MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 22953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_000117	GGTT	2	8	23094	23101	0 %	50 %	50 %	0 %	15604737
502	NC_000117	TGC	2	6	23120	23125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604737
503	NC_000117	ATT	2	6	23172	23177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604737
504	NC_000117	AAT	2	6	23214	23219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604737
505	NC_000117	TTG	2	6	23277	23282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604737
506	NC_000117	TTCT	2	8	23464	23471	0 %	75 %	0 %	25 %	15604737
507	NC_000117	TGC	2	6	23528	23533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604737
508	NC_000117	TAAC	2	8	23566	23573	50 %	25 %	0 %	25 %	15604737
509	NC_000117	GCA	2	6	23634	23639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604737
510	NC_000117	CATT	2	8	23689	23696	25 %	50 %	0 %	25 %	15604737
511	NC_000117	AGA	2	6	23708	23713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604737
512	NC_000117	GAG	2	6	23731	23736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604737
513	NC_000117	TTC	2	6	23794	23799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604737
514	NC_000117	GGAAA	2	10	23807	23816	60 %	0 %	40 %	0 %	15604737
515	NC_000117	GA	3	6	23830	23835	50 %	0 %	50 %	0 %	15604737
516	NC_000117	GA	3	6	23922	23927	50 %	0 %	50 %	0 %	15604737
517	NC_000117	AGG	2	6	23929	23934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604737
518	NC_000117	GAA	2	6	24053	24058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604737
519	NC_000117	GGTA	2	8	24059	24066	25 %	25 %	50 %	0 %	15604737
520	NC_000117	GTT	2	6	24147	24152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604737
521	NC_000117	CTT	2	6	24241	24246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604737
522	NC_000117	AG	3	6	24303	24308	50 %	0 %	50 %	0 %	15604737
523	NC_000117	TAA	2	6	24314	24319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604737
524	NC_000117	GAA	2	6	24334	24339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604737
525	NC_000117	AAG	2	6	24475	24480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604737
526	NC_000117	A	7	7	24560	24566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_000117	TTA	2	6	24573	24578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_000117	T	9	9	24588	24596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_000117	T	6	6	24620	24625	0 %	100 %	0 %	0 %	15604738
530	NC_000117	AGA	2	6	24747	24752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604738
531	NC_000117	TAA	2	6	24879	24884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604738
532	NC_000117	GGA	3	9	24911	24919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604738
533	NC_000117	GAT	2	6	24956	24961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604738
534	NC_000117	TTCG	2	8	25199	25206	0 %	50 %	25 %	25 %	15604738
535	NC_000117	TAGG	2	8	25278	25285	25 %	25 %	50 %	0 %	15604738
536	NC_000117	TGT	2	6	25369	25374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604738
537	NC_000117	TTA	2	6	25379	25384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604738
538	NC_000117	TTCC	2	8	25402	25409	0 %	50 %	0 %	50 %	15604738
539	NC_000117	TAG	2	6	25440	25445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604738
540	NC_000117	GTGAGG	2	12	25474	25485	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	15604738
541	NC_000117	TAGG	2	8	25516	25523	25 %	25 %	50 %	0 %	15604738
542	NC_000117	AGAGG	2	10	25532	25541	40 %	0 %	60 %	0 %	15604738
543	NC_000117	AGC	2	6	25558	25563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604738
544	NC_000117	T	6	6	25567	25572	0 %	100 %	0 %	0 %	15604738
545	NC_000117	T	6	6	25598	25603	0 %	100 %	0 %	0 %	15604738
546	NC_000117	AAG	2	6	25704	25709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604738
547	NC_000117	GA	3	6	25720	25725	50 %	0 %	50 %	0 %	15604738
548	NC_000117	GT	3	6	25740	25745	0 %	50 %	50 %	0 %	15604738
549	NC_000117	TA	3	6	25942	25947	50 %	50 %	0 %	0 %	15604738
550	NC_000117	T	6	6	25951	25956	0 %	100 %	0 %	0 %	15604738
551	NC_000117	GAT	2	6	25963	25968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604738
552	NC_000117	TGT	2	6	26098	26103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604738
553	NC_000117	TAG	2	6	26136	26141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604738
554	NC_000117	A	6	6	26195	26200	100 %	0 %	0 %	0 %	15604738
555	NC_000117	GCA	2	6	26210	26215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604738
556	NC_000117	T	6	6	26271	26276	0 %	100 %	0 %	0 %	15604738
557	NC_000117	GCTT	2	8	26288	26295	0 %	50 %	25 %	25 %	15604738
558	NC_000117	CTT	2	6	26358	26363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604738
559	NC_000117	GA	3	6	26388	26393	50 %	0 %	50 %	0 %	15604738
560	NC_000117	GAA	2	6	26423	26428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604738
561	NC_000117	GAA	2	6	26430	26435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604738
562	NC_000117	CGA	2	6	26438	26443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604738
563	NC_000117	GA	3	6	26512	26517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
564	NC_000117	CT	3	6	26519	26524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
565	NC_000117	ACT	2	6	26527	26532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_000117	A	6	6	26543	26548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_000117	T	7	7	26555	26561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_000117	AGG	3	9	26696	26704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604739
569	NC_000117	TAA	2	6	26732	26737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604739
570	NC_000117	AT	3	6	26805	26810	50 %	50 %	0 %	0 %	15604739
571	NC_000117	T	7	7	26818	26824	0 %	100 %	0 %	0 %	15604739
572	NC_000117	GAA	2	6	26836	26841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604739
573	NC_000117	GGAA	2	8	26871	26878	50 %	0 %	50 %	0 %	15604739
574	NC_000117	TTAA	2	8	26944	26951	50 %	50 %	0 %	0 %	15604739
575	NC_000117	AAAG	2	8	26994	27001	75 %	0 %	25 %	0 %	15604739
576	NC_000117	GA	3	6	27019	27024	50 %	0 %	50 %	0 %	15604739
577	NC_000117	T	7	7	27093	27099	0 %	100 %	0 %	0 %	15604739
578	NC_000117	TTC	2	6	27124	27129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604739
579	NC_000117	CTA	2	6	27143	27148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604739
580	NC_000117	T	8	8	27150	27157	0 %	100 %	0 %	0 %	15604739
581	NC_000117	GAA	2	6	27208	27213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604739
582	NC_000117	GGGC	2	8	27274	27281	0 %	0 %	75 %	25 %	15604739
583	NC_000117	T	6	6	27290	27295	0 %	100 %	0 %	0 %	15604739
584	NC_000117	TGA	2	6	27303	27308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604739
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586	NC_000117	GGATA	2	10	27337	27346	40 %	20 %	40 %	0 %	15604739
587	NC_000117	A	7	7	27361	27367	100 %	0 %	0 %	0 %	15604739
588	NC_000117	AAG	2	6	27378	27383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604739
589	NC_000117	T	6	6	27398	27403	0 %	100 %	0 %	0 %	15604739
590	NC_000117	A	8	8	27495	27502	100 %	0 %	0 %	0 %	15604740
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593	NC_000117	CAGA	2	8	27579	27586	50 %	0 %	25 %	25 %	15604740
594	NC_000117	TTC	2	6	27657	27662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604740
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596	NC_000117	TTC	2	6	27772	27777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604740
597	NC_000117	AAG	2	6	27786	27791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604740
598	NC_000117	AAG	2	6	27804	27809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604740
599	NC_000117	A	6	6	27810	27815	100 %	0 %	0 %	0 %	15604740
600	NC_000117	T	7	7	27869	27875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_000117	TAA	2	6	27880	27885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_000117	TC	3	6	27887	27892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
603	NC_000117	ATTG	2	8	27938	27945	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
604	NC_000117	AG	3	6	27970	27975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_000117	AGA	2	6	27992	27997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_000117	GAA	2	6	28042	28047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604741
607	NC_000117	ATCCG	2	10	28062	28071	20 %	20 %	20 %	40 %	15604741
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611	NC_000117	GAT	3	9	28318	28326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604741
612	NC_000117	GAG	2	6	28361	28366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604741
613	NC_000117	TG	3	6	28393	28398	0 %	50 %	50 %	0 %	15604741
614	NC_000117	GCA	2	6	28417	28422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604741
615	NC_000117	TC	3	6	28446	28451	0 %	50 %	0 %	50 %	15604741
616	NC_000117	AGGGT	2	10	28580	28589	20 %	20 %	60 %	0 %	15604741
617	NC_000117	TTC	2	6	28616	28621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604741
618	NC_000117	CAG	2	6	28628	28633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604741
619	NC_000117	GAA	2	6	28642	28647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604741
620	NC_000117	TGA	2	6	28656	28661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604741
621	NC_000117	TTC	2	6	28689	28694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604741
622	NC_000117	GC	4	8	28860	28867	0 %	0 %	50 %	50 %	15604741
623	NC_000117	AAG	2	6	28868	28873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604741
624	NC_000117	TA	3	6	28982	28987	50 %	50 %	0 %	0 %	15604741
625	NC_000117	GAA	2	6	29071	29076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604741
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627	NC_000117	TCT	2	6	29171	29176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604742
628	NC_000117	ACA	2	6	29399	29404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604742
629	NC_000117	ATG	2	6	29409	29414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604742
630	NC_000117	CTTT	2	8	29551	29558	0 %	75 %	0 %	25 %	15604742
631	NC_000117	TTTG	2	8	29566	29573	0 %	75 %	25 %	0 %	15604742
632	NC_000117	TTGT	2	8	29601	29608	0 %	75 %	25 %	0 %	15604742
633	NC_000117	CCTAT	2	10	29620	29629	20 %	40 %	0 %	40 %	15604742
634	NC_000117	T	6	6	29636	29641	0 %	100 %	0 %	0 %	15604742
635	NC_000117	ATC	2	6	29715	29720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604742
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764	NC_000117	CTT	2	6	36478	36483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
765	NC_000117	AT	3	6	36486	36491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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