MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p2 DNA

Total Repeats: 5027

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_021295	CG	4	8	165977	165984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2002	NC_021295	TAT	2	6	166259	166264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_021295	TTGC	2	8	166300	166307	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2004	NC_021295	CATC	2	8	166337	166344	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2005	NC_021295	GAA	2	6	166396	166401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_021295	GC	3	6	166464	166469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2007	NC_021295	CG	3	6	166522	166527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2008	NC_021295	GCTCGC	2	12	166529	166540	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2009	NC_021295	CGC	2	6	166576	166581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2010	NC_021295	GC	3	6	166596	166601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2011	NC_021295	CAA	2	6	166615	166620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2012	NC_021295	TG	3	6	166626	166631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2013	NC_021295	CGCA	2	8	166688	166695	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2014	NC_021295	GCA	2	6	166711	166716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2015	NC_021295	GCG	2	6	166743	166748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2016	NC_021295	CAT	2	6	166781	166786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2017	NC_021295	GCC	2	6	166819	166824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2018	NC_021295	GCTCG	2	10	166879	166888	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2019	NC_021295	AAGA	2	8	166895	166902	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2020	NC_021295	GTCG	2	8	166955	166962	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2021	NC_021295	GCTC	2	8	166996	167003	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2022	NC_021295	TCATCG	2	12	167038	167049	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2023	NC_021295	CAG	2	6	167064	167069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2024	NC_021295	CA	5	10	167172	167181	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2025	NC_021295	CCG	2	6	167240	167245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2026	NC_021295	CAG	2	6	167274	167279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2030	NC_021295	GCC	2	6	167373	167378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2031	NC_021295	AGT	2	6	167384	167389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2032	NC_021295	CAC	2	6	167514	167519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2033	NC_021295	A	6	6	167526	167531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2034	NC_021295	GC	3	6	167537	167542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2035	NC_021295	GCAT	2	8	167653	167660	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2037	NC_021295	AGC	2	6	167686	167691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2038	NC_021295	TGAG	2	8	167933	167940	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2039	NC_021295	GCGG	2	8	168112	168119	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2040	NC_021295	CGC	2	6	168211	168216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2041	NC_021295	GTCG	2	8	168288	168295	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2042	NC_021295	GTC	2	6	168297	168302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2043	NC_021295	CCA	2	6	168368	168373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2044	NC_021295	CCG	2	6	168374	168379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2045	NC_021295	GCA	3	9	168395	168403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2046	NC_021295	CGGC	2	8	168410	168417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2047	NC_021295	GCTTCC	2	12	168427	168438	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2048	NC_021295	AGC	2	6	168511	168516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2049	NC_021295	AGAC	2	8	168551	168558	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2052	NC_021295	GC	3	6	168720	168725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2053	NC_021295	CG	3	6	168734	168739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2054	NC_021295	TCA	2	6	168745	168750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2055	NC_021295	CG	3	6	168792	168797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2056	NC_021295	GGTT	2	8	168803	168810	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2057	NC_021295	GCC	2	6	168819	168824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2062	NC_021295	GAA	2	6	169299	169304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2063	NC_021295	CGT	2	6	169310	169315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2064	NC_021295	AGC	2	6	169399	169404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2065	NC_021295	CCA	2	6	169463	169468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2066	NC_021295	TGG	2	6	169489	169494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2071	NC_021295	GAA	2	6	169850	169855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2099	NC_021295	TGCG	2	8	170802	170809	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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2105	NC_021295	CCGA	2	8	170903	170910	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2106	NC_021295	GCAA	2	8	170934	170941	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2122	NC_021295	GC	4	8	171607	171614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2123	NC_021295	TGC	2	6	171661	171666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2129	NC_021295	GC	3	6	171904	171909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2133	NC_021295	CG	3	6	172153	172158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2134	NC_021295	CAG	2	6	172160	172165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2136	NC_021295	AGA	2	6	172251	172256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2265	NC_021295	CA	4	8	179232	179239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2270	NC_021295	GC	3	6	179559	179564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2271	NC_021295	CGA	2	6	179582	179587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2272	NC_021295	ACC	2	6	179616	179621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2273	NC_021295	GAA	2	6	179639	179644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2274	NC_021295	CG	3	6	179651	179656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2275	NC_021295	AATGC	2	10	179734	179743	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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2388	NC_021295	CGGC	2	8	184330	184337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2389	NC_021295	CGAT	2	8	184371	184378	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2390	NC_021295	AGC	2	6	184398	184403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2391	NC_021295	GC	4	8	184465	184472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2392	NC_021295	AAGC	2	8	184552	184559	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2393	NC_021295	TGG	2	6	184641	184646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2394	NC_021295	CAG	2	6	184649	184654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2395	NC_021295	CG	3	6	184774	184779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2396	NC_021295	CTT	2	6	184892	184897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2397	NC_021295	GCA	3	9	184927	184935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2399	NC_021295	GTCT	2	8	185015	185022	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2400	NC_021295	GAT	2	6	185027	185032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2401	NC_021295	CGAAG	2	10	185060	185069	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2402	NC_021295	TCG	2	6	185083	185088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2403	NC_021295	CGG	2	6	185124	185129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2404	NC_021295	TTTC	2	8	185173	185180	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2405	NC_021295	GTCA	2	8	185192	185199	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2406	NC_021295	CGT	2	6	185231	185236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2407	NC_021295	GTT	2	6	185240	185245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2408	NC_021295	CGT	2	6	185304	185309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2409	NC_021295	TCG	2	6	185311	185316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2410	NC_021295	CGAA	2	8	185352	185359	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2411	NC_021295	CGG	2	6	185366	185371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2412	NC_021295	CTTT	2	8	185372	185379	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2413	NC_021295	TCGAAC	2	12	185428	185439	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2414	NC_021295	CGCA	2	8	185466	185473	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2415	NC_021295	CGA	2	6	185478	185483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2418	NC_021295	GCC	2	6	185628	185633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2419	NC_021295	ACG	2	6	185653	185658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2421	NC_021295	CG	3	6	185678	185683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2422	NC_021295	CGC	2	6	185696	185701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2423	NC_021295	GCA	2	6	185711	185716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2425	NC_021295	AC	3	6	185908	185913	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2426	NC_021295	TGA	2	6	186019	186024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2427	NC_021295	CAT	4	12	186095	186106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2429	NC_021295	GCG	2	6	186198	186203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2430	NC_021295	GCGTC	2	10	186231	186240	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2431	NC_021295	AGA	2	6	186261	186266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2432	NC_021295	ATC	3	9	186279	186287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2433	NC_021295	GC	3	6	186301	186306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2434	NC_021295	TGATT	2	10	186360	186369	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2435	NC_021295	GAA	2	6	186410	186415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2436	NC_021295	CGA	2	6	186427	186432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2437	NC_021295	TGA	2	6	186496	186501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2438	NC_021295	CAG	2	6	186527	186532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2439	NC_021295	GC	3	6	186591	186596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2440	NC_021295	CCG	2	6	186696	186701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2441	NC_021295	GCC	2	6	186711	186716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2442	NC_021295	CAGC	2	8	186762	186769	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2443	NC_021295	CGA	2	6	186788	186793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2444	NC_021295	TGC	2	6	186847	186852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2445	NC_021295	TTG	2	6	186878	186883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2446	NC_021295	GAA	2	6	186952	186957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2447	NC_021295	AGA	2	6	186958	186963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2448	NC_021295	GAC	2	6	186988	186993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2450	NC_021295	TCG	2	6	187148	187153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2452	NC_021295	CTT	2	6	187323	187328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2453	NC_021295	TGT	2	6	187434	187439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2454	NC_021295	ATT	2	6	187468	187473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2456	NC_021295	CGG	3	9	187572	187580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2466	NC_021295	TCGG	2	8	188134	188141	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2467	NC_021295	CA	3	6	188159	188164	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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