MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia pseudomallei NCTC 13179 chromosome 2

Total Repeats: 17569

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_022658	GCC	3	9	3332112	3332120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17502	NC_022658	ATCG	2	8	3333389	3333396	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17503	NC_022658	GC	3	6	3333424	3333429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17504	NC_022658	CGC	2	6	3333432	3333437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17505	NC_022658	CGCC	2	8	3333472	3333479	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17506	NC_022658	GC	4	8	3333586	3333593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17507	NC_022658	GCC	2	6	3333613	3333618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17508	NC_022658	CG	3	6	3333737	3333742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17509	NC_022658	CG	3	6	3333786	3333791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17510	NC_022658	TTC	2	6	3333809	3333814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17511	NC_022658	AATCA	2	10	3333823	3333832	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17512	NC_022658	CG	3	6	3333843	3333848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17513	NC_022658	CGC	2	6	3333880	3333885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17514	NC_022658	CGG	2	6	3333889	3333894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17515	NC_022658	CGA	2	6	3333960	3333965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17516	NC_022658	GTA	2	6	3333985	3333990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17517	NC_022658	GCA	2	6	3334175	3334180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17518	NC_022658	GTC	2	6	3334185	3334190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17519	NC_022658	GCC	2	6	3334218	3334223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17520	NC_022658	GCA	2	6	3334240	3334245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17521	NC_022658	GCC	2	6	3334246	3334251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17522	NC_022658	CG	3	6	3334316	3334321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17523	NC_022658	GCA	2	6	3334323	3334328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17524	NC_022658	GCG	2	6	3334329	3334334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17525	NC_022658	CGG	2	6	3334335	3334340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17526	NC_022658	GCC	2	6	3334346	3334351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17527	NC_022658	GCCG	2	8	3334389	3334396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17528	NC_022658	CGGCG	2	10	3334423	3334432	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17529	NC_022658	GCG	2	6	3334436	3334441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17530	NC_022658	CGCA	2	8	3334474	3334481	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17531	NC_022658	GC	4	8	3334483	3334490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17532	NC_022658	TC	3	6	3335251	3335256	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17533	NC_022658	CTG	2	6	3335273	3335278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17534	NC_022658	CCG	2	6	3335291	3335296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17535	NC_022658	GCT	2	6	3335299	3335304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17536	NC_022658	CG	3	6	3335372	3335377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17537	NC_022658	GC	3	6	3335378	3335383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17538	NC_022658	CG	3	6	3335400	3335405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17539	NC_022658	GCGCG	2	10	3335425	3335434	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17540	NC_022658	CGC	2	6	3335444	3335449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17541	NC_022658	GCC	2	6	3335469	3335474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17542	NC_022658	GC	3	6	3335483	3335488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17543	NC_022658	GCC	2	6	3335494	3335499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17544	NC_022658	CG	3	6	3336033	3336038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17545	NC_022658	ATC	2	6	3336046	3336051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17546	NC_022658	CG	3	6	3336058	3336063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17547	NC_022658	CGC	2	6	3336089	3336094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17548	NC_022658	CGC	2	6	3336111	3336116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17549	NC_022658	TCG	2	6	3336130	3336135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17550	NC_022658	CGC	2	6	3336145	3336150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17551	NC_022658	CCGG	2	8	3336160	3336167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17552	NC_022658	CGCGC	2	10	3336172	3336181	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
17553	NC_022658	CG	3	6	3337565	3337570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17554	NC_022658	GC	3	6	3337577	3337582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17555	NC_022658	CG	3	6	3337593	3337598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17556	NC_022658	GCC	2	6	3337619	3337624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17557	NC_022658	CGT	2	6	3338396	3338401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17558	NC_022658	TCG	3	9	3338408	3338416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17559	NC_022658	GCC	2	6	3338433	3338438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17560	NC_022658	CG	3	6	3338441	3338446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17561	NC_022658	CG	4	8	3338448	3338455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17562	NC_022658	GCGCGG	2	12	3339878	3339889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17563	NC_022658	CGC	3	9	3339892	3339900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17564	NC_022658	GCGG	2	8	3339907	3339914	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17565	NC_022658	GGGT	2	8	3339929	3339936	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
17566	NC_022658	TGTA	2	8	3339985	3339992	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17567	NC_022658	GCG	2	6	3340000	3340005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17568	NC_022658	TCGA	2	8	3340044	3340051	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17569	NC_022658	CAT	2	6	3340055	3340060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.