MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 22953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_000117	AGA	2	6	205841	205846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604903
4502	NC_000117	TTG	2	6	205897	205902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604903
4503	NC_000117	GATG	2	8	205918	205925	25 %	25 %	50 %	0 %	15604903
4504	NC_000117	ATTC	2	8	205991	205998	25 %	50 %	0 %	25 %	15604903
4505	NC_000117	GCT	2	6	206001	206006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604903
4506	NC_000117	CAA	3	9	206050	206058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604904
4507	NC_000117	T	6	6	206061	206066	0 %	100 %	0 %	0 %	15604904
4508	NC_000117	A	6	6	206083	206088	100 %	0 %	0 %	0 %	15604904
4509	NC_000117	CT	3	6	206160	206165	0 %	50 %	0 %	50 %	15604904
4510	NC_000117	TAT	2	6	206193	206198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604904
4511	NC_000117	AGT	2	6	206220	206225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604904
4512	NC_000117	GA	4	8	206510	206517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_000117	T	7	7	206540	206546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_000117	CT	4	8	206558	206565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4515	NC_000117	A	6	6	206567	206572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_000117	GAA	2	6	206601	206606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161723223
4517	NC_000117	TCC	2	6	206639	206644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161723223
4518	NC_000117	AGGA	2	8	206722	206729	50 %	0 %	50 %	0 %	161723223
4519	NC_000117	TTTG	2	8	206745	206752	0 %	75 %	25 %	0 %	161723223
4520	NC_000117	GAA	2	6	206796	206801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161723223
4521	NC_000117	TC	3	6	206824	206829	0 %	50 %	0 %	50 %	161723223
4522	NC_000117	ACC	2	6	206884	206889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161723223
4523	NC_000117	CAA	2	6	206952	206957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161723223
4524	NC_000117	T	6	6	206980	206985	0 %	100 %	0 %	0 %	161723223
4525	NC_000117	ACC	2	6	206996	207001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161723223
4526	NC_000117	ATT	2	6	207004	207009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161723223
4527	NC_000117	ATC	2	6	207018	207023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161723223
4528	NC_000117	CAA	2	6	207138	207143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161723223
4529	NC_000117	TGA	2	6	207161	207166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161723223
4530	NC_000117	ATT	2	6	207190	207195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161723223
4531	NC_000117	CT	3	6	207244	207249	0 %	50 %	0 %	50 %	161723223
4532	NC_000117	TTC	2	6	207333	207338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161723223
4533	NC_000117	GCT	2	6	207386	207391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161723223
4534	NC_000117	CCT	2	6	207411	207416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161723223
4535	NC_000117	T	7	7	207423	207429	0 %	100 %	0 %	0 %	161723223
4536	NC_000117	GAA	2	6	207432	207437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161723223
4537	NC_000117	A	7	7	207440	207446	100 %	0 %	0 %	0 %	161723223
4538	NC_000117	A	6	6	207448	207453	100 %	0 %	0 %	0 %	161723223
4539	NC_000117	TTC	2	6	207472	207477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161723223
4540	NC_000117	GAA	2	6	207486	207491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161723223
4541	NC_000117	GAA	2	6	207558	207563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161723223
4542	NC_000117	TTC	2	6	207578	207583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161723223
4543	NC_000117	ATT	2	6	207608	207613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161723223
4544	NC_000117	TTAC	2	8	207647	207654	25 %	50 %	0 %	25 %	161723223
4545	NC_000117	AAC	2	6	207680	207685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161723223
4546	NC_000117	A	6	6	207705	207710	100 %	0 %	0 %	0 %	161723223
4547	NC_000117	TTA	2	6	207772	207777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161723223
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4549	NC_000117	AAG	2	6	208069	208074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161723223
4550	NC_000117	TGA	2	6	208076	208081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161723223
4551	NC_000117	TAT	2	6	208084	208089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161723223
4552	NC_000117	GGC	2	6	208108	208113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161723223
4553	NC_000117	TTA	2	6	208156	208161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604906
4554	NC_000117	ATG	2	6	208168	208173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604906
4555	NC_000117	AAG	2	6	208201	208206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604906
4556	NC_000117	GGA	2	6	208293	208298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604906
4557	NC_000117	GAA	2	6	208331	208336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604906
4558	NC_000117	GC	3	6	208337	208342	0 %	0 %	50 %	50 %	15604906
4559	NC_000117	GTA	2	6	208368	208373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604906
4560	NC_000117	GC	3	6	208388	208393	0 %	0 %	50 %	50 %	15604906
4561	NC_000117	AGA	2	6	208463	208468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604906
4562	NC_000117	TC	3	6	208599	208604	0 %	50 %	0 %	50 %	15604906
4563	NC_000117	GAA	2	6	208626	208631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604906
4564	NC_000117	CCG	2	6	208676	208681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15604906
4565	NC_000117	TAGG	2	8	208783	208790	25 %	25 %	50 %	0 %	15604906
4566	NC_000117	CTC	2	6	208819	208824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604906
4567	NC_000117	TCT	2	6	208848	208853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604906
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4569	NC_000117	TGT	2	6	208944	208949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604907
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4571	NC_000117	TGA	2	6	209038	209043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604907
4572	NC_000117	CTT	2	6	209053	209058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604907
4573	NC_000117	T	6	6	209130	209135	0 %	100 %	0 %	0 %	15604907
4574	NC_000117	GCA	2	6	209200	209205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604907
4575	NC_000117	TCA	2	6	209217	209222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604907
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4579	NC_000117	TAG	2	6	209362	209367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604907
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4582	NC_000117	ATAA	2	8	209480	209487	75 %	25 %	0 %	0 %	15604907
4583	NC_000117	GAG	2	6	209581	209586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604907
4584	NC_000117	TTA	2	6	209613	209618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604907
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4588	NC_000117	AGC	2	6	209771	209776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604907
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4590	NC_000117	GTA	2	6	209984	209989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604908
4591	NC_000117	TAG	2	6	210119	210124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604908
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4596	NC_000117	AGA	2	6	210259	210264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604908
4597	NC_000117	AG	3	6	210286	210291	50 %	0 %	50 %	0 %	15604908
4598	NC_000117	CT	3	6	210303	210308	0 %	50 %	0 %	50 %	15604908
4599	NC_000117	CTT	2	6	210329	210334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604908
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4604	NC_000117	TG	3	6	210551	210556	0 %	50 %	50 %	0 %	15604909
4605	NC_000117	GAAC	2	8	210692	210699	50 %	0 %	25 %	25 %	15604909
4606	NC_000117	CA	4	8	210765	210772	50 %	0 %	0 %	50 %	15604909
4607	NC_000117	T	6	6	210830	210835	0 %	100 %	0 %	0 %	15604909
4608	NC_000117	CTC	2	6	210852	210857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604909
4609	NC_000117	AGC	2	6	210859	210864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604909
4610	NC_000117	ATAAC	2	10	210924	210933	60 %	20 %	0 %	20 %	15604909
4611	NC_000117	AGC	2	6	210961	210966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604909
4612	NC_000117	CAT	2	6	210981	210986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604909
4613	NC_000117	T	6	6	211009	211014	0 %	100 %	0 %	0 %	15604909
4614	NC_000117	ACA	2	6	211052	211057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604909
4615	NC_000117	CTT	2	6	211060	211065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604909
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4617	NC_000117	TTCC	2	8	211143	211150	0 %	50 %	0 %	50 %	15604909
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4620	NC_000117	AGTA	2	8	211247	211254	50 %	25 %	25 %	0 %	15604909
4621	NC_000117	TTC	2	6	211301	211306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604909
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4625	NC_000117	TCT	2	6	211427	211432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604909
4626	NC_000117	ACG	2	6	211471	211476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604909
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4628	NC_000117	TAAC	2	8	211530	211537	50 %	25 %	0 %	25 %	15604909
4629	NC_000117	TCT	2	6	211538	211543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604909
4630	NC_000117	ATA	2	6	211561	211566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604909
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4645	NC_000117	TTG	2	6	212382	212387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604909
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4654	NC_000117	TTG	2	6	213095	213100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604910
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4659	NC_000117	TCT	2	6	213235	213240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604910
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4683	NC_000117	CT	3	6	214143	214148	0 %	50 %	0 %	50 %	15604910
4684	NC_000117	CT	3	6	214151	214156	0 %	50 %	0 %	50 %	15604910
4685	NC_000117	AGC	2	6	214158	214163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604910
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4692	NC_000117	CTTGT	2	10	214481	214490	0 %	60 %	20 %	20 %	15604910
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4697	NC_000117	CTGGAT	2	12	214808	214819	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15604910
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4700	NC_000117	CTTG	2	8	215075	215082	0 %	50 %	25 %	25 %	15604910
4701	NC_000117	GAAATA	2	12	215131	215142	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15604910
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4744	NC_000117	T	6	6	217189	217194	0 %	100 %	0 %	0 %	15604913
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4750	NC_000117	TCC	2	6	217422	217427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604913
4751	NC_000117	T	6	6	217428	217433	0 %	100 %	0 %	0 %	15604913
4752	NC_000117	TAA	2	6	217508	217513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604913
4753	NC_000117	AGC	2	6	217554	217559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604913
4754	NC_000117	GAT	2	6	217589	217594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604913
4755	NC_000117	T	7	7	217731	217737	0 %	100 %	0 %	0 %	15604913
4756	NC_000117	A	7	7	217799	217805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4757	NC_000117	TAA	2	6	217806	217811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4758	NC_000117	AG	4	8	217831	217838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4759	NC_000117	A	6	6	217856	217861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4760	NC_000117	GAA	2	6	217866	217871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4761	NC_000117	AGA	2	6	218021	218026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604914
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4767	NC_000117	TTC	2	6	218228	218233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604914
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4772	NC_000117	T	6	6	218363	218368	0 %	100 %	0 %	0 %	15604914
4773	NC_000117	TAA	2	6	218414	218419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604914
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4782	NC_000117	GTT	2	6	218833	218838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604914
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4784	NC_000117	TTCC	2	8	218887	218894	0 %	50 %	0 %	50 %	15604914
4785	NC_000117	TTC	2	6	218951	218956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604914
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4788	NC_000117	TA	3	6	219191	219196	50 %	50 %	0 %	0 %	15604914
4789	NC_000117	CTG	2	6	219233	219238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604914
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4793	NC_000117	TA	3	6	219385	219390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4794	NC_000117	GTC	2	6	219404	219409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4796	NC_000117	T	6	6	219475	219480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4800	NC_000117	ATG	2	6	219677	219682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4802	NC_000117	ATG	2	6	219788	219793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604915
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4824	NC_000117	AAATA	2	10	220551	220560	80 %	20 %	0 %	0 %	15604915
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4832	NC_000117	A	7	7	220923	220929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4833	NC_000117	TAA	2	6	220977	220982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4834	NC_000117	ATTTC	2	10	221004	221013	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4835	NC_000117	CT	3	6	221025	221030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4836	NC_000117	AATT	2	8	221037	221044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4845	NC_000117	TCG	2	6	221288	221293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604916
4846	NC_000117	CT	3	6	221324	221329	0 %	50 %	0 %	50 %	15604916
4847	NC_000117	CTTG	2	8	221386	221393	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4848	NC_000117	T	6	6	221441	221446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4849	NC_000117	CTT	2	6	221561	221566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604917
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4851	NC_000117	CTG	2	6	221623	221628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604917
4852	NC_000117	AATT	2	8	221672	221679	50 %	50 %	0 %	0 %	15604917
4853	NC_000117	CTAT	2	8	221713	221720	25 %	50 %	0 %	25 %	15604917
4854	NC_000117	GAT	2	6	221926	221931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604917
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4857	NC_000117	GATGCA	2	12	222022	222033	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15604917
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4859	NC_000117	GAAAC	2	10	222165	222174	60 %	0 %	20 %	20 %	15604917
4860	NC_000117	GCA	2	6	222178	222183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604917
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4863	NC_000117	TCG	2	6	222297	222302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604917
4864	NC_000117	CT	3	6	222321	222326	0 %	50 %	0 %	50 %	15604917
4865	NC_000117	CTT	2	6	222341	222346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604917
4866	NC_000117	GA	4	8	222389	222396	50 %	0 %	50 %	0 %	15604917
4867	NC_000117	CA	3	6	222411	222416	50 %	0 %	0 %	50 %	15604917
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4869	NC_000117	TGCT	2	8	222462	222469	0 %	50 %	25 %	25 %	15604917
4870	NC_000117	TCC	2	6	222501	222506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604918
4871	NC_000117	CA	3	6	222537	222542	50 %	0 %	0 %	50 %	15604918
4872	NC_000117	GAT	2	6	222561	222566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604918
4873	NC_000117	CTT	2	6	222597	222602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604918
4874	NC_000117	TCA	2	6	222620	222625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604918
4875	NC_000117	TCT	2	6	222691	222696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604918
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4877	NC_000117	A	6	6	222732	222737	100 %	0 %	0 %	0 %	15604918
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