MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 2363

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000117	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_000117	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000117	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_000117	AG	3	6	2153	2158	50 %	0 %	50 %	0 %	15604721
5	NC_000117	GA	3	6	2821	2826	50 %	0 %	50 %	0 %	15604721
6	NC_000117	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	15604722
7	NC_000117	TC	3	6	5264	5269	0 %	50 %	0 %	50 %	15604723
8	NC_000117	GA	3	6	5275	5280	50 %	0 %	50 %	0 %	15604723
9	NC_000117	AT	3	6	5379	5384	50 %	50 %	0 %	0 %	15604723
10	NC_000117	TG	3	6	5532	5537	0 %	50 %	50 %	0 %	15604723
11	NC_000117	AG	3	6	5940	5945	50 %	0 %	50 %	0 %	15604723
12	NC_000117	GA	3	6	6998	7003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000117	AC	3	6	7648	7653	50 %	0 %	0 %	50 %	15604725
14	NC_000117	AG	3	6	8391	8396	50 %	0 %	50 %	0 %	15604726
15	NC_000117	CT	4	8	8510	8517	0 %	50 %	0 %	50 %	15604726
16	NC_000117	GT	3	6	8592	8597	0 %	50 %	50 %	0 %	15604726
17	NC_000117	GA	3	6	9866	9871	50 %	0 %	50 %	0 %	15604728
18	NC_000117	AG	3	6	10083	10088	50 %	0 %	50 %	0 %	15604728
19	NC_000117	TA	3	6	11248	11253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000117	AG	3	6	11309	11314	50 %	0 %	50 %	0 %	15604729
21	NC_000117	TA	3	6	11869	11874	50 %	50 %	0 %	0 %	15604729
22	NC_000117	TG	3	6	12772	12777	0 %	50 %	50 %	0 %	15604730
23	NC_000117	AG	3	6	12921	12926	50 %	0 %	50 %	0 %	15604730
24	NC_000117	AG	4	8	13077	13084	50 %	0 %	50 %	0 %	15604730
25	NC_000117	TA	3	6	13339	13344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000117	TA	4	8	13563	13570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000117	AC	3	6	14406	14411	50 %	0 %	0 %	50 %	15604731
28	NC_000117	AG	3	6	15745	15750	50 %	0 %	50 %	0 %	15604732
29	NC_000117	TC	3	6	15785	15790	0 %	50 %	0 %	50 %	15604732
30	NC_000117	GA	3	6	16314	16319	50 %	0 %	50 %	0 %	15604733
31	NC_000117	AG	3	6	16385	16390	50 %	0 %	50 %	0 %	15604733
32	NC_000117	GA	3	6	17169	17174	50 %	0 %	50 %	0 %	15604733
33	NC_000117	AG	3	6	17515	17520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000117	GA	3	6	17528	17533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000117	GA	3	6	17772	17777	50 %	0 %	50 %	0 %	15604734
36	NC_000117	TC	3	6	18222	18227	0 %	50 %	0 %	50 %	15604734
37	NC_000117	CT	3	6	18450	18455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_000117	TC	3	6	18650	18655	0 %	50 %	0 %	50 %	15604735
39	NC_000117	GA	3	6	18665	18670	50 %	0 %	50 %	0 %	15604735
40	NC_000117	GA	3	6	18764	18769	50 %	0 %	50 %	0 %	15604735
41	NC_000117	AG	3	6	19230	19235	50 %	0 %	50 %	0 %	15604735
42	NC_000117	AG	4	8	19516	19523	50 %	0 %	50 %	0 %	15604735
43	NC_000117	GT	3	6	19779	19784	0 %	50 %	50 %	0 %	15604735
44	NC_000117	AG	3	6	20007	20012	50 %	0 %	50 %	0 %	15604736
45	NC_000117	TG	3	6	20120	20125	0 %	50 %	50 %	0 %	15604736
46	NC_000117	AG	3	6	20516	20521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000117	GA	3	6	20674	20679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000117	AG	3	6	21191	21196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000117	CT	3	6	21260	21265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_000117	CT	4	8	21917	21924	0 %	50 %	0 %	50 %	15604737
51	NC_000117	AT	3	6	22187	22192	50 %	50 %	0 %	0 %	15604737
52	NC_000117	AT	3	6	22511	22516	50 %	50 %	0 %	0 %	15604737
53	NC_000117	GA	3	6	23830	23835	50 %	0 %	50 %	0 %	15604737
54	NC_000117	GA	3	6	23922	23927	50 %	0 %	50 %	0 %	15604737
55	NC_000117	AG	3	6	24303	24308	50 %	0 %	50 %	0 %	15604737
56	NC_000117	GA	3	6	25720	25725	50 %	0 %	50 %	0 %	15604738
57	NC_000117	GT	3	6	25740	25745	0 %	50 %	50 %	0 %	15604738
58	NC_000117	TA	3	6	25942	25947	50 %	50 %	0 %	0 %	15604738
59	NC_000117	GA	3	6	26388	26393	50 %	0 %	50 %	0 %	15604738
60	NC_000117	GA	3	6	26512	26517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000117	CT	3	6	26519	26524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_000117	AT	3	6	26805	26810	50 %	50 %	0 %	0 %	15604739
63	NC_000117	GA	3	6	27019	27024	50 %	0 %	50 %	0 %	15604739
64	NC_000117	TC	3	6	27887	27892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_000117	AG	3	6	27970	27975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000117	TG	3	6	28393	28398	0 %	50 %	50 %	0 %	15604741
67	NC_000117	TC	3	6	28446	28451	0 %	50 %	0 %	50 %	15604741
68	NC_000117	GC	4	8	28860	28867	0 %	0 %	50 %	50 %	15604741
69	NC_000117	TA	3	6	28982	28987	50 %	50 %	0 %	0 %	15604741
70	NC_000117	GA	3	6	29933	29938	50 %	0 %	50 %	0 %	15604742
71	NC_000117	AG	3	6	30031	30036	50 %	0 %	50 %	0 %	15604743
72	NC_000117	TC	3	6	30140	30145	0 %	50 %	0 %	50 %	15604743
73	NC_000117	GA	3	6	30761	30766	50 %	0 %	50 %	0 %	15604743
74	NC_000117	GA	3	6	31229	31234	50 %	0 %	50 %	0 %	15604743
75	NC_000117	AT	3	6	31370	31375	50 %	50 %	0 %	0 %	15604744
76	NC_000117	TC	3	6	31655	31660	0 %	50 %	0 %	50 %	15604745
77	NC_000117	GC	3	6	32085	32090	0 %	0 %	50 %	50 %	15604745
78	NC_000117	CT	3	6	32135	32140	0 %	50 %	0 %	50 %	15604745
79	NC_000117	AG	3	6	32267	32272	50 %	0 %	50 %	0 %	15604745
80	NC_000117	TC	3	6	33764	33769	0 %	50 %	0 %	50 %	15604747
81	NC_000117	AG	3	6	33777	33782	50 %	0 %	50 %	0 %	15604747
82	NC_000117	AG	3	6	33915	33920	50 %	0 %	50 %	0 %	15604748
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84	NC_000117	GA	4	8	34631	34638	50 %	0 %	50 %	0 %	15604749
85	NC_000117	GA	3	6	36384	36389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000117	AT	3	6	36486	36491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000117	GA	3	6	36534	36539	50 %	0 %	50 %	0 %	15604751
88	NC_000117	CT	3	6	37018	37023	0 %	50 %	0 %	50 %	15604751
89	NC_000117	AG	3	6	37529	37534	50 %	0 %	50 %	0 %	15604751
90	NC_000117	AG	3	6	38075	38080	50 %	0 %	50 %	0 %	15604751
91	NC_000117	AG	3	6	38602	38607	50 %	0 %	50 %	0 %	15604751
92	NC_000117	CT	3	6	38753	38758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_000117	GA	3	6	39386	39391	50 %	0 %	50 %	0 %	15604752
94	NC_000117	AG	3	6	39523	39528	50 %	0 %	50 %	0 %	15604752
95	NC_000117	AG	3	6	39623	39628	50 %	0 %	50 %	0 %	15604752
96	NC_000117	CT	3	6	40124	40129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_000117	AG	3	6	40600	40605	50 %	0 %	50 %	0 %	15604753
98	NC_000117	GC	3	6	40649	40654	0 %	0 %	50 %	50 %	15604753
99	NC_000117	GA	3	6	40814	40819	50 %	0 %	50 %	0 %	15604753
100	NC_000117	TC	3	6	40823	40828	0 %	50 %	0 %	50 %	15604753
101	NC_000117	GC	3	6	40888	40893	0 %	0 %	50 %	50 %	15604753
102	NC_000117	GA	3	6	41028	41033	50 %	0 %	50 %	0 %	15604753
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104	NC_000117	GA	3	6	42004	42009	50 %	0 %	50 %	0 %	15604754
105	NC_000117	GA	4	8	42014	42021	50 %	0 %	50 %	0 %	15604754
106	NC_000117	AG	3	6	42250	42255	50 %	0 %	50 %	0 %	15604754
107	NC_000117	CT	3	6	42316	42321	0 %	50 %	0 %	50 %	15604755
108	NC_000117	GA	5	10	42592	42601	50 %	0 %	50 %	0 %	15604755
109	NC_000117	AC	3	6	43474	43479	50 %	0 %	0 %	50 %	15604757
110	NC_000117	TC	3	6	43643	43648	0 %	50 %	0 %	50 %	15604757
111	NC_000117	TC	3	6	43808	43813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_000117	TA	3	6	43961	43966	50 %	50 %	0 %	0 %	15604758
113	NC_000117	TC	3	6	44873	44878	0 %	50 %	0 %	50 %	15604759
114	NC_000117	GA	3	6	45356	45361	50 %	0 %	50 %	0 %	15604760
115	NC_000117	TG	3	6	45574	45579	0 %	50 %	50 %	0 %	15604760
116	NC_000117	AG	3	6	45585	45590	50 %	0 %	50 %	0 %	15604760
117	NC_000117	AG	4	8	46026	46033	50 %	0 %	50 %	0 %	15604761
118	NC_000117	CT	3	6	46217	46222	0 %	50 %	0 %	50 %	15604761
119	NC_000117	TG	3	6	46418	46423	0 %	50 %	50 %	0 %	15604761
120	NC_000117	AG	3	6	46471	46476	50 %	0 %	50 %	0 %	15604761
121	NC_000117	AG	3	6	48043	48048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_000117	AG	3	6	49395	49400	50 %	0 %	50 %	0 %	15604763
123	NC_000117	CA	3	6	50061	50066	50 %	0 %	0 %	50 %	15604764
124	NC_000117	TG	4	8	51391	51398	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_000117	TC	3	6	52904	52909	0 %	50 %	0 %	50 %	15604766
126	NC_000117	CA	3	6	52955	52960	50 %	0 %	0 %	50 %	15604766
127	NC_000117	GA	3	6	53376	53381	50 %	0 %	50 %	0 %	15604767
128	NC_000117	CT	3	6	53693	53698	0 %	50 %	0 %	50 %	15604767
129	NC_000117	CT	3	6	54356	54361	0 %	50 %	0 %	50 %	15604768
130	NC_000117	GA	3	6	55601	55606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_000117	AG	3	6	55881	55886	50 %	0 %	50 %	0 %	15604769
132	NC_000117	TG	3	6	57118	57123	0 %	50 %	50 %	0 %	15604769
133	NC_000117	CT	3	6	57999	58004	0 %	50 %	0 %	50 %	15604770
134	NC_000117	GA	3	6	59565	59570	50 %	0 %	50 %	0 %	15604771
135	NC_000117	GT	3	6	59703	59708	0 %	50 %	50 %	0 %	15604771
136	NC_000117	TC	3	6	60451	60456	0 %	50 %	0 %	50 %	15604772
137	NC_000117	GA	3	6	60679	60684	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_000117	CA	3	6	61077	61082	50 %	0 %	0 %	50 %	15604773
139	NC_000117	AT	3	6	61327	61332	50 %	50 %	0 %	0 %	15604773
140	NC_000117	GA	3	6	61350	61355	50 %	0 %	50 %	0 %	15604773
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142	NC_000117	GA	3	6	62291	62296	50 %	0 %	50 %	0 %	15604773
143	NC_000117	GA	3	6	62556	62561	50 %	0 %	50 %	0 %	15604773
144	NC_000117	TC	3	6	62712	62717	0 %	50 %	0 %	50 %	15604773
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