MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Blattabacterium sp. (Nauphoeta cinerea)

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022550	TAAATT	2	12	6249	6260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022550	AAAAAT	2	12	16043	16054	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022550	ATTTTT	2	12	17366	17377	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022550	GATTCC	2	12	38734	38745	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022550	ATTTTT	2	12	47763	47774	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022550	TATTTT	2	12	65949	65960	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022550	ATAAAA	2	12	91479	91490	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022550	TTTTAT	2	12	102303	102314	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022550	TAATTT	2	12	128996	129007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022550	TTTATT	2	12	140438	140449	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022550	AAATTA	2	12	140556	140567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022550	TGTATT	2	12	155148	155159	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022550	ATTTCT	2	12	155187	155198	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_022550	TTTTCT	2	12	155211	155222	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_022550	TGTTAT	2	12	155712	155723	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022550	TTTTTG	2	12	164203	164214	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022550	TGTATT	2	12	166005	166016	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022550	TATGAA	2	12	175786	175797	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022550	ATGTTA	2	12	221878	221889	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022550	TATTAA	2	12	228880	228891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022550	TAATAT	2	12	233240	233251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022550	TCCTTA	2	12	267309	267320	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_022550	ATAAAA	2	12	273364	273375	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022550	TTTTTC	2	12	294007	294018	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_022550	TTAAAA	2	12	313733	313744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022550	TAAAAA	2	12	315516	315527	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022550	TTTTAT	2	12	332416	332427	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022550	AATAAA	2	12	404735	404746	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022550	TCTATT	2	12	511612	511623	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_022550	CATATA	2	12	515363	515374	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_022550	ATTTTT	2	12	529455	529466	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022550	TCTTTT	2	12	534397	534408	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_022550	TAAAAA	2	12	544587	544598	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022550	TATTTT	2	12	549644	549655	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022550	AAATTT	2	12	584357	584368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022550	AAAATT	2	12	600081	600092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.