MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 22953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_000117	TGA	2	6	159421	159426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604861
3502	NC_000117	GAA	2	6	159449	159454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604861
3503	NC_000117	TC	3	6	159484	159489	0 %	50 %	0 %	50 %	15604861
3504	NC_000117	GT	3	6	159522	159527	0 %	50 %	50 %	0 %	15604861
3505	NC_000117	AAT	2	6	159566	159571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604861
3506	NC_000117	GGA	2	6	159578	159583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604861
3507	NC_000117	AGGAA	2	10	159607	159616	60 %	0 %	40 %	0 %	15604861
3508	NC_000117	TAG	2	6	159637	159642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604861
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3510	NC_000117	CTG	2	6	159663	159668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604861
3511	NC_000117	AG	3	6	159694	159699	50 %	0 %	50 %	0 %	15604861
3512	NC_000117	TCT	2	6	159722	159727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604861
3513	NC_000117	AGG	2	6	159841	159846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604861
3514	NC_000117	GAA	2	6	159854	159859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604862
3515	NC_000117	AGA	2	6	159902	159907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604862
3516	NC_000117	ATAC	2	8	160026	160033	50 %	25 %	0 %	25 %	15604862
3517	NC_000117	AGG	2	6	160052	160057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604862
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3524	NC_000117	A	8	8	160360	160367	100 %	0 %	0 %	0 %	15604862
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3534	NC_000117	A	6	6	161284	161289	100 %	0 %	0 %	0 %	15604863
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3540	NC_000117	ATTG	2	8	161476	161483	25 %	50 %	25 %	0 %	15604863
3541	NC_000117	TCT	2	6	161507	161512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604863
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3544	NC_000117	GCTT	2	8	161580	161587	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3545	NC_000117	CAAAA	2	10	161610	161619	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3546	NC_000117	TGT	2	6	161632	161637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_000117	GAG	2	6	161731	161736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_000117	TGG	2	6	161954	161959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15604864
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3553	NC_000117	TTTC	2	8	162167	162174	0 %	75 %	0 %	25 %	15604864
3554	NC_000117	ATCT	2	8	162193	162200	25 %	50 %	0 %	25 %	15604864
3555	NC_000117	CTT	2	6	162218	162223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604864
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3567	NC_000117	TAG	2	6	162695	162700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604864
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3569	NC_000117	AGAGA	2	10	162838	162847	60 %	0 %	40 %	0 %	15604864
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3572	NC_000117	TC	3	6	162899	162904	0 %	50 %	0 %	50 %	15604864
3573	NC_000117	TGT	2	6	163131	163136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604864
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3579	NC_000117	AGCAA	2	10	163273	163282	60 %	0 %	20 %	20 %	15604864
3580	NC_000117	TAC	2	6	163299	163304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604864
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3587	NC_000117	GAT	2	6	163610	163615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604865
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3589	NC_000117	TCAA	2	8	163668	163675	50 %	25 %	0 %	25 %	15604865
3590	NC_000117	CGA	2	6	163677	163682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604865
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3602	NC_000117	GC	3	6	164404	164409	0 %	0 %	50 %	50 %	15604865
3603	NC_000117	GTC	2	6	164435	164440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604865
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3606	NC_000117	A	8	8	164670	164677	100 %	0 %	0 %	0 %	15604865
3607	NC_000117	AGG	2	6	164713	164718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604865
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3609	NC_000117	AG	3	6	164767	164772	50 %	0 %	50 %	0 %	15604865
3610	NC_000117	TGT	2	6	164818	164823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604865
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3612	NC_000117	GA	3	6	164931	164936	50 %	0 %	50 %	0 %	15604865
3613	NC_000117	ATT	2	6	164950	164955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604865
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3616	NC_000117	CTT	2	6	165189	165194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604865
3617	NC_000117	ATCG	2	8	165241	165248	25 %	25 %	25 %	25 %	15604865
3618	NC_000117	TTC	2	6	165254	165259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604865
3619	NC_000117	AG	3	6	165275	165280	50 %	0 %	50 %	0 %	15604865
3620	NC_000117	TCG	2	6	165286	165291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604865
3621	NC_000117	TTCT	2	8	165315	165322	0 %	75 %	0 %	25 %	15604865
3622	NC_000117	G	6	6	165428	165433	0 %	0 %	100 %	0 %	15604865
3623	NC_000117	A	6	6	165503	165508	100 %	0 %	0 %	0 %	15604865
3624	NC_000117	ATT	2	6	165547	165552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604865
3625	NC_000117	T	7	7	165591	165597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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