MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 22953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_000117	TGTTT	2	10	136104	136113	0 %	80 %	20 %	0 %	15604836
3002	NC_000117	GCT	2	6	136117	136122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604836
3003	NC_000117	GGAT	2	8	136132	136139	25 %	25 %	50 %	0 %	15604836
3004	NC_000117	CTG	2	6	136253	136258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604837
3005	NC_000117	CAAT	2	8	136281	136288	50 %	25 %	0 %	25 %	15604837
3006	NC_000117	AAGC	2	8	136335	136342	50 %	0 %	25 %	25 %	15604837
3007	NC_000117	TTTG	2	8	136361	136368	0 %	75 %	25 %	0 %	15604837
3008	NC_000117	GCG	2	6	136404	136409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15604837
3009	NC_000117	CTG	3	9	136426	136434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604837
3010	NC_000117	TTC	2	6	136435	136440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604837
3011	NC_000117	CTG	2	6	136446	136451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604837
3012	NC_000117	AAC	2	6	136457	136462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604837
3013	NC_000117	TTTG	2	8	136476	136483	0 %	75 %	25 %	0 %	15604837
3014	NC_000117	CAG	2	6	136513	136518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604837
3015	NC_000117	GAA	2	6	136548	136553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604837
3016	NC_000117	GCT	2	6	136563	136568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604837
3017	NC_000117	CAG	2	6	136581	136586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604837
3018	NC_000117	AGG	2	6	136592	136597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604837
3019	NC_000117	GAG	2	6	136608	136613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604837
3020	NC_000117	CAC	2	6	136621	136626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604837
3021	NC_000117	GAT	2	6	136704	136709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604837
3022	NC_000117	ATAA	2	8	136710	136717	75 %	25 %	0 %	0 %	15604837
3023	NC_000117	ACA	2	6	136720	136725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604837
3024	NC_000117	AGG	2	6	136781	136786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_000117	CCT	2	6	136791	136796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3026	NC_000117	T	9	9	136798	136806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_000117	TTGCA	2	10	136893	136902	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3028	NC_000117	GAG	2	6	136957	136962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604838
3029	NC_000117	TC	3	6	136967	136972	0 %	50 %	0 %	50 %	15604838
3030	NC_000117	CT	3	6	136996	137001	0 %	50 %	0 %	50 %	15604838
3031	NC_000117	TTC	2	6	137094	137099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604838
3032	NC_000117	CTT	2	6	137144	137149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604838
3033	NC_000117	CT	3	6	137178	137183	0 %	50 %	0 %	50 %	15604838
3034	NC_000117	A	6	6	137228	137233	100 %	0 %	0 %	0 %	15604838
3035	NC_000117	TCT	2	6	137245	137250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604838
3036	NC_000117	CAG	2	6	137339	137344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604838
3037	NC_000117	AG	3	6	137343	137348	50 %	0 %	50 %	0 %	15604838
3038	NC_000117	GAA	2	6	137384	137389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604838
3039	NC_000117	TTCT	2	8	137391	137398	0 %	75 %	0 %	25 %	15604838
3040	NC_000117	AATT	2	8	137417	137424	50 %	50 %	0 %	0 %	15604838
3041	NC_000117	AAG	2	6	137529	137534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604838
3042	NC_000117	CAA	2	6	137567	137572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604838
3043	NC_000117	GCT	2	6	137629	137634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604838
3044	NC_000117	AAG	2	6	137657	137662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604838
3045	NC_000117	TTG	2	6	137847	137852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604839
3046	NC_000117	ATGT	2	8	137997	138004	25 %	50 %	25 %	0 %	15604839
3047	NC_000117	AGG	2	6	138014	138019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604839
3048	NC_000117	AAT	2	6	138047	138052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604839
3049	NC_000117	CTT	2	6	138070	138075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_000117	GA	3	6	138144	138149	50 %	0 %	50 %	0 %	15604840
3051	NC_000117	A	6	6	138160	138165	100 %	0 %	0 %	0 %	15604840
3052	NC_000117	TAT	2	6	138189	138194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604840
3053	NC_000117	AGA	2	6	138237	138242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604840
3054	NC_000117	ATGG	2	8	138274	138281	25 %	25 %	50 %	0 %	15604840
3055	NC_000117	GTT	2	6	138316	138321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604840
3056	NC_000117	ATT	2	6	138463	138468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604840
3057	NC_000117	TC	3	6	138509	138514	0 %	50 %	0 %	50 %	15604840
3058	NC_000117	AGAA	2	8	138624	138631	75 %	0 %	25 %	0 %	15604840
3059	NC_000117	GAAG	2	8	138670	138677	50 %	0 %	50 %	0 %	15604840
3060	NC_000117	TTGA	2	8	138682	138689	25 %	50 %	25 %	0 %	15604840
3061	NC_000117	GGT	2	6	138697	138702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15604840
3062	NC_000117	CCT	2	6	138761	138766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604840
3063	NC_000117	T	7	7	138768	138774	0 %	100 %	0 %	0 %	15604840
3064	NC_000117	GAAA	2	8	138795	138802	75 %	0 %	25 %	0 %	15604840
3065	NC_000117	GAA	2	6	138823	138828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604840
3066	NC_000117	AGT	2	6	138892	138897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604841
3067	NC_000117	TTA	2	6	138936	138941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604841
3068	NC_000117	GA	3	6	138980	138985	50 %	0 %	50 %	0 %	15604841
3069	NC_000117	AAG	2	6	139011	139016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604841
3070	NC_000117	T	6	6	139188	139193	0 %	100 %	0 %	0 %	15604841
3071	NC_000117	AGG	2	6	139267	139272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604841
3072	NC_000117	A	6	6	139277	139282	100 %	0 %	0 %	0 %	15604841
3073	NC_000117	TTA	2	6	139341	139346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604841
3074	NC_000117	TAA	2	6	139444	139449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604842
3075	NC_000117	GAGTTA	2	12	139484	139495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604842
3076	NC_000117	AAGA	2	8	139566	139573	75 %	0 %	25 %	0 %	15604842
3077	NC_000117	AG	3	6	139615	139620	50 %	0 %	50 %	0 %	15604842
3078	NC_000117	GAA	2	6	139627	139632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604842
3079	NC_000117	TTA	2	6	139722	139727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604842
3080	NC_000117	GTT	2	6	139757	139762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604842
3081	NC_000117	AGA	2	6	139822	139827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604842
3082	NC_000117	TCCAG	2	10	139849	139858	20 %	20 %	20 %	40 %	15604842
3083	NC_000117	GAA	2	6	139900	139905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604843
3084	NC_000117	ATTG	2	8	139909	139916	25 %	50 %	25 %	0 %	15604843
3085	NC_000117	ATT	2	6	139943	139948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604843
3086	NC_000117	AAG	2	6	140004	140009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604843
3087	NC_000117	CTT	2	6	140021	140026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604843
3088	NC_000117	GCA	2	6	140060	140065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604843
3089	NC_000117	CCTA	2	8	140070	140077	25 %	25 %	0 %	50 %	15604843
3090	NC_000117	GCT	2	6	140096	140101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604843
3091	NC_000117	TCA	2	6	140361	140366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604843
3092	NC_000117	TAA	2	6	140470	140475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604843
3093	NC_000117	GTACA	2	10	140580	140589	40 %	20 %	20 %	20 %	15604843
3094	NC_000117	AGA	2	6	140611	140616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604843
3095	NC_000117	GAA	2	6	140795	140800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604843
3096	NC_000117	TAA	2	6	140929	140934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604843
3097	NC_000117	TAGAT	2	10	140953	140962	40 %	40 %	20 %	0 %	15604843
3098	NC_000117	TAT	2	6	140963	140968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604843
3099	NC_000117	CTCC	2	8	140969	140976	0 %	25 %	0 %	75 %	15604843
3100	NC_000117	CTG	2	6	140985	140990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604843
3101	NC_000117	CCT	2	6	141029	141034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604843
3102	NC_000117	TAT	2	6	141035	141040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604843
3103	NC_000117	TGG	2	6	141130	141135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15604843
3104	NC_000117	TCA	2	6	141157	141162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604843
3105	NC_000117	TCT	2	6	141187	141192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604843
3106	NC_000117	ATTA	2	8	141206	141213	50 %	50 %	0 %	0 %	15604843
3107	NC_000117	T	8	8	141275	141282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_000117	T	6	6	141320	141325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_000117	AAG	2	6	141329	141334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_000117	AAAAG	2	10	141365	141374	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_000117	T	6	6	141389	141394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_000117	GCT	2	6	141425	141430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_000117	A	6	6	141441	141446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_000117	ATC	2	6	141449	141454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_000117	A	6	6	141498	141503	100 %	0 %	0 %	0 %	15604844
3116	NC_000117	CTC	2	6	141648	141653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604844
3117	NC_000117	AAAAC	2	10	141845	141854	80 %	0 %	0 %	20 %	15604844
3118	NC_000117	AGA	2	6	141999	142004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604845
3119	NC_000117	TGGAAA	2	12	142037	142048	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15604845
3120	NC_000117	GGA	2	6	142173	142178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604845
3121	NC_000117	AGAA	2	8	142237	142244	75 %	0 %	25 %	0 %	15604845
3122	NC_000117	CTT	2	6	142274	142279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604845
3123	NC_000117	AAGA	2	8	142296	142303	75 %	0 %	25 %	0 %	15604845
3124	NC_000117	A	6	6	142308	142313	100 %	0 %	0 %	0 %	15604845
3125	NC_000117	AT	3	6	142376	142381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_000117	CTT	2	6	142403	142408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_000117	AAG	2	6	142413	142418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604846
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