MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5113

Total Repeats: 1491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022081	TAAA	2	8	9755	9762	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022081	AGTC	2	8	9781	9788	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_022081	CCTG	2	8	9924	9931	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022081	GTGA	2	8	10206	10213	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022081	AGCC	2	8	11260	11267	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_022081	AAGC	2	8	11611	11618	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_022081	CACG	2	8	12307	12314	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_022081	GCGA	2	8	13095	13102	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_022081	TAGG	2	8	13670	13677	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022081	CGGG	2	8	13766	13773	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11	NC_022081	ATCG	2	8	14431	14438	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_022081	ATGA	2	8	17330	17337	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022081	AAGA	2	8	18688	18695	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022081	ATCT	2	8	18765	18772	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_022081	TGAA	2	8	26230	26237	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022081	ATTT	2	8	27485	27492	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022081	TAAG	2	8	27591	27598	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022081	GGAA	2	8	27653	27660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022081	ATCA	2	8	27763	27770	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_022081	ATAA	2	8	29937	29944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022081	TAAA	2	8	31318	31325	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022081	AGTC	2	8	31344	31351	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_022081	CCTG	2	8	31487	31494	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_022081	GTGA	2	8	31769	31776	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022081	AGCC	2	8	32823	32830	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_022081	AAGC	2	8	33174	33181	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_022081	CACG	2	8	33870	33877	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_022081	GCGA	2	8	34658	34665	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_022081	TAGG	2	8	35233	35240	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022081	CGGG	2	8	35329	35336	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_022081	ATCG	2	8	35994	36001	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_022081	AATA	2	8	36676	36683	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022081	AATG	2	8	40615	40622	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022081	ATTG	2	8	46055	46062	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022081	AGTA	2	8	46080	46087	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022081	TTTA	2	8	46262	46269	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022081	ATAG	2	8	46324	46331	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022081	CTTC	2	8	49322	49329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_022081	ATTC	2	8	52345	52352	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_022081	TGTA	2	8	56539	56546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022081	CCCG	2	8	60192	60199	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_022081	GAGG	2	8	60245	60252	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022081	ATAA	2	8	60828	60835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022081	TTTA	2	8	70298	70305	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022081	AAAC	2	8	70315	70322	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_022081	GCCG	2	8	75534	75541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_022081	CTGC	2	8	77596	77603	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_022081	TAAA	2	8	91173	91180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022081	AGTC	2	8	91199	91206	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_022081	CCTG	2	8	91342	91349	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_022081	GTGA	2	8	91624	91631	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022081	AGCC	2	8	92678	92685	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_022081	AAGC	2	8	93087	93094	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_022081	CACG	2	8	93783	93790	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_022081	GCGA	2	8	94571	94578	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_022081	TAGG	2	8	95146	95153	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022081	CGGG	2	8	95242	95249	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_022081	ATCG	2	8	95907	95914	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_022081	CATT	2	8	96671	96678	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_022081	TAAA	2	8	97056	97063	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022081	AGTC	2	8	97082	97089	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_022081	CCTG	2	8	97225	97232	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_022081	GTGA	2	8	97507	97514	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022081	AGCC	2	8	98561	98568	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_022081	AAGC	2	8	98970	98977	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_022081	CACG	2	8	99666	99673	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_022081	GCGA	2	8	100454	100461	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_022081	TAGG	2	8	101029	101036	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022081	CGGG	2	8	101125	101132	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_022081	ATCG	2	8	101790	101797	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_022081	GATT	2	8	102680	102687	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022081	AGAA	2	8	113303	113310	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022081	TCTA	2	8	117341	117348	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_022081	AATG	2	8	118082	118089	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022081	AGCT	2	8	119245	119252	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_022081	TCAT	2	8	119263	119270	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_022081	TGAT	2	8	126255	126262	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022081	AAAT	2	8	130864	130871	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022081	GCTT	2	8	133558	133565	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_022081	TAAA	2	8	135958	135965	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022081	AAAT	2	8	141588	141595	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022081	AAGG	2	8	141940	141947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022081	ATCA	2	8	148213	148220	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_022081	TAAT	2	8	148726	148733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022081	TTTG	2	8	149533	149540	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022081	GTAT	2	8	154521	154528	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022081	TTGT	2	8	155568	155575	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022081	TGGC	2	8	156989	156996	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_022081	GGGA	2	8	157489	157496	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022081	TCCT	2	8	159946	159953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_022081	TAAA	2	8	161704	161711	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022081	AGTC	2	8	161730	161737	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_022081	CCTG	2	8	161873	161880	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_022081	GTGA	2	8	162155	162162	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022081	AGCC	2	8	163209	163216	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_022081	AAGC	2	8	163560	163567	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_022081	CACG	2	8	164256	164263	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_022081	GCGA	2	8	165044	165051	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_022081	TAGG	2	8	165619	165626	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022081	CGGG	2	8	165715	165722	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_022081	ATCG	2	8	166380	166387	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_022081	CTTT	2	8	166893	166900	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_022081	TAAT	2	8	166923	166930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022081	AATA	2	8	167038	167045	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022081	ATTG	2	8	167205	167212	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022081	AGCC	2	8	168125	168132	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_022081	AAGC	2	8	168650	168657	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_022081	CACG	2	8	169346	169353	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_022081	GCGA	2	8	170134	170141	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_022081	TAGG	2	8	170709	170716	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022081	CGGG	2	8	170805	170812	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_022081	ATCG	2	8	171470	171477	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_022081	TAAA	2	8	171976	171983	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022081	AGTC	2	8	172002	172009	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_022081	CCTG	2	8	172145	172152	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_022081	GTGA	2	8	172427	172434	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022081	AGCC	2	8	173481	173488	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_022081	AAGC	2	8	173832	173839	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_022081	CACG	2	8	174528	174535	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_022081	GCGA	2	8	175316	175323	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_022081	TAGG	2	8	175891	175898	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022081	CGGG	2	8	175987	175994	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_022081	ATCG	2	8	176652	176659	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_022081	AAGA	2	8	178295	178302	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022081	TTAT	2	8	181648	181655	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022081	AATG	2	8	183343	183350	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022081	CATT	2	8	189804	189811	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_022081	AAAT	2	8	189844	189851	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022081	TCCC	2	8	194431	194438	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
130	NC_022081	CCTG	2	8	198631	198638	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_022081	AATA	2	8	205956	205963	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022081	TTTG	2	8	206222	206229	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022081	AAGT	2	8	206368	206375	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022081	AATC	2	8	206419	206426	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_022081	AATG	2	8	210857	210864	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022081	AAAT	2	8	212076	212083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022081	TGTT	2	8	212197	212204	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022081	GGAA	2	8	213177	213184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022081	AGGG	2	8	223580	223587	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022081	ATGA	2	8	226874	226881	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022081	AATG	2	8	226969	226976	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022081	TTTA	2	8	227922	227929	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022081	TGAG	2	8	229186	229193	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022081	TTTG	2	8	229492	229499	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022081	TAAT	2	8	229539	229546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022081	CCGC	2	8	229578	229585	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
147	NC_022081	TATG	2	8	232014	232021	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022081	TCCA	2	8	232099	232106	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_022081	AATA	2	8	232198	232205	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022081	TTCA	2	8	236909	236916	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_022081	AGGA	3	12	237233	237244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022081	TATC	2	8	239581	239588	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_022081	AGGG	2	8	239637	239644	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
154	NC_022081	TCAT	2	8	241013	241020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
155	NC_022081	ACGG	2	8	243438	243445	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
156	NC_022081	GAAA	2	8	245883	245890	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
157	NC_022081	AAAG	2	8	246134	246141	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
158	NC_022081	CCTT	2	8	249729	249736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_022081	AGTA	2	8	255141	255148	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
160	NC_022081	GACA	2	8	255432	255439	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
161	NC_022081	GAAG	2	8	255523	255530	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
162	NC_022081	TTTC	2	8	255731	255738	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
163	NC_022081	ACAT	2	8	259024	259031	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
164	NC_022081	TGTC	2	8	260562	260569	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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166	NC_022081	CAGG	2	8	271389	271396	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
167	NC_022081	TCTA	2	8	271410	271417	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
168	NC_022081	AAGG	2	8	271437	271444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
169	NC_022081	TTTG	2	8	277048	277055	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
170	NC_022081	AAGG	2	8	282088	282095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
171	NC_022081	GGAG	2	8	287543	287550	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
172	NC_022081	TCCT	2	8	287559	287566	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
173	NC_022081	GCTT	2	8	290334	290341	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
174	NC_022081	CTGT	2	8	291672	291679	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
175	NC_022081	TTTG	2	8	291962	291969	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
176	NC_022081	CTGT	2	8	296188	296195	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
177	NC_022081	CAGT	2	8	298504	298511	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
178	NC_022081	TACT	2	8	303333	303340	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
179	NC_022081	ATGA	2	8	303938	303945	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_022081	AATT	2	8	309854	309861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_022081	TTTC	2	8	311234	311241	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
183	NC_022081	AAAC	2	8	313212	313219	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
184	NC_022081	TCCG	2	8	315133	315140	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
185	NC_022081	TGAT	2	8	332239	332246	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
186	NC_022081	AATA	2	8	332283	332290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_022081	ATCA	2	8	338077	338084	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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190	NC_022081	AGGA	2	8	339833	339840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
191	NC_022081	GTTT	2	8	340280	340287	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
192	NC_022081	TACG	2	8	340319	340326	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
193	NC_022081	AAAT	2	8	340417	340424	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_022081	CTGT	2	8	366983	366990	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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199	NC_022081	CTTT	2	8	376111	376118	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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