MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia miyamotoi LB-2001

Total Repeats: 344

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022079	TCCC	2	8	1079	1086	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_022079	AAAT	2	8	2012	2019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022079	CATA	2	8	2223	2230	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_022079	TAAT	2	8	2264	2271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022079	TAAT	2	8	2278	2285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022079	ATTC	2	8	2375	2382	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_022079	CTTA	2	8	2419	2426	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_022079	ATTC	2	8	2864	2871	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_022079	TTCA	2	8	2872	2879	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_022079	TGGT	2	8	2918	2925	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022079	ACAA	2	8	3164	3171	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_022079	TAAA	2	8	7338	7345	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022079	AATA	2	8	15711	15718	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022079	TAAT	2	8	19869	19876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022079	TAAT	2	8	28923	28930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022079	TAAA	2	8	31700	31707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022079	AATA	2	8	40429	40436	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022079	ACAA	2	8	45038	45045	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_022079	AAGC	2	8	46430	46437	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_022079	ACAT	2	8	47848	47855	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_022079	ACAT	2	8	47907	47914	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_022079	ATCA	2	8	47988	47995	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_022079	AAAT	2	8	48889	48896	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022079	AATT	3	12	53038	53049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022079	ATAA	2	8	56746	56753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022079	TAAT	2	8	56758	56765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022079	TAAT	2	8	56772	56779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022079	AAGC	2	8	62682	62689	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_022079	TTTA	2	8	62755	62762	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022079	ATAA	2	8	74189	74196	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022079	CATA	2	8	79138	79145	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_022079	ATTT	2	8	83667	83674	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022079	ATCT	2	8	85425	85432	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_022079	TAAA	2	8	85513	85520	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022079	ATAA	2	8	85521	85528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022079	TTAA	2	8	93746	93753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022079	TTTC	2	8	98243	98250	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_022079	ATAG	2	8	98325	98332	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022079	TTAA	2	8	100954	100961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022079	TTAA	2	8	101029	101036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022079	TTAT	2	8	101049	101056	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022079	AAAT	2	8	106652	106659	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022079	CAAA	2	8	107868	107875	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_022079	ATTA	2	8	107968	107975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022079	ATAA	2	8	112934	112941	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022079	ATTT	2	8	114815	114822	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022079	TTTA	2	8	115659	115666	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022079	AATA	2	8	121045	121052	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022079	TATT	2	8	131741	131748	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022079	AAAT	2	8	139367	139374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022079	TAAC	2	8	139547	139554	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_022079	GATT	2	8	139663	139670	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022079	ACTA	2	8	140013	140020	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_022079	AGGA	2	8	140737	140744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022079	GTTT	2	8	140823	140830	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022079	CAAA	2	8	140959	140966	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_022079	GATA	2	8	141232	141239	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022079	CATA	2	8	141676	141683	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_022079	TAAA	2	8	142731	142738	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022079	ATAA	2	8	143016	143023	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022079	AATA	2	8	143037	143044	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022079	ATAA	2	8	151043	151050	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022079	AAAC	2	8	151071	151078	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_022079	TCTA	2	8	152372	152379	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_022079	CAAA	2	8	153227	153234	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_022079	ATTT	2	8	156705	156712	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022079	AAAT	2	8	158749	158756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022079	TAAA	2	8	158851	158858	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022079	ATGA	2	8	158870	158877	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022079	GTTA	2	8	158904	158911	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022079	ATCA	2	8	161647	161654	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_022079	AAAT	2	8	166569	166576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022079	TAAT	2	8	168138	168145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022079	TTAA	2	8	188446	188453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022079	CAAA	2	8	188756	188763	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_022079	TTAT	2	8	192270	192277	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022079	ACTA	2	8	201271	201278	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_022079	ACAA	2	8	201404	201411	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_022079	ACAA	2	8	204828	204835	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_022079	TGTA	2	8	205177	205184	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022079	AAAT	2	8	205248	205255	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022079	AATT	2	8	227328	227335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022079	TTAT	2	8	227701	227708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022079	ATTA	2	8	228116	228123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022079	AAAT	3	12	228178	228189	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022079	TTAA	2	8	229844	229851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022079	AAGG	2	8	245359	245366	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022079	TAAA	2	8	253333	253340	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022079	TAAT	2	8	257337	257344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022079	TATT	2	8	257455	257462	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022079	TAAT	2	8	275405	275412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022079	TTTA	2	8	275437	275444	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022079	AATG	2	8	278741	278748	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022079	ACTT	2	8	312193	312200	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_022079	AAAT	2	8	312368	312375	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022079	TAAA	2	8	312719	312726	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022079	AAAT	2	8	312790	312797	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022079	ACTT	2	8	312902	312909	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_022079	TTAA	2	8	322741	322748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022079	AGCT	2	8	329599	329606	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_022079	AGGA	2	8	331288	331295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022079	TTTA	2	8	337929	337936	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022079	CTTG	2	8	339833	339840	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_022079	TAAA	2	8	339898	339905	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022079	ATAG	2	8	341573	341580	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022079	TCTA	2	8	341610	341617	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_022079	ATAA	2	8	341651	341658	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022079	ACAA	2	8	341850	341857	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_022079	AAAC	2	8	341937	341944	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_022079	AAAT	2	8	342048	342055	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022079	TTGT	2	8	346949	346956	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022079	AAAT	2	8	348354	348361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022079	AATA	2	8	357311	357318	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022079	TTAT	2	8	357369	357376	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022079	TATT	2	8	360551	360558	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022079	CAAA	2	8	360565	360572	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_022079	AATA	2	8	363099	363106	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022079	ACTG	2	8	363189	363196	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_022079	AAGC	2	8	363245	363252	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_022079	TAAA	3	12	370303	370314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022079	TAAA	2	8	372937	372944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022079	TTAT	2	8	382767	382774	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022079	TATT	2	8	392258	392265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022079	AAAG	2	8	392395	392402	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022079	TAAA	2	8	393534	393541	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022079	TTCA	2	8	393669	393676	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_022079	AAAT	2	8	413444	413451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022079	ACTA	2	8	415090	415097	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_022079	AAAT	2	8	417298	417305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022079	CTAT	2	8	417674	417681	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_022079	ATTT	2	8	417691	417698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022079	TAAA	2	8	418021	418028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022079	ATTC	2	8	418035	418042	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_022079	ACTT	2	8	418765	418772	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_022079	CTTT	2	8	419434	419441	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_022079	AAAT	2	8	419781	419788	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022079	CTTA	2	8	419929	419936	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_022079	ATTC	2	8	420024	420031	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_022079	TTAC	2	8	420058	420065	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_022079	ATTT	2	8	420102	420109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022079	AGAA	2	8	420337	420344	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022079	TATT	2	8	420447	420454	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022079	TAAA	2	8	420737	420744	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022079	AGGC	2	8	420778	420785	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_022079	TTAA	2	8	420838	420845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022079	TTAG	2	8	421071	421078	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022079	ACAT	2	8	421378	421385	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_022079	ACAT	2	8	421601	421608	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_022079	ATTT	2	8	421782	421789	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022079	ACCA	2	8	422935	422942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_022079	TTAT	2	8	423062	423069	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022079	TTCT	2	8	423258	423265	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_022079	TAAG	2	8	423347	423354	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.