MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo clone fragment c

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_167352	TTC	2	6	692	697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NT_167352	AAT	2	6	852	857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_167352	TAT	2	6	1121	1126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_167352	TAT	3	9	1200	1208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_167352	GTA	2	6	1214	1219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NT_167352	AAT	2	6	1243	1248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_167352	AAT	2	6	1391	1396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_167352	TAT	2	6	1912	1917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_167352	CTT	2	6	1918	1923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NT_167352	GAA	2	6	1931	1936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NT_167352	AAT	3	9	1945	1953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_167352	TAT	2	6	1960	1965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_167352	ATA	2	6	2044	2049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_167352	TTC	2	6	2068	2073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NT_167352	TTA	2	6	2171	2176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_167352	TTA	2	6	2219	2224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_167352	CTA	2	6	2307	2312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NT_167352	ATT	2	6	2527	2532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_167352	AAT	2	6	3279	3284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_167352	AAG	2	6	3336	3341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NT_167352	TAT	2	6	3347	3352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_167352	TAA	2	6	3357	3362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_167352	CTA	2	6	3414	3419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NT_167352	GAA	2	6	3420	3425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NT_167352	TAT	2	6	3431	3436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NT_167352	AAG	2	6	3552	3557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NT_167352	ATA	2	6	3797	3802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NT_167352	TAT	2	6	3919	3924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_167352	TTA	2	6	4037	4042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_167352	GTA	2	6	4120	4125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NT_167352	TTC	2	6	4128	4133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NT_167352	CTT	2	6	4143	4148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NT_167352	TAA	2	6	4491	4496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_167352	ATT	2	6	4537	4542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NT_167352	TTA	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NT_167352	CTT	2	6	4723	4728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NT_167352	TTA	2	6	4766	4771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_167352	TAA	2	6	4778	4783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NT_167352	ATT	3	9	4791	4799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_167352	ATT	2	6	4846	4851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_167352	AAT	2	6	4907	4912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_167352	ATT	2	6	4929	4934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NT_167352	TTA	2	6	5681	5686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_167352	ACC	2	6	5740	5745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NT_167352	TGT	2	6	5755	5760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NT_167352	ATC	2	6	5867	5872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NT_167352	AAT	2	6	5876	5881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NT_167352	CAA	2	6	5932	5937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NT_167352	ATT	2	6	6725	6730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NT_167352	AAT	2	6	6838	6843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.