MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 22953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_000117	A	6	6	47304	47309	100 %	0 %	0 %	0 %	15604761
1002	NC_000117	GAA	2	6	47316	47321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604761
1003	NC_000117	ATGG	2	8	47365	47372	25 %	25 %	50 %	0 %	15604761
1004	NC_000117	AGGA	2	8	47396	47403	50 %	0 %	50 %	0 %	15604761
1005	NC_000117	GTT	2	6	47425	47430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604761
1006	NC_000117	GGT	2	6	47434	47439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15604761
1007	NC_000117	T	6	6	47443	47448	0 %	100 %	0 %	0 %	15604761
1008	NC_000117	ATA	2	6	47451	47456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604761
1009	NC_000117	AGA	2	6	47804	47809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604761
1010	NC_000117	CTG	2	6	47861	47866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604761
1011	NC_000117	GAA	2	6	47874	47879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604761
1012	NC_000117	GAAC	2	8	47943	47950	50 %	0 %	25 %	25 %	15604761
1013	NC_000117	AAGT	2	8	47978	47985	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_000117	TAA	2	6	47987	47992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_000117	GAA	2	6	48003	48008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_000117	GAAGA	2	10	48011	48020	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_000117	AG	3	6	48043	48048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_000117	TGT	2	6	48062	48067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_000117	CTG	2	6	48097	48102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604762
1020	NC_000117	GAG	2	6	48103	48108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604762
1021	NC_000117	TCC	2	6	48116	48121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604762
1022	NC_000117	AACA	2	8	48187	48194	75 %	0 %	0 %	25 %	15604762
1023	NC_000117	TAG	2	6	48304	48309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604762
1024	NC_000117	CCA	2	6	48324	48329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604762
1025	NC_000117	AAC	2	6	48360	48365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604762
1026	NC_000117	CTT	2	6	48384	48389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604762
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1029	NC_000117	CAA	2	6	48484	48489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604762
1030	NC_000117	TAT	2	6	48502	48507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604762
1031	NC_000117	T	6	6	48552	48557	0 %	100 %	0 %	0 %	15604762
1032	NC_000117	T	8	8	48608	48615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_000117	GTC	2	6	48740	48745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_000117	AAG	2	6	48762	48767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_000117	TAT	2	6	48791	48796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_000117	T	8	8	48885	48892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_000117	A	6	6	48936	48941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_000117	T	6	6	49046	49051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_000117	TGT	2	6	49053	49058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604763
1040	NC_000117	GAA	2	6	49094	49099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604763
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1042	NC_000117	GTG	2	6	49180	49185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15604763
1043	NC_000117	AAC	2	6	49202	49207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604763
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1048	NC_000117	GTAG	2	8	49286	49293	25 %	25 %	50 %	0 %	15604763
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1051	NC_000117	AG	3	6	49395	49400	50 %	0 %	50 %	0 %	15604763
1052	NC_000117	AGA	2	6	49561	49566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_000117	CTATT	2	10	49590	49599	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1054	NC_000117	AAG	2	6	49623	49628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_000117	TCT	2	6	49637	49642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_000117	ACT	2	6	49678	49683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_000117	T	7	7	49698	49704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_000117	AAT	2	6	49713	49718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_000117	TGT	2	6	49735	49740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_000117	GCC	2	6	49782	49787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_000117	ATT	2	6	49831	49836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_000117	CAA	2	6	49850	49855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_000117	TTC	2	6	49924	49929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604764
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1068	NC_000117	CTTTT	2	10	50041	50050	0 %	80 %	0 %	20 %	15604764
1069	NC_000117	CA	3	6	50061	50066	50 %	0 %	0 %	50 %	15604764
1070	NC_000117	A	6	6	50074	50079	100 %	0 %	0 %	0 %	15604764
1071	NC_000117	TTC	2	6	50083	50088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604764
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1093	NC_000117	TTCA	2	8	51136	51143	25 %	50 %	0 %	25 %	15604764
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1098	NC_000117	TAA	2	6	51408	51413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_000117	T	6	6	51432	51437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_000117	AGT	3	9	51476	51484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_000117	GCA	2	6	51532	51537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604765
1102	NC_000117	CTG	2	6	51547	51552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604765
1103	NC_000117	GTA	2	6	51564	51569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604765
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1106	NC_000117	AAG	2	6	51630	51635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604765
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1109	NC_000117	A	6	6	51708	51713	100 %	0 %	0 %	0 %	15604765
1110	NC_000117	AAG	2	6	51738	51743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604765
1111	NC_000117	A	7	7	51768	51774	100 %	0 %	0 %	0 %	15604765
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1113	NC_000117	AAG	2	6	51846	51851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604765
1114	NC_000117	A	7	7	51876	51882	100 %	0 %	0 %	0 %	15604765
1115	NC_000117	AGC	2	6	51887	51892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604765
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1117	NC_000117	A	7	7	51926	51932	100 %	0 %	0 %	0 %	15604765
1118	NC_000117	A	6	6	51966	51971	100 %	0 %	0 %	0 %	15604765
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1121	NC_000117	GAT	2	6	52129	52134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_000117	T	6	6	52173	52178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_000117	TATT	2	8	52180	52187	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_000117	AAG	2	6	52207	52212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_000117	AAT	2	6	52234	52239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_000117	ATT	2	6	52246	52251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_000117	CTA	2	6	52304	52309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604766
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1129	NC_000117	GTGATT	2	12	52348	52359	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15604766
1130	NC_000117	GGAA	2	8	52411	52418	50 %	0 %	50 %	0 %	15604766
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1132	NC_000117	CAA	2	6	52447	52452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604766
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