MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p2 DNA

Total Repeats: 5027

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021295	CAG	2	6	255280	255285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_021295	CGT	2	6	255325	255330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_021295	GCAA	2	8	255359	255366	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4004	NC_021295	CGC	2	6	255399	255404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_021295	GAA	2	6	255457	255462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_021295	CGATGG	2	12	255522	255533	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4007	NC_021295	ATT	2	6	255535	255540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_021295	CGT	2	6	255541	255546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_021295	GAC	2	6	255673	255678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_021295	AACCG	2	10	255687	255696	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4011	NC_021295	ATC	2	6	255851	255856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_021295	GAT	2	6	255868	255873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_021295	CAT	2	6	255892	255897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_021295	CGA	2	6	255898	255903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_021295	TCG	2	6	255924	255929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_021295	ACGC	2	8	255952	255959	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4017	NC_021295	AAG	2	6	256117	256122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_021295	CAA	2	6	256173	256178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_021295	TGC	2	6	256183	256188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_021295	GCG	2	6	256260	256265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_021295	CAA	2	6	256311	256316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_021295	TCTA	2	8	256386	256393	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4023	NC_021295	CT	3	6	256457	256462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4024	NC_021295	GC	3	6	256709	256714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4025	NC_021295	CGA	2	6	256735	256740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_021295	ATC	2	6	256741	256746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_021295	CGC	2	6	256790	256795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4028	NC_021295	ACGC	2	8	256825	256832	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4029	NC_021295	CTG	2	6	256833	256838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_021295	GC	3	6	256908	256913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4031	NC_021295	AAG	2	6	256980	256985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_021295	AGGC	2	8	256998	257005	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4033	NC_021295	CGA	2	6	257036	257041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_021295	GCCT	2	8	257097	257104	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4035	NC_021295	ACG	2	6	257111	257116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_021295	AGC	2	6	257287	257292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_021295	TTG	2	6	257377	257382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_021295	CTC	2	6	257475	257480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4039	NC_021295	GCC	2	6	257482	257487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4040	NC_021295	GCCC	2	8	257501	257508	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4041	NC_021295	CTG	2	6	257517	257522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_021295	GGCG	2	8	257549	257556	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4043	NC_021295	TAG	2	6	257557	257562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_021295	GAT	2	6	257586	257591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_021295	CACC	2	8	257603	257610	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4046	NC_021295	AGT	2	6	257721	257726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_021295	T	6	6	257726	257731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_021295	ACT	2	6	257779	257784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_021295	AC	3	6	257813	257818	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4050	NC_021295	ACA	2	6	257850	257855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_021295	TCC	2	6	257999	258004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4052	NC_021295	AGC	2	6	258013	258018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_021295	CCG	2	6	258069	258074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4054	NC_021295	GC	4	8	258082	258089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4055	NC_021295	CGCGG	2	10	258205	258214	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4056	NC_021295	AGG	2	6	258307	258312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_021295	TCG	2	6	258340	258345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_021295	CGT	2	6	258347	258352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_021295	GCG	2	6	258388	258393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_021295	CAG	2	6	258441	258446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_021295	GAC	2	6	258507	258512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_021295	CG	3	6	258542	258547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4063	NC_021295	GT	3	6	258553	258558	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_021295	CG	3	6	258608	258613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4065	NC_021295	AGC	2	6	258703	258708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_021295	TGA	2	6	258746	258751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_021295	GGC	2	6	258767	258772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_021295	GAC	2	6	258792	258797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_021295	CACG	2	8	258848	258855	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4070	NC_021295	CG	3	6	258871	258876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4071	NC_021295	GTG	2	6	258922	258927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_021295	CAG	2	6	259040	259045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_021295	TCG	2	6	259101	259106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_021295	ATT	2	6	259108	259113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_021295	CGG	2	6	259204	259209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_021295	ACG	2	6	259311	259316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_021295	TCG	2	6	259323	259328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_021295	GCC	2	6	259387	259392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4079	NC_021295	GGC	2	6	259498	259503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_021295	CGCC	2	8	259579	259586	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4081	NC_021295	GC	3	6	259880	259885	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4082	NC_021295	CAA	2	6	259937	259942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_021295	ATTT	2	8	259954	259961	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_021295	CAA	3	9	259965	259973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_021295	CGTC	2	8	260067	260074	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4086	NC_021295	TCC	2	6	260153	260158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4087	NC_021295	TTGA	2	8	260172	260179	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_021295	CGA	2	6	260243	260248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_021295	GAC	2	6	260257	260262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_021295	TCA	2	6	260320	260325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_021295	CT	3	6	260335	260340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4092	NC_021295	GTC	2	6	260350	260355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_021295	TCG	2	6	260483	260488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_021295	GACC	2	8	260508	260515	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4095	NC_021295	ACC	2	6	260545	260550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4096	NC_021295	GC	3	6	260572	260577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4097	NC_021295	CTC	2	6	260607	260612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4098	NC_021295	AGC	2	6	260693	260698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_021295	TGGCC	2	10	260760	260769	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4100	NC_021295	AGC	2	6	260826	260831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_021295	CG	4	8	260894	260901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4102	NC_021295	GAC	2	6	261070	261075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_021295	TCGCGC	2	12	261178	261189	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4104	NC_021295	ATG	2	6	261294	261299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_021295	GA	3	6	261325	261330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_021295	GTC	2	6	261388	261393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_021295	CGC	2	6	261441	261446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4108	NC_021295	GCG	2	6	261535	261540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_021295	GCCA	2	8	261586	261593	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4110	NC_021295	GA	3	6	261611	261616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_021295	TCG	2	6	261662	261667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_021295	GCA	2	6	261679	261684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_021295	CGG	2	6	261731	261736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_021295	CGC	2	6	261786	261791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4115	NC_021295	GAA	2	6	261798	261803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_021295	GGT	2	6	261809	261814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_021295	GAT	2	6	261843	261848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_021295	AAGTAG	2	12	261859	261870	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_021295	CCT	2	6	261908	261913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4120	NC_021295	GAA	2	6	261930	261935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_021295	ATG	2	6	262033	262038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_021295	GCC	2	6	262045	262050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4123	NC_021295	GAT	2	6	262113	262118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_021295	CAA	2	6	262143	262148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_021295	TGA	2	6	262157	262162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_021295	GAA	2	6	262194	262199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_021295	GAC	2	6	262206	262211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_021295	CGA	2	6	262223	262228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_021295	AGC	2	6	262261	262266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_021295	CCA	2	6	262286	262291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4131	NC_021295	CCA	2	6	262298	262303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4132	NC_021295	GAT	2	6	262317	262322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_021295	CCA	2	6	262376	262381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4134	NC_021295	CTA	2	6	262451	262456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4135	NC_021295	CGAACA	2	12	262490	262501	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4136	NC_021295	ATG	2	6	262523	262528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_021295	GCC	2	6	262627	262632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4138	NC_021295	CCGGT	2	10	262742	262751	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4139	NC_021295	AGG	2	6	262753	262758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4140	NC_021295	AGC	2	6	262824	262829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4141	NC_021295	CGCA	2	8	262859	262866	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4142	NC_021295	CGATGC	2	12	262903	262914	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4143	NC_021295	ACG	2	6	262917	262922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4144	NC_021295	TGA	2	6	262933	262938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4145	NC_021295	GC	3	6	262958	262963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4146	NC_021295	GCG	2	6	262972	262977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4147	NC_021295	CAG	2	6	262988	262993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4148	NC_021295	GTA	2	6	263003	263008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4149	NC_021295	TCA	2	6	263017	263022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4150	NC_021295	TTG	2	6	263108	263113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4151	NC_021295	CTC	2	6	263121	263126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4152	NC_021295	AAT	2	6	263138	263143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4153	NC_021295	GC	3	6	263204	263209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4154	NC_021295	GTA	2	6	263221	263226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4155	NC_021295	GCA	2	6	263236	263241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4157	NC_021295	TC	3	6	263356	263361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4158	NC_021295	CGG	2	6	263398	263403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4160	NC_021295	ATG	2	6	263605	263610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4163	NC_021295	GC	3	6	263661	263666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4164	NC_021295	ACG	2	6	263734	263739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4165	NC_021295	GTC	2	6	263742	263747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4166	NC_021295	AGC	2	6	263809	263814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4168	NC_021295	ACC	2	6	264146	264151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4169	NC_021295	GTT	2	6	264234	264239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4182	NC_021295	AGA	2	6	265222	265227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4211	NC_021295	TCG	2	6	266619	266624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4243	NC_021295	CCG	2	6	268475	268480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4252	NC_021295	TGA	2	6	268686	268691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_021295	CG	3	6	268874	268879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4254	NC_021295	AC	3	6	268904	268909	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4255	NC_021295	TGA	2	6	268946	268951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4256	NC_021295	TC	3	6	268995	269000	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4257	NC_021295	CCT	2	6	269001	269006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4258	NC_021295	TCG	2	6	269051	269056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4259	NC_021295	ACG	2	6	269084	269089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4260	NC_021295	ATG	2	6	269141	269146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_021295	CG	4	8	269162	269169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4262	NC_021295	GC	5	10	269319	269328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4263	NC_021295	GC	3	6	269448	269453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4264	NC_021295	GCG	2	6	269546	269551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4266	NC_021295	CGT	2	6	269626	269631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4400	NC_021295	TACGCT	2	12	277096	277107	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4401	NC_021295	CTT	2	6	277134	277139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4402	NC_021295	GCG	2	6	277165	277170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4403	NC_021295	CTGA	2	8	277194	277201	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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