031	NC_000922	CTG	2	6	145050	145055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618036
3032	NC_000922	GAAA	2	8	145062	145069	75 %	0 %	25 %	0 %	15618036
3033	NC_000922	A	6	6	145067	145072	100 %	0 %	0 %	0 %	15618036
3034	NC_000922	AAGAAA	2	12	145082	145093	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15618036
3035	NC_000922	CTT	2	6	145099	145104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_000922	T	7	7	145158	145164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_000922	TC	3	6	145175	145180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3038	NC_000922	T	6	6	145283	145288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_000922	CAC	2	6	145316	145321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_000922	GAA	2	6	145337	145342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618037
3041	NC_000922	A	6	6	145341	145346	100 %	0 %	0 %	0 %	15618037
3042	NC_000922	T	6	6	145405	145410	0 %	100 %	0 %	0 %	15618037
3043	NC_000922	TCT	2	6	145454	145459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618037
3044	NC_000922	TGA	2	6	145511	145516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618037
3045	NC_000922	AAGC	2	8	145518	145525	50 %	0 %	25 %	25 %	15618037
3046	NC_000922	TAAA	2	8	145606	145613	75 %	25 %	0 %	0 %	15618037
3047	NC_000922	TTA	2	6	145626	145631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618037
3048	NC_000922	C	6	6	145634	145639	0 %	0 %	0 %	100 %	15618037
3049	NC_000922	TGA	3	9	145646	145654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618037
3050	NC_000922	AGG	2	6	145688	145693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618037
3051	NC_000922	CT	3	6	145705	145710	0 %	50 %	0 %	50 %	15618037
3052	NC_000922	TTG	2	6	145711	145716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618037
3053	NC_000922	CCT	2	6	145747	145752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15618037
3054	NC_000922	CT	3	6	145776	145781	0 %	50 %	0 %	50 %	15618037
3055	NC_000922	AG	3	6	145885	145890	50 %	0 %	50 %	0 %	15618037
3056	NC_000922	TACA	2	8	145918	145925	50 %	25 %	0 %	25 %	15618037
3057	NC_000922	AGA	3	9	145961	145969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618037
3058	NC_000922	CTT	2	6	145977	145982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618037
3059	NC_000922	GGA	2	6	146031	146036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618037
3060	NC_000922	CA	3	6	146072	146077	50 %	0 %	0 %	50 %	15618037
3061	NC_000922	GA	3	6	146247	146252	50 %	0 %	50 %	0 %	15618037
3062	NC_000922	TA	3	6	146311	146316	50 %	50 %	0 %	0 %	15618037
3063	NC_000922	ACC	2	6	146380	146385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15618037
3064	NC_000922	ATT	2	6	146441	146446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618038
3065	NC_000922	TTA	2	6	146494	146499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618038
3066	NC_000922	TTG	2	6	146531	146536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618038
3067	NC_000922	T	6	6	146628	146633	0 %	100 %	0 %	0 %	15618038
3068	NC_000922	GCT	2	6	146688	146693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618038
3069	NC_000922	TAT	2	6	146703	146708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618038
3070	NC_000922	TGT	2	6	146755	146760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618038
3071	NC_000922	GCTA	2	8	146778	146785	25 %	25 %	25 %	25 %	15618038
3072	NC_000922	GTG	2	6	146812	146817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15618038
3073	NC_000922	TTC	2	6	146891	146896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618038
3074	NC_000922	TTTG	2	8	146938	146945	0 %	75 %	25 %	0 %	15618038
3075	NC_000922	C	6	6	146950	146955	0 %	0 %	0 %	100 %	15618038
3076	NC_000922	ATT	2	6	146974	146979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618038
3077	NC_000922	GTT	2	6	146999	147004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618038
3078	NC_000922	TTG	2	6	147023	147028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618038
3079	NC_000922	GGTT	2	8	147103	147110	0 %	50 %	50 %	0 %	15618038
3080	NC_000922	T	6	6	147149	147154	0 %	100 %	0 %	0 %	15618038
3081	NC_000922	T	8	8	147209	147216	0 %	100 %	0 %	0 %	15618038
3082	NC_000922	ATGG	2	8	147223	147230	25 %	25 %	50 %	0 %	15618038
3083	NC_000922	GA	3	6	147231	147236	50 %	0 %	50 %	0 %	15618038
3084	NC_000922	T	6	6	147265	147270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_000922	TCT	2	6	147306	147311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618039
3086	NC_000922	T	6	6	147313	147318	0 %	100 %	0 %	0 %	15618039
3087	NC_000922	T	6	6	147320	147325	0 %	100 %	0 %	0 %	15618039
3088	NC_000922	TCT	2	6	147330	147335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618039
3089	NC_000922	GAA	2	6	147348	147353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618039
3090	NC_000922	CT	3	6	147388	147393	0 %	50 %	0 %	50 %	15618039
3091	NC_000922	A	6	6	147448	147453	100 %	0 %	0 %	0 %	15618039
3092	NC_000922	GTT	2	6	147505	147510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618039
3093	NC_000922	TAG	2	6	147523	147528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618039
3094	NC_000922	GAAGA	2	10	147544	147553	60 %	0 %	40 %	0 %	15618039
3095	NC_000922	AGA	2	6	147565	147570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618039
3096	NC_000922	ATC	2	6	147579	147584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618039
3097	NC_000922	CTT	2	6	147585	147590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618039
3098	NC_000922	ACA	3	9	147615	147623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618039
3099	NC_000922	GCT	2	6	147624	147629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618039
3100	NC_000922	TAAGAA	2	12	147650	147661	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15618039
3101	NC_000922	A	7	7	147665	147671	100 %	0 %	0 %	0 %	15618039
3102	NC_000922	GCT	2	6	147705	147710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618039
3103	NC_000922	TGT	3	9	147785	147793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618039
3104	NC_000922	TGA	2	6	147934	147939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618039
3105	NC_000922	GAA	2	6	148215	148220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618039
3106	NC_000922	A	6	6	148236	148241	100 %	0 %	0 %	0 %	15618039
3107	NC_000922	TAT	2	6	148272	148277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618039
3108	NC_000922	TCG	2	6	148295	148300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618039
3109	NC_000922	ATG	2	6	148329	148334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618039
3110	NC_000922	TAA	2	6	148343	148348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15618039
3111	NC_000922	AAC	2	6	148384	148389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618039
3112	NC_000922	AG	3	6	148433	148438	50 %	0 %	50 %	0 %	15618039
3113	NC_000922	TGG	2	6	148447	148452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15618039
3114	NC_000922	A	6	6	148545	148550	100 %	0 %	0 %	0 %	15618039
3115	NC_000922	T	6	6	148551	148556	0 %	100 %	0 %	0 %	15618039
3116	NC_000922	A	7	7	148593	148599	100 %	0 %	0 %	0 %	15618039
3117	NC_000922	AGG	2	6	148604	148609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15618039
3118	NC_000922	TGT	2	6	148660	148665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618040
3119	NC_000922	ATT	2	6	148720	148725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618040
3120	NC_000922	T	6	6	148779	148784	0 %	100 %	0 %	0 %	15618040
3121	NC_000922	AG	3	6	148792	148797	50 %	0 %	50 %	0 %	15618040
3122	NC_000922	TTC	2	6	148810	148815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618040
3123	NC_000922	AAG	2	6	148878	148883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618040
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3125	NC_000922	AAG	2	6	148904	148909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618040
3126	NC_000922	AGA	2	6	148945	148950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618040
3127	NC_000922	GTAG	2	8	148972	148979	25 %	25 %	50 %	0 %	15618040
3128	NC_000922	CTTT	2	8	149004	149011	0 %	75 %	0 %	25 %	15618041
3129	NC_000922	TGA	2	6	149135	149140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618041
3130	NC_000922	GTG	3	9	149152	149160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15618041
3131	NC_000922	CT	3	6	149235	149240	0 %	50 %	0 %	50 %	15618041
3132	NC_000922	TTG	2	6	149253	149258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618041
3133	NC_000922	GCT	3	9	149283	149291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15618041
3134	NC_000922	TGA	2	6	149330	149335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618041
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3144	NC_000922	TGA	2	6	149687	149692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618041
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3149	NC_000922	A	8	8	149883	149890	100 %	0 %	0 %	0 %	15618041
3150	NC_000922	CT	3	6	149899	149904	0 %	50 %	0 %	50 %	15618041
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3157	NC_000922	AGA	2	6	150073	150078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618041
3158	NC_000922	GGT	2	6	150091	150096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3159	NC_000922	AGAACA	2	12	150125	150136	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15618042
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3162	NC_000922	GA	3	6	150268	150273	50 %	0 %	50 %	0 %	15618042
3163	NC_000922	TAT	2	6	150393	150398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618042
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3165	NC_000922	TAG	2	6	150514	150519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3199	NC_000922	TTTCT	2	10	152343	152352	0 %	80 %	0 %	20 %	15618046
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3223	NC_000922	TAC	2	6	153711	153716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618046
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3225	NC_000922	TCTTT	2	10	153736	153745	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3226	NC_000922	ATT	2	6	153849	153854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618047
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3229	NC_000922	T	6	6	153903	153908	0 %	100 %	0 %	0 %	15618047
3230	NC_000922	AGA	2	6	153931	153936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15618047
3231	NC_000922	CAT	2	6	153948	153953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618047
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3233	NC_000922	ACA	3	9	154090	154098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618047
3234	NC_000922	CTT	2	6	154151	154156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618047
3235	NC_000922	TAT	2	6	154157	154162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15618047
3236	NC_000922	GTT	2	6	154164	154169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15618047
3237	NC_000922	T	6	6	154230	154235	0 %	100 %	0 %	0 %	15618047
3238	NC_000922	TTTA	2	8	154260	154267	25 %	75 %	0 %	0 %	15618047
3239	NC_000922	T	6	6	154290	154295	0 %	100 %	0 %	0 %	15618047
3240	NC_000922	GATA	2	8	154325	154332	50 %	25 %	25 %	0 %	15618047
3241	NC_000922	ATGA	2	8	154365	154372	50 %	25 %	25 %	0 %	15618047
3242	NC_000922	CTT	2	6	154388	154393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15618047
3243	NC_000922	ATC	2	6	154395	154400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618047
3244	NC_000922	ACG	2	6	154422	154427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15618047
3245	NC_000922	AATAT	2	10	154439	154448	60 %	40 %	0 %	0 %	15618047
3246	NC_000922	TGA	2	6	154529	154534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618047
3247	NC_000922	GTG	2	6	154653	154658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15618047
3248	NC_000922	CAT	2	6	154674	154679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15618047
3249	NC_000922	CAA	2	6	154691	154696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15618047
3250	NC_000922	GATCA	2	10	154698	154707	40 %	20 %	20 %	20 %	15618047
3251	NC_000922	GAT	2	6	154845	154850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618047
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3253	NC_000922	ATG	2	6	154927	154932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15618047
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