MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia pseudomallei NCTC 13179 chromosome 1

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022659	GC	4	8	101013	101020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
502	NC_022659	CG	3	6	101021	101026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
503	NC_022659	GATT	2	8	101037	101044	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
504	NC_022659	GCG	2	6	101120	101125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_022659	GCG	2	6	101154	101159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_022659	CCGG	2	8	101169	101176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
507	NC_022659	CG	3	6	101179	101184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
508	NC_022659	CG	3	6	101187	101192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
509	NC_022659	CG	4	8	101195	101202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
510	NC_022659	GCC	2	6	101206	101211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_022659	CGC	2	6	101212	101217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_022659	CCCG	2	8	101222	101229	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
513	NC_022659	CGC	3	9	102164	102172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_022659	GCC	2	6	102173	102178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_022659	CGG	2	6	102183	102188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_022659	AAAT	2	8	102274	102281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_022659	AACG	2	8	102328	102335	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
518	NC_022659	CCGC	2	8	102380	102387	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
519	NC_022659	CAT	2	6	102414	102419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_022659	ATG	2	6	102491	102496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_022659	CAT	2	6	102525	102530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_022659	GCG	2	6	103839	103844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_022659	CGTC	2	8	103852	103859	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
524	NC_022659	GC	3	6	104870	104875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
525	NC_022659	CGC	2	6	104879	104884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_022659	ATGT	2	8	104892	104899	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
527	NC_022659	CGGC	2	8	104919	104926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
528	NC_022659	GCCG	2	8	104946	104953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
529	NC_022659	GAT	2	6	104978	104983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_022659	ATGC	2	8	105016	105023	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
531	NC_022659	GC	3	6	105031	105036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
532	NC_022659	CGC	2	6	105058	105063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_022659	CGC	2	6	105103	105108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_022659	CGG	2	6	105137	105142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_022659	ACGA	2	8	105151	105158	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
536	NC_022659	CCG	2	6	105198	105203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_022659	CTT	2	6	105216	105221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_022659	CGG	2	6	105227	105232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_022659	AC	3	6	105255	105260	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_022659	GCCG	2	8	105273	105280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
541	NC_022659	T	6	6	105320	105325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_022659	CG	3	6	105613	105618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
543	NC_022659	GCG	2	6	105626	105631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_022659	GGC	2	6	105635	105640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_022659	GCGCC	2	10	105663	105672	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
546	NC_022659	TGT	2	6	105673	105678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_022659	GC	3	6	105688	105693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
548	NC_022659	CG	3	6	105711	105716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
549	NC_022659	TCGC	2	8	105737	105744	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
550	NC_022659	T	7	7	105760	105766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_022659	CGA	2	6	105813	105818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_022659	CGC	3	9	105822	105830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_022659	GCCGC	2	10	105851	105860	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
554	NC_022659	GAC	2	6	106154	106159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_022659	GA	3	6	106252	106257	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
556	NC_022659	GCG	2	6	106305	106310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_022659	T	6	6	106330	106335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_022659	GC	4	8	106344	106351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
559	NC_022659	GC	3	6	106354	106359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
560	NC_022659	GAT	2	6	106429	106434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_022659	CGG	2	6	106446	106451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_022659	CGTG	2	8	106479	106486	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
563	NC_022659	GGC	2	6	106493	106498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_022659	CG	4	8	106508	106515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
565	NC_022659	AGGC	2	8	106520	106527	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
566	NC_022659	ACG	2	6	106573	106578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_022659	GCC	2	6	106630	106635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_022659	GC	4	8	106661	106668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
569	NC_022659	GCG	2	6	106703	106708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_022659	CA	3	6	106728	106733	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
571	NC_022659	GCG	2	6	106734	106739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_022659	GGC	2	6	106764	106769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_022659	GAT	2	6	106778	106783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_022659	CG	3	6	106816	106821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
575	NC_022659	CGC	2	6	106847	106852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_022659	CAA	2	6	106869	106874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_022659	A	6	6	106897	106902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_022659	CGAGCG	2	12	106944	106955	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_022659	CGA	2	6	107020	107025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_022659	GCCG	2	8	108496	108503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
581	NC_022659	GC	3	6	108510	108515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
582	NC_022659	GCG	2	6	108568	108573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_022659	GCC	2	6	109208	109213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_022659	ATA	2	6	109271	109276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_022659	TTTA	2	8	109295	109302	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_022659	A	6	6	109315	109320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_022659	TGGCAT	2	12	109343	109354	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
588	NC_022659	ATC	2	6	109376	109381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_022659	A	8	8	109424	109431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_022659	TTA	2	6	109444	109449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_022659	CAT	2	6	109460	109465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_022659	ATCCA	2	10	109491	109500	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
593	NC_022659	ATTGA	2	10	109506	109515	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
594	NC_022659	TAG	2	6	109568	109573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_022659	CGTTC	2	10	116211	116220	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
596	NC_022659	CG	4	8	116230	116237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
597	NC_022659	CGCGG	2	10	116245	116254	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
598	NC_022659	GCGCG	2	10	116269	116278	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
599	NC_022659	GCG	2	6	116289	116294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_022659	TCGT	2	8	116306	116313	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
601	NC_022659	GC	3	6	116326	116331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
602	NC_022659	TCG	2	6	116337	116342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_022659	GTC	2	6	116415	116420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_022659	GCAC	2	8	116421	116428	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
605	NC_022659	GC	3	6	116429	116434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
606	NC_022659	GCC	2	6	116467	116472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_022659	TCA	2	6	116503	116508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_022659	CGGC	2	8	116795	116802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
609	NC_022659	C	6	6	116825	116830	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
610	NC_022659	CGT	2	6	116832	116837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_022659	CGA	2	6	116861	116866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_022659	CGCA	2	8	116915	116922	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
613	NC_022659	CGT	2	6	116923	116928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_022659	GCA	2	6	116956	116961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_022659	AC	3	6	117470	117475	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
616	NC_022659	GAA	2	6	117494	117499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_022659	CCA	2	6	117585	117590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_022659	CCGC	2	8	117659	117666	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
619	NC_022659	AC	3	6	117672	117677	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
620	NC_022659	CGC	2	6	117729	117734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_022659	CATCGT	2	12	117746	117757	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_022659	GCAC	2	8	117781	117788	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
623	NC_022659	GCGCTC	2	12	121700	121711	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
624	NC_022659	GCC	2	6	123156	123161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_022659	TCC	2	6	123221	123226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_022659	AAT	2	6	123237	123242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_022659	GCG	3	9	123246	123254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_022659	CCGA	2	8	123267	123274	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
629	NC_022659	CA	3	6	123322	123327	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
630	NC_022659	CG	3	6	123391	123396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
631	NC_022659	CAG	2	6	123449	123454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_022659	ATC	2	6	123455	123460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_022659	GC	3	6	123464	123469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
634	NC_022659	ACG	2	6	123482	123487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_022659	GCA	2	6	123621	123626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_022659	GGC	2	6	123693	123698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_022659	GCC	2	6	123885	123890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_022659	C	6	6	124021	124026	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
639	NC_022659	GTT	2	6	124040	124045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_022659	AGA	2	6	124060	124065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
641	NC_022659	ACA	2	6	124085	124090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_022659	TCGG	2	8	124166	124173	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
643	NC_022659	A	6	6	124351	124356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
644	NC_022659	ATCC	2	8	124371	124378	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
645	NC_022659	TCG	2	6	124451	124456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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647	NC_022659	TCA	2	6	124632	124637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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650	NC_022659	GCC	2	6	124714	124719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
651	NC_022659	CAAACA	2	12	124734	124745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
652	NC_022659	GAC	2	6	125413	125418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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655	NC_022659	CT	3	6	129130	129135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
656	NC_022659	T	6	6	129149	129154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
657	NC_022659	CGA	2	6	129170	129175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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659	NC_022659	ATC	2	6	129211	129216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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661	NC_022659	GATTC	2	10	129267	129276	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
662	NC_022659	AC	3	6	129296	129301	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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664	NC_022659	CGC	2	6	129449	129454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
665	NC_022659	TAA	2	6	129501	129506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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673	NC_022659	CG	3	6	133299	133304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
674	NC_022659	CG	3	6	133320	133325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
675	NC_022659	CGC	2	6	133411	133416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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677	NC_022659	CG	3	6	133481	133486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
678	NC_022659	GCGG	2	8	133488	133495	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
679	NC_022659	CG	3	6	133506	133511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
680	NC_022659	GCG	2	6	133516	133521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
681	NC_022659	CGG	2	6	133534	133539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
682	NC_022659	CGG	2	6	133551	133556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
683	NC_022659	GCG	2	6	133563	133568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
684	NC_022659	CGC	2	6	133569	133574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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702	NC_022659	CG	3	6	135630	135635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
703	NC_022659	GCG	2	6	135643	135648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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781	NC_022659	CGC	2	6	149800	149805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
782	NC_022659	CGG	2	6	149824	149829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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784	NC_022659	CGG	2	6	149988	149993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
785	NC_022659	CGC	2	6	149996	150001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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791	NC_022659	CGC	2	6	151188	151193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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795	NC_022659	GCA	3	9	151269	151277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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915	NC_022659	CGGCC	2	10	180402	180411	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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1000	NC_022659	CG	4	8	192585	192592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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