MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi CA382

Total Repeats: 327

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022048	AAGT	2	8	7442	7449	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022048	TTAT	2	8	8356	8363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022048	TAAT	2	8	19992	19999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022048	ATTT	2	8	25699	25706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022048	ATTT	2	8	38127	38134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022048	ATTT	2	8	40726	40733	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022048	AATT	2	8	46425	46432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022048	GCTA	2	8	46455	46462	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_022048	AAGC	2	8	46851	46858	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_022048	AATC	2	8	47880	47887	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_022048	ATTT	2	8	59054	59061	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022048	CAAA	2	8	60552	60559	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_022048	GAAA	2	8	70144	70151	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022048	AAAT	2	8	70152	70159	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022048	ATCA	2	8	74637	74644	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_022048	ATAA	2	8	74770	74777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022048	AAAT	2	8	75087	75094	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022048	ATTA	2	8	75158	75165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022048	AATT	2	8	75201	75208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022048	GAAT	2	8	75253	75260	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022048	AGCA	2	8	75319	75326	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_022048	ATTC	2	8	75452	75459	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_022048	AAAT	2	8	79377	79384	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022048	CAAA	2	8	94082	94089	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_022048	AAAG	2	8	100209	100216	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022048	ATTT	2	8	101382	101389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022048	TTTA	2	8	108237	108244	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022048	TTAG	2	8	112822	112829	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022048	TACT	2	8	114675	114682	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_022048	CAAG	2	8	114713	114720	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_022048	ATAA	2	8	114777	114784	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022048	ATTT	2	8	138291	138298	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022048	CAAA	2	8	138335	138342	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_022048	ATTA	2	8	144275	144282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022048	AAAT	2	8	150860	150867	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022048	TAAA	2	8	150956	150963	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022048	GGTA	2	8	156404	156411	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022048	GCTT	2	8	156496	156503	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_022048	AAAT	2	8	156677	156684	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022048	AAAC	2	8	156742	156749	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_022048	ATAA	2	8	157299	157306	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022048	TAAA	2	8	158511	158518	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022048	AAAT	2	8	163050	163057	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022048	CTTA	2	8	163061	163068	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_022048	ATTA	2	8	169414	169421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022048	TAAA	2	8	169428	169435	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022048	ATTT	2	8	171526	171533	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022048	TAAT	2	8	182872	182879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022048	AAAT	2	8	188512	188519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022048	TTTA	2	8	188551	188558	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022048	ATCT	2	8	189059	189066	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_022048	TCAA	2	8	190020	190027	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_022048	AAAT	2	8	191498	191505	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022048	TAAA	2	8	191511	191518	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022048	TATT	2	8	193662	193669	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022048	TTTA	2	8	206133	206140	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022048	ATTT	2	8	206410	206417	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022048	ATTT	2	8	206501	206508	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022048	AATA	2	8	229172	229179	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022048	AATA	2	8	231594	231601	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022048	TCAA	2	8	238290	238297	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_022048	AAAT	2	8	239137	239144	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022048	TAAA	2	8	245403	245410	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022048	TTAA	2	8	245572	245579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022048	TTAA	2	8	245695	245702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022048	AATT	2	8	250091	250098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022048	ATTT	2	8	252285	252292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022048	ATTA	2	8	263914	263921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022048	TGAA	2	8	276534	276541	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022048	GCTT	2	8	276607	276614	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_022048	CCTC	2	8	303749	303756	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
72	NC_022048	ATTA	2	8	326309	326316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022048	TAAA	2	8	326347	326354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022048	ATAA	2	8	330772	330779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022048	TTTA	2	8	334576	334583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022048	AATA	2	8	334613	334620	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022048	CATA	2	8	334831	334838	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_022048	AAAT	2	8	334854	334861	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022048	GAAA	2	8	336570	336577	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022048	AAAC	2	8	336603	336610	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_022048	TAAA	2	8	338252	338259	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022048	CTTT	2	8	344943	344950	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_022048	TAAA	2	8	346403	346410	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022048	TCAT	2	8	347345	347352	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_022048	TATT	2	8	355360	355367	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022048	ATAG	2	8	365629	365636	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022048	ATTT	2	8	365687	365694	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022048	CAAT	2	8	365965	365972	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_022048	TCTG	2	8	366207	366214	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_022048	ATTC	2	8	368403	368410	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_022048	ATTT	2	8	368764	368771	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022048	AATA	2	8	374214	374221	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022048	ATTT	2	8	374222	374229	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022048	ATAG	2	8	384231	384238	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022048	TATT	2	8	391863	391870	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022048	AATA	2	8	391878	391885	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022048	CAAA	2	8	392994	393001	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_022048	ACAA	2	8	394089	394096	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_022048	TTTA	2	8	395264	395271	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022048	TCCT	2	8	409416	409423	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_022048	AAAT	2	8	411457	411464	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022048	TATT	2	8	413075	413082	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022048	TTAT	2	8	416576	416583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022048	AATT	2	8	416584	416591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022048	CTTA	2	8	416596	416603	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_022048	AAGC	2	8	418383	418390	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_022048	AAAT	2	8	424536	424543	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022048	TTAT	2	8	424666	424673	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022048	TAAA	2	8	428647	428654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022048	AAAT	2	8	435162	435169	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022048	AAGG	2	8	435456	435463	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022048	TACG	2	8	436505	436512	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_022048	ACCT	2	8	436569	436576	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_022048	CTAC	2	8	436639	436646	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_022048	GTTT	2	8	437400	437407	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022048	CTAA	2	8	437535	437542	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_022048	TCGC	2	8	438025	438032	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_022048	TAGC	2	8	438124	438131	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_022048	ATTT	2	8	438303	438310	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022048	TACG	2	8	439750	439757	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_022048	ACCT	2	8	439814	439821	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_022048	CTAC	2	8	439884	439891	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_022048	GTTT	2	8	440645	440652	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022048	CTAA	2	8	440780	440787	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_022048	TCGC	2	8	441270	441277	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_022048	TAGC	2	8	441369	441376	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_022048	AAAT	2	8	441684	441691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022048	TAAA	2	8	443385	443392	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022048	TAAA	2	8	443599	443606	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022048	TAAT	2	8	443749	443756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022048	CTAA	2	8	444085	444092	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_022048	GCTT	2	8	444196	444203	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_022048	ATAA	2	8	444500	444507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022048	TTCT	2	8	445414	445421	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_022048	CTTA	2	8	446182	446189	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_022048	AATC	2	8	446920	446927	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_022048	AATA	2	8	446941	446948	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022048	ATAA	2	8	447682	447689	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022048	TTAC	2	8	447735	447742	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_022048	AAAG	2	8	447847	447854	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022048	AAAC	2	8	448641	448648	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_022048	AATA	2	8	448671	448678	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022048	CATT	2	8	456406	456413	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_022048	TAGA	2	8	456511	456518	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022048	GCTT	2	8	462791	462798	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_022048	TTAT	2	8	463962	463969	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022048	ATTT	2	8	465306	465313	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022048	TTGA	2	8	465352	465359	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022048	TAAT	3	12	465365	465376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022048	TTGT	2	8	472514	472521	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_022048	GGAA	2	8	472559	472566	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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302	NC_022048	TTAA	2	8	839092	839099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
303	NC_022048	TTCT	2	8	839183	839190	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
304	NC_022048	TATT	2	8	839205	839212	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
305	NC_022048	TTTA	2	8	847118	847125	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
306	NC_022048	AGGT	2	8	860439	860446	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
307	NC_022048	TGAT	2	8	869449	869456	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
308	NC_022048	ATTA	2	8	888219	888226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.