MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 22953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_000117	GA	3	6	70059	70064	50 %	0 %	50 %	0 %	15604779
1502	NC_000117	CTCTT	2	10	70065	70074	0 %	60 %	0 %	40 %	15604779
1503	NC_000117	AGAA	2	8	70077	70084	75 %	0 %	25 %	0 %	15604779
1504	NC_000117	TGA	2	6	70105	70110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604779
1505	NC_000117	TTG	2	6	70194	70199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604779
1506	NC_000117	TCT	2	6	70217	70222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604779
1507	NC_000117	GA	3	6	70258	70263	50 %	0 %	50 %	0 %	15604779
1508	NC_000117	AGCT	2	8	70299	70306	25 %	25 %	25 %	25 %	15604779
1509	NC_000117	TGA	2	6	70345	70350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604779
1510	NC_000117	GCAT	2	8	70360	70367	25 %	25 %	25 %	25 %	15604779
1511	NC_000117	AGA	2	6	70378	70383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604779
1512	NC_000117	GT	3	6	70534	70539	0 %	50 %	50 %	0 %	15604779
1513	NC_000117	CT	3	6	70615	70620	0 %	50 %	0 %	50 %	15604779
1514	NC_000117	GA	3	6	70636	70641	50 %	0 %	50 %	0 %	15604779
1515	NC_000117	AGT	2	6	70678	70683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604779
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1517	NC_000117	AAGAA	2	10	70753	70762	80 %	0 %	20 %	0 %	15604779
1518	NC_000117	AGA	2	6	70825	70830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604779
1519	NC_000117	TGA	2	6	70861	70866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604779
1520	NC_000117	TAT	2	6	70872	70877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604779
1521	NC_000117	T	6	6	70961	70966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_000117	T	8	8	70982	70989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_000117	CAT	2	6	71047	71052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604780
1524	NC_000117	CCTT	2	8	71076	71083	0 %	50 %	0 %	50 %	15604780
1525	NC_000117	GCTT	2	8	71106	71113	0 %	50 %	25 %	25 %	15604780
1526	NC_000117	A	6	6	71201	71206	100 %	0 %	0 %	0 %	15604780
1527	NC_000117	ATT	2	6	71251	71256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604780
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1530	NC_000117	TTCT	2	8	71444	71451	0 %	75 %	0 %	25 %	15604780
1531	NC_000117	ATG	2	6	71456	71461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604780
1532	NC_000117	GCTT	2	8	71490	71497	0 %	50 %	25 %	25 %	15604780
1533	NC_000117	AGA	2	6	71499	71504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604780
1534	NC_000117	GAGC	2	8	71518	71525	25 %	0 %	50 %	25 %	15604780
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1536	NC_000117	A	7	7	71550	71556	100 %	0 %	0 %	0 %	15604780
1537	NC_000117	CTATTT	2	12	71561	71572	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15604780
1538	NC_000117	TGA	2	6	71595	71600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604780
1539	NC_000117	ATG	2	6	71633	71638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604780
1540	NC_000117	AGA	2	6	71763	71768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_000117	CT	3	6	71771	71776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1542	NC_000117	CGT	2	6	71811	71816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_000117	T	7	7	71816	71822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_000117	CTTGC	2	10	71842	71851	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1545	NC_000117	GATA	2	8	71866	71873	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_000117	TTC	2	6	71957	71962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604781
1547	NC_000117	CTT	2	6	72025	72030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604781
1548	NC_000117	ATTGG	2	10	72043	72052	20 %	40 %	40 %	0 %	15604781
1549	NC_000117	T	6	6	72059	72064	0 %	100 %	0 %	0 %	15604781
1550	NC_000117	AGC	2	6	72074	72079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604781
1551	NC_000117	TTG	2	6	72103	72108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604781
1552	NC_000117	ATA	2	6	72187	72192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604781
1553	NC_000117	GCT	2	6	72207	72212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604781
1554	NC_000117	GCTA	2	8	72216	72223	25 %	25 %	25 %	25 %	15604781
1555	NC_000117	AAT	2	6	72246	72251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604781
1556	NC_000117	TGG	2	6	72277	72282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15604781
1557	NC_000117	T	6	6	72284	72289	0 %	100 %	0 %	0 %	15604781
1558	NC_000117	AGC	2	6	72346	72351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604781
1559	NC_000117	TTAT	2	8	72392	72399	25 %	75 %	0 %	0 %	15604781
1560	NC_000117	TGC	2	6	72400	72405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604781
1561	NC_000117	TGT	2	6	72443	72448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604781
1562	NC_000117	GGAG	2	8	72459	72466	25 %	0 %	75 %	0 %	15604781
1563	NC_000117	GATT	2	8	72494	72501	25 %	50 %	25 %	0 %	15604781
1564	NC_000117	GAA	2	6	72569	72574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604781
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1569	NC_000117	TGA	2	6	72728	72733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604781
1570	NC_000117	GAA	2	6	72761	72766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604781
1571	NC_000117	T	6	6	72843	72848	0 %	100 %	0 %	0 %	15604781
1572	NC_000117	TAG	2	6	72883	72888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604781
1573	NC_000117	TAG	2	6	72892	72897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604781
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1578	NC_000117	A	7	7	73121	73127	100 %	0 %	0 %	0 %	15604781
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1584	NC_000117	TAC	2	6	73325	73330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604782
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1588	NC_000117	TAT	2	6	73473	73478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604782
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1593	NC_000117	AGG	2	6	73685	73690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604782
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1598	NC_000117	ATT	2	6	73998	74003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604782
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1600	NC_000117	AAG	2	6	74101	74106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604782
1601	NC_000117	TGC	2	6	74179	74184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604782
1602	NC_000117	TC	3	6	74194	74199	0 %	50 %	0 %	50 %	15604782
1603	NC_000117	TCA	2	6	74288	74293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604782
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1607	NC_000117	AAG	2	6	74604	74609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_000117	ACT	2	6	74619	74624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_000117	T	6	6	74630	74635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_000117	AGT	2	6	74655	74660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_000117	CAA	2	6	74681	74686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604783
1612	NC_000117	T	6	6	74739	74744	0 %	100 %	0 %	0 %	15604783
1613	NC_000117	CCA	2	6	74782	74787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604783
1614	NC_000117	TC	3	6	74828	74833	0 %	50 %	0 %	50 %	15604783
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1621	NC_000117	T	6	6	75319	75324	0 %	100 %	0 %	0 %	15604783
1622	NC_000117	GAC	2	6	75327	75332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604783
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