MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 22953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_000117	AGA	2	6	251571	251576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604944
5503	NC_000117	ACA	2	6	251603	251608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604944
5504	NC_000117	TC	3	6	251645	251650	0 %	50 %	0 %	50 %	15604944
5505	NC_000117	TTG	2	6	251702	251707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604944
5506	NC_000117	TCT	2	6	251724	251729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604944
5507	NC_000117	CAA	2	6	251781	251786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604944
5508	NC_000117	AGA	3	9	251854	251862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604944
5509	NC_000117	GGC	2	6	251865	251870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15604944
5510	NC_000117	ACA	2	6	251895	251900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604944
5511	NC_000117	CAC	2	6	251902	251907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604944
5512	NC_000117	CAG	2	6	251908	251913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604944
5513	NC_000117	T	8	8	251977	251984	0 %	100 %	0 %	0 %	15604944
5514	NC_000117	TCC	2	6	252068	252073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5515	NC_000117	GAAA	2	8	252089	252096	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_000117	T	7	7	252110	252116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_000117	GCAG	2	8	252138	252145	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5518	NC_000117	AGAA	2	8	252171	252178	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_000117	AG	3	6	252213	252218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_000117	TAT	2	6	252236	252241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_000117	ACA	2	6	252277	252282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_000117	A	6	6	252326	252331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_000117	TTG	2	6	252506	252511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604945
5524	NC_000117	TCT	2	6	252528	252533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604945
5525	NC_000117	TC	3	6	252575	252580	0 %	50 %	0 %	50 %	15604945
5526	NC_000117	T	7	7	252611	252617	0 %	100 %	0 %	0 %	15604945
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5532	NC_000117	CCA	2	6	252838	252843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604945
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5534	NC_000117	CCCA	2	8	252994	253001	25 %	0 %	0 %	75 %	15604946
5535	NC_000117	CTT	2	6	253123	253128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604946
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5545	NC_000117	A	6	6	253399	253404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_000117	TAA	2	6	253450	253455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5565	NC_000117	TA	3	6	254019	254024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5567	NC_000117	A	7	7	254078	254084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5576	NC_000117	A	7	7	254519	254525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5578	NC_000117	AACCCT	2	12	254578	254589	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5594	NC_000117	GAG	2	6	255501	255506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5609	NC_000117	CAG	2	6	255942	255947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604950
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5615	NC_000117	ATA	2	6	256214	256219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_000117	AAT	2	6	256238	256243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_000117	AG	3	6	256300	256305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_000117	A	8	8	256318	256325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_000117	TC	3	6	256326	256331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5620	NC_000117	TC	3	6	256412	256417	0 %	50 %	0 %	50 %	15604951
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6000	NC_000117	TCCCT	2	10	274112	274121	0 %	40 %	0 %	60 %	15604966

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