MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 22953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_000117	GAT	2	6	182649	182654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532524891
4002	NC_000117	GA	3	6	182675	182680	50 %	0 %	50 %	0 %	532524891
4003	NC_000117	GCG	2	6	182683	182688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532524891
4004	NC_000117	ACT	2	6	182731	182736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604878
4005	NC_000117	TAG	2	6	182765	182770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604878
4006	NC_000117	TCGC	2	8	182863	182870	0 %	25 %	25 %	50 %	15604878
4007	NC_000117	AGA	2	6	182874	182879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604878
4008	NC_000117	GCA	2	6	182883	182888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604878
4009	NC_000117	TA	3	6	182918	182923	50 %	50 %	0 %	0 %	15604878
4010	NC_000117	GAA	2	6	182953	182958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604878
4011	NC_000117	AGA	2	6	182992	182997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604878
4012	NC_000117	GA	3	6	183031	183036	50 %	0 %	50 %	0 %	15604878
4013	NC_000117	GTT	2	6	183048	183053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604878
4014	NC_000117	GTT	2	6	183083	183088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604878
4015	NC_000117	CTT	2	6	183091	183096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604878
4016	NC_000117	GA	3	6	183134	183139	50 %	0 %	50 %	0 %	15604878
4017	NC_000117	GTT	2	6	183145	183150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604878
4018	NC_000117	GAG	2	6	183166	183171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604878
4019	NC_000117	GAA	2	6	183186	183191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604878
4020	NC_000117	TTG	2	6	183197	183202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604878
4021	NC_000117	AGG	2	6	183236	183241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604878
4022	NC_000117	AGA	2	6	183332	183337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604878
4023	NC_000117	TGA	2	6	183354	183359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604878
4024	NC_000117	CAG	3	9	183427	183435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604878
4025	NC_000117	GTA	2	6	183470	183475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604878
4026	NC_000117	GTTG	2	8	183510	183517	0 %	50 %	50 %	0 %	15604878
4027	NC_000117	GGA	3	9	183525	183533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604878
4028	NC_000117	TC	3	6	183541	183546	0 %	50 %	0 %	50 %	15604878
4029	NC_000117	ATT	2	6	183560	183565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604878
4030	NC_000117	A	7	7	183590	183596	100 %	0 %	0 %	0 %	15604878
4031	NC_000117	T	8	8	183602	183609	0 %	100 %	0 %	0 %	15604878
4032	NC_000117	ATA	2	6	183652	183657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604878
4033	NC_000117	A	6	6	183657	183662	100 %	0 %	0 %	0 %	15604878
4034	NC_000117	TAT	2	6	183733	183738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_000117	GA	3	6	183773	183778	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_000117	AGA	2	6	183815	183820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604879
4037	NC_000117	TGT	2	6	183874	183879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604879
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4039	NC_000117	TTTC	2	8	184016	184023	0 %	75 %	0 %	25 %	15604879
4040	NC_000117	CTG	2	6	184064	184069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604879
4041	NC_000117	GGA	2	6	184091	184096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604879
4042	NC_000117	TAG	2	6	184116	184121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604879
4043	NC_000117	AGT	2	6	184246	184251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604879
4044	NC_000117	ATCG	2	8	184273	184280	25 %	25 %	25 %	25 %	15604879
4045	NC_000117	TCA	2	6	184356	184361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604880
4046	NC_000117	GGA	2	6	184371	184376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604880
4047	NC_000117	AGAGA	2	10	184464	184473	60 %	0 %	40 %	0 %	15604880
4048	NC_000117	GCA	2	6	184560	184565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604880
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4050	NC_000117	GAA	2	6	184926	184931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604880
4051	NC_000117	ATA	2	6	184986	184991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604880
4052	NC_000117	TCTA	2	8	185027	185034	25 %	50 %	0 %	25 %	15604880
4053	NC_000117	GTT	2	6	185095	185100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_000117	TGC	2	6	185228	185233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_000117	CA	3	6	185249	185254	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4056	NC_000117	AGA	2	6	185364	185369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_000117	GTT	4	12	185493	185504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_000117	T	6	6	185510	185515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_000117	T	7	7	185518	185524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_000117	T	6	6	185530	185535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_000117	T	7	7	185580	185586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_000117	A	7	7	185602	185608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_000117	T	6	6	185625	185630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_000117	T	7	7	185720	185726	0 %	100 %	0 %	0 %	15604882
4065	NC_000117	TCT	2	6	185744	185749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604882
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4067	NC_000117	GTC	2	6	185845	185850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604882
4068	NC_000117	ATT	2	6	185915	185920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604882
4069	NC_000117	TCT	2	6	185934	185939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604882
4070	NC_000117	CTT	2	6	185950	185955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604882
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4072	NC_000117	GAA	2	6	186018	186023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604882
4073	NC_000117	AAC	2	6	186095	186100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604882
4074	NC_000117	TA	3	6	186172	186177	50 %	50 %	0 %	0 %	15604882
4075	NC_000117	CTT	2	6	186193	186198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604882
4076	NC_000117	TAG	2	6	186199	186204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604882
4077	NC_000117	CAT	2	6	186243	186248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604882
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4084	NC_000117	ACGAT	2	10	186536	186545	40 %	20 %	20 %	20 %	15604882
4085	NC_000117	TTTA	2	8	186554	186561	25 %	75 %	0 %	0 %	15604882
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4089	NC_000117	A	6	6	186705	186710	100 %	0 %	0 %	0 %	15604882
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4092	NC_000117	T	7	7	186767	186773	0 %	100 %	0 %	0 %	15604882
4093	NC_000117	A	6	6	186808	186813	100 %	0 %	0 %	0 %	15604882
4094	NC_000117	GCT	2	6	186897	186902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604882
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4096	NC_000117	GCTT	2	8	187202	187209	0 %	50 %	25 %	25 %	15604882
4097	NC_000117	TAG	2	6	187240	187245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604882
4098	NC_000117	GAT	2	6	187278	187283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604882
4099	NC_000117	T	7	7	187283	187289	0 %	100 %	0 %	0 %	15604882
4100	NC_000117	TTA	2	6	187313	187318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604882
4101	NC_000117	ATC	2	6	187320	187325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_000117	CGATA	2	10	187348	187357	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4103	NC_000117	T	6	6	187361	187366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_000117	TCC	2	6	187381	187386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4105	NC_000117	ACA	3	9	187387	187395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_000117	AGT	2	6	187405	187410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_000117	AAAC	2	8	187430	187437	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4108	NC_000117	TGC	2	6	187496	187501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_000117	AGT	2	6	187564	187569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_000117	AGT	2	6	187587	187592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_000117	TTG	2	6	187595	187600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_000117	TAT	2	6	187675	187680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_000117	T	6	6	187694	187699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_000117	GCA	2	6	187747	187752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_000117	CTT	2	6	187762	187767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_000117	GGAC	2	8	187789	187796	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4117	NC_000117	AAG	2	6	187899	187904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_000117	TTG	2	6	187921	187926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_000117	CAT	2	6	187931	187936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_000117	T	7	7	187970	187976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_000117	TAA	2	6	188049	188054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_000117	TTG	2	6	188077	188082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_000117	CTC	2	6	188152	188157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604884
4124	NC_000117	CAC	2	6	188198	188203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604884
4125	NC_000117	TAC	2	6	188279	188284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604884
4126	NC_000117	CAT	2	6	188295	188300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604884
4127	NC_000117	GGT	2	6	188342	188347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15604884
4128	NC_000117	CCT	2	6	188403	188408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604884
4129	NC_000117	CCT	2	6	188418	188423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604884
4130	NC_000117	CTC	2	6	188511	188516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604884
4131	NC_000117	TTA	2	6	188535	188540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604884
4132	NC_000117	CGTA	2	8	188558	188565	25 %	25 %	25 %	25 %	15604885
4133	NC_000117	G	9	9	188577	188585	0 %	0 %	100 %	0 %	15604885
4134	NC_000117	TCC	2	6	188611	188616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604885
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4140	NC_000117	CTT	2	6	188673	188678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604885
4141	NC_000117	AGA	2	6	188734	188739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604885
4142	NC_000117	TAAA	2	8	188787	188794	75 %	25 %	0 %	0 %	15604885
4143	NC_000117	CAA	2	6	188867	188872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604885
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4145	NC_000117	CAT	2	6	188910	188915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604885
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4152	NC_000117	AAAG	2	8	189298	189305	75 %	0 %	25 %	0 %	15604885
4153	NC_000117	GAC	2	6	189313	189318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604885
4154	NC_000117	TGA	2	6	189388	189393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604885
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4157	NC_000117	AGAA	2	8	189519	189526	75 %	0 %	25 %	0 %	15604885
4158	NC_000117	GAG	2	6	189542	189547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604885
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4162	NC_000117	AAGC	2	8	189674	189681	50 %	0 %	25 %	25 %	15604885
4163	NC_000117	CAGAT	2	10	189741	189750	40 %	20 %	20 %	20 %	15604885
4164	NC_000117	GTAT	2	8	189753	189760	25 %	50 %	25 %	0 %	15604885
4165	NC_000117	GGA	2	6	189766	189771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604885
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4242	NC_000117	GATTA	2	10	193810	193819	40 %	40 %	20 %	0 %	15604889
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