MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo clone fragment c

Total Repeats: 143

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_167352	CT	3	6	183	188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NT_167352	A	6	6	205	210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_167352	TTC	2	6	692	697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NT_167352	ATTT	2	8	732	739	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_167352	ACTCAA	2	12	813	824	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NT_167352	A	6	6	843	848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_167352	AAT	2	6	852	857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_167352	T	6	6	868	873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_167352	ATTT	2	8	947	954	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_167352	TTTTA	2	10	969	978	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_167352	TAT	2	6	1121	1126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_167352	A	6	6	1142	1147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_167352	TAT	3	9	1200	1208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_167352	GTA	2	6	1214	1219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NT_167352	AAT	2	6	1243	1248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_167352	T	7	7	1368	1374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_167352	AAT	2	6	1391	1396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_167352	TA	3	6	1827	1832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_167352	T	8	8	1843	1850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_167352	A	6	6	1863	1868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NT_167352	TAT	2	6	1912	1917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_167352	CTT	2	6	1918	1923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NT_167352	GAA	2	6	1931	1936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NT_167352	ATTA	2	8	1937	1944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NT_167352	AAT	3	9	1945	1953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NT_167352	TAT	2	6	1960	1965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NT_167352	CTTT	2	8	1995	2002	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NT_167352	T	7	7	2037	2043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_167352	ATA	2	6	2044	2049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_167352	T	7	7	2052	2058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NT_167352	TTC	2	6	2068	2073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NT_167352	T	7	7	2094	2100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_167352	TTAT	2	8	2103	2110	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_167352	T	6	6	2132	2137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NT_167352	T	9	9	2146	2154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NT_167352	TTA	2	6	2171	2176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NT_167352	T	6	6	2180	2185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_167352	A	6	6	2186	2191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NT_167352	TA	3	6	2213	2218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_167352	TTA	2	6	2219	2224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_167352	CTA	2	6	2307	2312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NT_167352	AAAC	2	8	2313	2320	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NT_167352	TTACA	2	10	2371	2380	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NT_167352	A	6	6	2398	2403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NT_167352	TTGTT	2	10	2404	2413	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NT_167352	ATTTT	2	10	2486	2495	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NT_167352	ATTA	2	8	2509	2516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NT_167352	ATT	2	6	2527	2532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NT_167352	TAAT	2	8	2539	2546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NT_167352	A	6	6	2547	2552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_167352	AT	3	6	2557	2562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NT_167352	AT	3	6	3236	3241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NT_167352	CTAG	2	8	3262	3269	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NT_167352	AAT	2	6	3279	3284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NT_167352	ATTGA	2	10	3306	3315	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NT_167352	A	6	6	3326	3331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NT_167352	AAG	2	6	3336	3341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NT_167352	TAT	2	6	3347	3352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_167352	TAA	2	6	3357	3362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_167352	CTA	2	6	3414	3419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NT_167352	GAA	2	6	3420	3425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NT_167352	TAT	2	6	3431	3436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NT_167352	A	7	7	3437	3443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NT_167352	AT	3	6	3449	3454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NT_167352	ATTTT	2	10	3461	3470	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_167352	T	6	6	3520	3525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NT_167352	AT	3	6	3536	3541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NT_167352	AAG	2	6	3552	3557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NT_167352	T	6	6	3595	3600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NT_167352	AT	3	6	3615	3620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NT_167352	A	6	6	3624	3629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NT_167352	TAAAT	2	10	3785	3794	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NT_167352	ATA	2	6	3797	3802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NT_167352	TTCT	2	8	3819	3826	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NT_167352	TA	3	6	3887	3892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NT_167352	T	7	7	3899	3905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NT_167352	TAT	2	6	3919	3924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NT_167352	T	6	6	3929	3934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NT_167352	AAAGA	2	10	4001	4010	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NT_167352	A	8	8	4015	4022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NT_167352	TTA	2	6	4037	4042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NT_167352	AGCCTT	2	12	4058	4069	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NT_167352	TTTG	2	8	4075	4082	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NT_167352	GTA	2	6	4120	4125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NT_167352	TTC	2	6	4128	4133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NT_167352	CTT	2	6	4143	4148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NT_167352	T	7	7	4167	4173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NT_167352	T	8	8	4182	4189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NT_167352	GTTTA	2	10	4410	4419	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NT_167352	TAA	2	6	4491	4496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NT_167352	T	6	6	4501	4506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NT_167352	ATT	2	6	4537	4542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NT_167352	AAAG	2	8	4557	4564	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NT_167352	TTA	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NT_167352	TA	4	8	4586	4593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NT_167352	TA	3	6	4596	4601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NT_167352	TAAT	2	8	4683	4690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NT_167352	TAAA	2	8	4704	4711	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NT_167352	CTT	2	6	4723	4728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NT_167352	TTA	2	6	4766	4771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NT_167352	TAA	2	6	4778	4783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NT_167352	ATT	3	9	4791	4799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NT_167352	TAAA	2	8	4821	4828	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NT_167352	ATT	2	6	4846	4851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NT_167352	AAAT	2	8	4867	4874	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NT_167352	TTTA	2	8	4885	4892	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NT_167352	AAT	2	6	4907	4912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NT_167352	ATT	2	6	4929	4934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NT_167352	TAAAT	2	10	4935	4944	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NT_167352	T	6	6	4944	4949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NT_167352	T	6	6	4977	4982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NT_167352	TAAC	2	8	5001	5008	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NT_167352	GA	3	6	5021	5026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NT_167352	AT	4	8	5082	5089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NT_167352	T	7	7	5104	5110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NT_167352	TATT	2	8	5128	5135	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NT_167352	AT	3	6	5423	5428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NT_167352	A	6	6	5463	5468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NT_167352	T	6	6	5622	5627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NT_167352	GCTT	2	8	5649	5656	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NT_167352	A	6	6	5668	5673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NT_167352	TTA	2	6	5681	5686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NT_167352	TAAT	2	8	5707	5714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NT_167352	ACC	2	6	5740	5745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NT_167352	TGT	2	6	5755	5760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NT_167352	ATTT	2	8	5765	5772	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NT_167352	T	7	7	5795	5801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NT_167352	A	6	6	5860	5865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NT_167352	ATC	2	6	5867	5872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NT_167352	AAT	2	6	5876	5881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NT_167352	T	6	6	5902	5907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NT_167352	CAA	2	6	5932	5937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NT_167352	A	6	6	5949	5954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NT_167352	ATTA	2	8	5963	5970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NT_167352	ATAC	2	8	6677	6684	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NT_167352	TACT	2	8	6694	6701	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NT_167352	T	9	9	6713	6721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NT_167352	ATT	2	6	6725	6730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NT_167352	TA	3	6	6755	6760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NT_167352	TA	3	6	6765	6770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NT_167352	TA	3	6	6775	6780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NT_167352	ATTTC	2	10	6796	6805	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NT_167352	AAT	2	6	6838	6843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.