MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 22953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_000117	ATGG	2	8	274143	274150	25 %	25 %	50 %	0 %	15604966
6003	NC_000117	TCTT	2	8	274222	274229	0 %	75 %	0 %	25 %	15604966
6004	NC_000117	ATTT	2	8	274251	274258	25 %	75 %	0 %	0 %	15604966
6005	NC_000117	CAC	2	6	274289	274294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604966
6006	NC_000117	CAA	2	6	274298	274303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604966
6007	NC_000117	TAT	2	6	274315	274320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604966
6008	NC_000117	TCT	2	6	274402	274407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604966
6009	NC_000117	ATCCT	2	10	274416	274425	20 %	40 %	0 %	40 %	15604966
6010	NC_000117	GAT	2	6	274469	274474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604966
6011	NC_000117	AGA	2	6	274564	274569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604966
6012	NC_000117	TGA	2	6	274628	274633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604967
6013	NC_000117	AGGAG	2	10	274667	274676	40 %	0 %	60 %	0 %	15604967
6014	NC_000117	GCT	2	6	274767	274772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604967
6015	NC_000117	TGGAAT	2	12	274778	274789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604967
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6017	NC_000117	ATT	2	6	274818	274823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604967
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6019	NC_000117	TGC	2	6	274853	274858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604967
6020	NC_000117	GCA	2	6	274878	274883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604967
6021	NC_000117	TAT	2	6	274890	274895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604967
6022	NC_000117	GCT	2	6	274947	274952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604967
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6027	NC_000117	GCT	2	6	275241	275246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604967
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6030	NC_000117	ACGA	2	8	275294	275301	50 %	0 %	25 %	25 %	15604967
6031	NC_000117	CTC	2	6	275325	275330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604967
6032	NC_000117	A	7	7	275340	275346	100 %	0 %	0 %	0 %	15604967
6033	NC_000117	TTGTC	2	10	275354	275363	0 %	60 %	20 %	20 %	15604967
6034	NC_000117	GAA	2	6	275367	275372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604967
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6039	NC_000117	ATA	2	6	275488	275493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604967
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6042	NC_000117	TGGT	2	8	275727	275734	0 %	50 %	50 %	0 %	15604968
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6046	NC_000117	TGT	2	6	275853	275858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604968
6047	NC_000117	A	6	6	275886	275891	100 %	0 %	0 %	0 %	15604968
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6050	NC_000117	ACC	2	6	275958	275963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604968
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6052	NC_000117	CT	3	6	276055	276060	0 %	50 %	0 %	50 %	15604968
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6055	NC_000117	CTC	2	6	276116	276121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604968
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6063	NC_000117	AATT	2	8	276390	276397	50 %	50 %	0 %	0 %	15604968
6064	NC_000117	ATT	2	6	276424	276429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604968
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6109	NC_000117	CAT	2	6	278648	278653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604969
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6112	NC_000117	TCT	2	6	278864	278869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604969
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6120	NC_000117	ACC	2	6	279170	279175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604969
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6122	NC_000117	GAG	2	6	279242	279247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604969
6123	NC_000117	GCTT	2	8	279283	279290	0 %	50 %	25 %	25 %	15604969
6124	NC_000117	GTTT	2	8	279350	279357	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6126	NC_000117	AAAG	2	8	279385	279392	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6246	NC_000117	TC	4	8	284930	284937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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