MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens CC178

Total Repeats: 1419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022653	TAAA	2	8	9719	9726	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022653	AGTC	2	8	9745	9752	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_022653	CCTG	2	8	9888	9895	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022653	GTGA	2	8	10170	10177	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022653	AGCC	2	8	11224	11231	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_022653	AAGC	2	8	11749	11756	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_022653	CACG	2	8	12445	12452	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_022653	GCGA	2	8	13233	13240	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_022653	TAGG	2	8	13808	13815	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022653	CGGG	2	8	13904	13911	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11	NC_022653	ATCG	2	8	14569	14576	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_022653	ATGA	2	8	17468	17475	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022653	AAGA	2	8	18827	18834	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022653	ATCT	2	8	18904	18911	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_022653	TGAA	2	8	26369	26376	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022653	ATTT	2	8	27624	27631	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022653	TAAG	2	8	27730	27737	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022653	GGAA	2	8	27792	27799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022653	ATAA	2	8	30076	30083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022653	TAAA	2	8	31457	31464	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022653	AGTC	2	8	31483	31490	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_022653	CCTG	2	8	31626	31633	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_022653	GTGA	2	8	31908	31915	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022653	AGCC	2	8	32962	32969	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_022653	AAGC	2	8	33487	33494	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_022653	CACG	2	8	34183	34190	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_022653	GCGA	2	8	34971	34978	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_022653	TAGG	2	8	35546	35553	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022653	CGGG	2	8	35642	35649	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_022653	ATCG	2	8	36307	36314	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_022653	AATA	2	8	36987	36994	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022653	AATG	2	8	40926	40933	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022653	ATTG	2	8	46366	46373	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022653	AGTA	2	8	46391	46398	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022653	TTTA	2	8	46573	46580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022653	ATAG	2	8	46635	46642	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022653	ATTC	2	8	52656	52663	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_022653	TGTA	2	8	56851	56858	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022653	CCCG	2	8	60504	60511	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_022653	GAGG	2	8	60557	60564	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022653	ATAA	2	8	61140	61147	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022653	TTTA	2	8	70610	70617	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022653	AAAC	2	8	70627	70634	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_022653	GCCG	2	8	75846	75853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_022653	CTGC	2	8	77908	77915	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_022653	TAAA	2	8	91485	91492	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022653	AGTC	2	8	91511	91518	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_022653	CCTG	2	8	91654	91661	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_022653	GTGA	2	8	91936	91943	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022653	AGCC	2	8	92990	92997	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_022653	AAGC	2	8	93341	93348	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_022653	CACG	2	8	94037	94044	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_022653	GCGA	2	8	94825	94832	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_022653	TAGG	2	8	95400	95407	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022653	CGGG	2	8	95496	95503	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56	NC_022653	ATCG	2	8	96161	96168	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_022653	CATT	2	8	96925	96932	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_022653	TTGA	2	8	97240	97247	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022653	TAAA	2	8	97312	97319	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022653	AGTC	2	8	97338	97345	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_022653	CCTG	2	8	97481	97488	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_022653	GTGA	2	8	97763	97770	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022653	AGCC	2	8	98817	98824	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_022653	AAGC	2	8	99168	99175	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_022653	CACG	2	8	99864	99871	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_022653	GCGA	2	8	100652	100659	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_022653	TAGG	2	8	101227	101234	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022653	CGGG	2	8	101323	101330	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
69	NC_022653	ATCG	2	8	101988	101995	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_022653	AGAA	2	8	113500	113507	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022653	TCTA	2	8	117538	117545	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_022653	AATG	2	8	118279	118286	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022653	GGGA	2	8	118806	118813	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022653	AGCT	2	8	119441	119448	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_022653	TCAT	2	8	119459	119466	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_022653	TGAT	2	8	126451	126458	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022653	TCGT	2	8	130969	130976	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_022653	AAAT	2	8	131060	131067	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022653	GCTT	2	8	133754	133761	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_022653	TAAA	2	8	136154	136161	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022653	GACG	2	8	139320	139327	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_022653	TATC	2	8	139556	139563	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_022653	CCGC	2	8	139713	139720	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
84	NC_022653	TTTC	2	8	140183	140190	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_022653	AGGA	2	8	140444	140451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022653	TACT	2	8	141468	141475	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_022653	AAAT	2	8	141784	141791	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022653	AAGG	2	8	142136	142143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022653	CAAA	2	8	144044	144051	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_022653	GTGA	2	8	145521	145528	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022653	ATCA	2	8	148409	148416	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_022653	TTTG	2	8	149729	149736	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022653	TTAT	2	8	149778	149785	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022653	GTAT	2	8	154717	154724	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022653	TTGT	2	8	155764	155771	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022653	TGGC	2	8	157185	157192	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_022653	GGGA	2	8	157685	157692	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022653	TCCT	2	8	160142	160149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_022653	TAAA	2	8	161901	161908	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022653	AGTC	2	8	161927	161934	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_022653	CCTG	2	8	162070	162077	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_022653	GTGA	2	8	162352	162359	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022653	AGCC	2	8	163406	163413	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_022653	AAGC	2	8	163757	163764	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_022653	CACG	2	8	164453	164460	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_022653	GCGA	2	8	165241	165248	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_022653	TAGG	2	8	165816	165823	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022653	CGGG	2	8	165912	165919	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_022653	ATCG	2	8	166577	166584	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_022653	TAAT	2	8	167120	167127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022653	AATA	2	8	167235	167242	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022653	ATTG	2	8	167402	167409	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022653	TAAA	2	8	167839	167846	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022653	AGTC	2	8	167865	167872	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_022653	CCTG	2	8	168008	168015	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_022653	GTGA	2	8	168290	168297	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022653	AGCC	2	8	169344	169351	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_022653	AAGC	2	8	169695	169702	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_022653	CACG	2	8	170391	170398	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_022653	GCGA	2	8	171179	171186	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_022653	TAGG	2	8	171754	171761	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022653	CGGG	2	8	171850	171857	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_022653	ATCG	2	8	172515	172522	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_022653	AAGA	2	8	174158	174165	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022653	TTAT	2	8	177511	177518	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022653	AATG	2	8	179207	179214	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022653	TACA	2	8	180867	180874	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_022653	CATT	2	8	185668	185675	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_022653	AAAT	2	8	185708	185715	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022653	TCCC	2	8	190295	190302	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
131	NC_022653	CCTG	2	8	194496	194503	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_022653	TTTG	2	8	202085	202092	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022653	AATC	2	8	202291	202298	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_022653	AGTC	2	8	204498	204505	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_022653	CTTC	2	8	204915	204922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_022653	TGGC	2	8	206818	206825	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_022653	ATTT	2	8	207077	207084	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022653	ATTT	2	8	207115	207122	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022653	TAAA	2	8	207346	207353	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022653	ATTT	2	8	207481	207488	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022653	TCTG	2	8	207555	207562	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_022653	AACA	2	8	207593	207600	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_022653	AGTA	2	8	207613	207620	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022653	TAAA	2	8	210891	210898	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022653	TTAG	2	8	210976	210983	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022653	GGAA	2	8	212183	212190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022653	AGGG	2	8	222586	222593	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022653	ATGA	2	8	225850	225857	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022653	AATG	2	8	225944	225951	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022653	AATA	2	8	226066	226073	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022653	AATA	3	12	226126	226137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022653	TTTA	2	8	226259	226266	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022653	TGAG	2	8	227530	227537	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_022653	AAGA	2	8	227796	227803	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
155	NC_022653	AAAT	2	8	227817	227824	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_022653	CCGC	2	8	227924	227931	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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158	NC_022653	TCCA	2	8	230446	230453	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_022653	AATA	2	8	230545	230552	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_022653	AGGA	3	12	235579	235590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_022653	AATA	2	8	329991	329998	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_022653	GATA	2	8	366648	366655	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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