MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia pseudomallei MSHR305 chromosome 1

Total Repeats: 18102

< Previous12...25262728293031323334353637Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_021877	GTC	2	6	3344713	3344718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18002	NC_021877	GAAG	2	8	3344775	3344782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18003	NC_021877	GCAG	2	8	3344788	3344795	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18004	NC_021877	GAC	2	6	3344796	3344801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18005	NC_021877	GCGCG	2	10	3344823	3344832	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18006	NC_021877	TCGAT	2	10	3345146	3345155	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18007	NC_021877	GAATT	2	10	3345230	3345239	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18008	NC_021877	TC	3	6	3345282	3345287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18009	NC_021877	GCG	2	6	3345300	3345305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18010	NC_021877	GCG	2	6	3345321	3345326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18011	NC_021877	CGCC	2	8	3345359	3345366	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18012	NC_021877	CGT	2	6	3345390	3345395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18013	NC_021877	CG	5	10	3345403	3345412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18014	NC_021877	TCGA	2	8	3345446	3345453	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18015	NC_021877	CATCG	2	10	3345456	3345465	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18016	NC_021877	CGCA	2	8	3345480	3345487	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18017	NC_021877	CG	3	6	3345519	3345524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18018	NC_021877	GACG	2	8	3345550	3345557	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18019	NC_021877	GCGT	2	8	3345572	3345579	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18020	NC_021877	CGTG	2	8	3345600	3345607	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18021	NC_021877	CGGC	2	8	3345626	3345633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18022	NC_021877	CGTCGG	2	12	3345648	3345659	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18023	NC_021877	AGT	2	6	3345697	3345702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18024	NC_021877	CAG	2	6	3345703	3345708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18025	NC_021877	GCC	2	6	3345727	3345732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18026	NC_021877	GAA	2	6	3345774	3345779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18027	NC_021877	GCG	2	6	3345858	3345863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18028	NC_021877	CG	3	6	3345862	3345867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18029	NC_021877	GGC	2	6	3345880	3345885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18030	NC_021877	CGG	2	6	3345936	3345941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18031	NC_021877	CGA	2	6	3345979	3345984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18032	NC_021877	CGA	2	6	3345987	3345992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18033	NC_021877	CG	4	8	3345994	3346001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18034	NC_021877	GC	3	6	3346007	3346012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18035	NC_021877	CGA	2	6	3347106	3347111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18036	NC_021877	CG	3	6	3347201	3347206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18037	NC_021877	CGC	2	6	3347208	3347213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18038	NC_021877	AC	3	6	3347217	3347222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18039	NC_021877	AAC	2	6	3348103	3348108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18040	NC_021877	T	6	6	3348123	3348128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18041	NC_021877	CGA	2	6	3349374	3349379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18042	NC_021877	CGC	2	6	3349385	3349390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18043	NC_021877	GC	3	6	3349395	3349400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18044	NC_021877	CAGA	2	8	3349406	3349413	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18045	NC_021877	GCG	3	9	3354154	3354162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18046	NC_021877	CGG	2	6	3354171	3354176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18047	NC_021877	GCC	2	6	3354180	3354185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18048	NC_021877	CGC	2	6	3354191	3354196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18049	NC_021877	TGCC	2	8	3354202	3354209	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18050	NC_021877	GC	3	6	3354211	3354216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18051	NC_021877	CGA	2	6	3354222	3354227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18052	NC_021877	GCG	2	6	3354244	3354249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18053	NC_021877	GGC	2	6	3354280	3354285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18054	NC_021877	GC	3	6	3354284	3354289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18055	NC_021877	ATCG	2	8	3354297	3354304	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18056	NC_021877	CG	3	6	3354303	3354308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18057	NC_021877	GA	3	6	3354332	3354337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18058	NC_021877	GCG	2	6	3354353	3354358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18059	NC_021877	CG	3	6	3354504	3354509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18060	NC_021877	CGA	2	6	3354557	3354562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18061	NC_021877	CGG	2	6	3354597	3354602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18062	NC_021877	GC	3	6	3354618	3354623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18063	NC_021877	TGC	2	6	3354643	3354648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18064	NC_021877	GCG	2	6	3354696	3354701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18065	NC_021877	GTTT	2	8	3357006	3357013	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18066	NC_021877	ATTT	2	8	3357039	3357046	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18067	NC_021877	AAC	2	6	3357071	3357076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18068	NC_021877	T	6	6	3357082	3357087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18069	NC_021877	CAAT	2	8	3357122	3357129	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18070	NC_021877	T	6	6	3357129	3357134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18071	NC_021877	CG	3	6	3357622	3357627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18072	NC_021877	GCCGC	2	10	3357635	3357644	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18073	NC_021877	CG	3	6	3357662	3357667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18074	NC_021877	GGC	2	6	3357668	3357673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18075	NC_021877	CGC	2	6	3357691	3357696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18076	NC_021877	GCGCG	2	10	3357697	3357706	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18077	NC_021877	GC	3	6	3357752	3357757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18078	NC_021877	TGC	2	6	3357803	3357808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18079	NC_021877	CGG	2	6	3358748	3358753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18080	NC_021877	CGG	2	6	3358782	3358787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18081	NC_021877	GC	3	6	3358793	3358798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18082	NC_021877	GC	3	6	3358815	3358820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18083	NC_021877	CGG	2	6	3358846	3358851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18084	NC_021877	GC	3	6	3358853	3358858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18085	NC_021877	GCG	3	9	3358881	3358889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18086	NC_021877	CGG	2	6	3358895	3358900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18087	NC_021877	CCGCAC	2	12	3358907	3358918	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
18088	NC_021877	CCGAAC	2	12	3358919	3358930	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18089	NC_021877	CCGCAG	3	18	3358931	3358948	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18090	NC_021877	CGG	2	6	3358980	3358985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18091	NC_021877	CG	3	6	3358999	3359004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18092	NC_021877	CGC	2	6	3359007	3359012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18093	NC_021877	GCGCG	2	10	3359019	3359028	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18094	NC_021877	CG	3	6	3359030	3359035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18095	NC_021877	CG	3	6	3359069	3359074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18096	NC_021877	GCCGC	2	10	3359102	3359111	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18097	NC_021877	CG	3	6	3359115	3359120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18098	NC_021877	GCG	2	6	3362378	3362383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18099	NC_021877	GCGCG	2	10	3362391	3362400	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18100	NC_021877	GTTGAG	2	12	3364279	3364290	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
18101	NC_021877	GGC	2	6	3373855	3373860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18102	NC_021877	CG	3	6	3373862	3373867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

< Previous12...25262728293031323334353637Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.