MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia pseudomallei NCTC 13179 chromosome 2

Total Repeats: 17569

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022658	TGC	2	6	85448	85453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_022658	GCC	2	6	85531	85536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_022658	CGCC	2	8	85581	85588	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
504	NC_022658	GCG	2	6	85595	85600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_022658	CTG	2	6	85721	85726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_022658	GGC	2	6	85761	85766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_022658	GCCG	2	8	85770	85777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
508	NC_022658	CGG	2	6	85789	85794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_022658	CGG	2	6	85802	85807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_022658	GCC	2	6	85825	85830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_022658	CGC	3	9	85851	85859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_022658	TCAAA	2	10	86831	86840	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
513	NC_022658	C	6	6	86898	86903	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
514	NC_022658	CG	3	6	87375	87380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
515	NC_022658	CCGG	2	8	87396	87403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
516	NC_022658	GAAT	2	8	87406	87413	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
517	NC_022658	CG	3	6	87417	87422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
518	NC_022658	GCGCC	2	10	87446	87455	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
519	NC_022658	CGG	2	6	87465	87470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_022658	CG	3	6	87471	87476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
521	NC_022658	GTC	2	6	88060	88065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_022658	GC	4	8	88090	88097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
523	NC_022658	CGC	3	9	88114	88122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_022658	GCGA	2	8	88162	88169	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
525	NC_022658	CGAT	2	8	88177	88184	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
526	NC_022658	CAC	3	9	88228	88236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_022658	CGC	2	6	88257	88262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_022658	GC	3	6	88265	88270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
529	NC_022658	CCG	2	6	88280	88285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_022658	GC	3	6	88295	88300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
531	NC_022658	GCG	2	6	88309	88314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_022658	GC	4	8	89286	89293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
533	NC_022658	CGG	2	6	89294	89299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_022658	GC	4	8	89308	89315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
535	NC_022658	TC	3	6	90034	90039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
536	NC_022658	TGC	2	6	90048	90053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_022658	GC	3	6	90075	90080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
538	NC_022658	CGC	2	6	90126	90131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_022658	ACG	2	6	90143	90148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_022658	GC	3	6	90160	90165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
541	NC_022658	CGG	2	6	90175	90180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_022658	CG	3	6	90221	90226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
543	NC_022658	CGA	3	9	90241	90249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_022658	GC	3	6	90266	90271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
545	NC_022658	GTTC	2	8	90279	90286	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
546	NC_022658	GCC	2	6	90292	90297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_022658	TTC	2	6	90329	90334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_022658	CAT	2	6	90366	90371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_022658	ATCG	2	8	90397	90404	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
550	NC_022658	CG	3	6	90716	90721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
551	NC_022658	CGAT	2	8	90732	90739	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
552	NC_022658	CG	3	6	90757	90762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
553	NC_022658	CCG	2	6	90813	90818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_022658	CGAT	2	8	90828	90835	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
555	NC_022658	GC	3	6	90841	90846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
556	NC_022658	CG	3	6	92216	92221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
557	NC_022658	C	6	6	92290	92295	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
558	NC_022658	TTCC	2	8	92324	92331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
559	NC_022658	AATG	2	8	92878	92885	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
560	NC_022658	GC	3	6	92905	92910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
561	NC_022658	GCA	2	6	92913	92918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_022658	GGC	2	6	92920	92925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_022658	TGC	2	6	92948	92953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_022658	TCG	2	6	92955	92960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_022658	CGCA	2	8	92965	92972	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
566	NC_022658	GC	4	8	94532	94539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
567	NC_022658	GGC	2	6	94540	94545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_022658	GC	3	6	94552	94557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
569	NC_022658	CGG	3	9	94561	94569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_022658	CGA	2	6	94575	94580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_022658	TA	3	6	94582	94587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_022658	GC	4	8	94602	94609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
573	NC_022658	CAA	2	6	94645	94650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_022658	GCG	2	6	94655	94660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_022658	CG	3	6	94659	94664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
576	NC_022658	ATG	2	6	94740	94745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_022658	GC	5	10	94765	94774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
578	NC_022658	CGC	3	9	94772	94780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_022658	GGC	2	6	94794	94799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_022658	GCGCG	2	10	94816	94825	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
581	NC_022658	CCG	2	6	94846	94851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_022658	T	6	6	94897	94902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_022658	CA	3	6	94916	94921	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
584	NC_022658	CGC	2	6	94941	94946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_022658	CCGACG	2	12	94969	94980	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
586	NC_022658	TCT	2	6	95015	95020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_022658	CG	3	6	95459	95464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
588	NC_022658	CGC	2	6	95473	95478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_022658	CG	3	6	95498	95503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
590	NC_022658	GCCGA	2	10	95518	95527	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
591	NC_022658	GCCG	2	8	95586	95593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
592	NC_022658	CGGC	2	8	96470	96477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
593	NC_022658	GCCG	2	8	96483	96490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
594	NC_022658	TGAAT	2	10	99015	99024	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
595	NC_022658	CAG	2	6	99038	99043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_022658	GCAG	2	8	99168	99175	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
597	NC_022658	TAA	2	6	99182	99187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_022658	TTA	2	6	99332	99337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_022658	ATGC	2	8	99365	99372	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
600	NC_022658	GC	3	6	99377	99382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
601	NC_022658	TGGC	2	8	99386	99393	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
602	NC_022658	CAAT	2	8	99423	99430	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
603	NC_022658	ACT	2	6	99442	99447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_022658	A	7	7	99461	99467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_022658	AAT	2	6	99474	99479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_022658	TGC	2	6	99492	99497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_022658	CGC	2	6	99519	99524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_022658	TCC	2	6	100943	100948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_022658	GTC	2	6	100951	100956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_022658	GAT	2	6	103175	103180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_022658	CGC	2	6	107854	107859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_022658	CGAC	2	8	107872	107879	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
613	NC_022658	CG	3	6	107885	107890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
614	NC_022658	GCC	2	6	107930	107935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_022658	CAC	2	6	107939	107944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_022658	CCGT	2	8	109736	109743	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
617	NC_022658	GGC	2	6	112172	112177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_022658	CTTC	2	8	112821	112828	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
619	NC_022658	ATGG	2	8	112871	112878	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
620	NC_022658	AAG	2	6	112986	112991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_022658	GCC	2	6	113056	113061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_022658	TTCGA	2	10	113064	113073	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
623	NC_022658	ATTT	2	8	113076	113083	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_022658	CCA	2	6	113117	113122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_022658	CA	3	6	113127	113132	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
626	NC_022658	AT	3	6	113138	113143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_022658	AAAG	2	8	113150	113157	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
628	NC_022658	CG	3	6	113179	113184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
629	NC_022658	CG	4	8	113198	113205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
630	NC_022658	CCGC	2	8	113210	113217	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
631	NC_022658	GCG	2	6	114338	114343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_022658	CG	3	6	114358	114363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
633	NC_022658	GCG	2	6	114387	114392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_022658	GC	3	6	114419	114424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
635	NC_022658	CGG	2	6	114488	114493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_022658	GCC	2	6	114526	114531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_022658	CG	3	6	114534	114539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
638	NC_022658	GCC	2	6	114556	114561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
639	NC_022658	CAT	2	6	114573	114578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_022658	GCC	2	6	114581	114586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
641	NC_022658	GCG	2	6	114587	114592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_022658	CG	3	6	114591	114596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
643	NC_022658	CGC	2	6	114605	114610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
644	NC_022658	CGAT	2	8	114630	114637	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
645	NC_022658	GA	3	6	115620	115625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
646	NC_022658	CAT	2	6	115644	115649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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648	NC_022658	GC	3	6	115670	115675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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652	NC_022658	GC	3	6	116425	116430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
653	NC_022658	GC	3	6	117033	117038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
654	NC_022658	CGG	2	6	117041	117046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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674	NC_022658	CG	3	6	118978	118983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
675	NC_022658	GC	4	8	118992	118999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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682	NC_022658	CG	3	6	121032	121037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
683	NC_022658	CGA	2	6	121122	121127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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782	NC_022658	GC	3	6	133066	133071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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981	NC_022658	CCGG	2	8	163327	163334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
982	NC_022658	CG	3	6	163371	163376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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