MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p2 DNA

Total Repeats: 5027

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021295	ATGT	2	8	141908	141915	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_021295	CAC	2	6	142236	142241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1503	NC_021295	TCG	2	6	142283	142288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_021295	GAC	2	6	142362	142367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_021295	GC	3	6	142431	142436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1506	NC_021295	GAA	2	6	142450	142455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_021295	ATC	2	6	142456	142461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_021295	CG	3	6	142485	142490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1509	NC_021295	AAG	2	6	142587	142592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_021295	TGG	2	6	142597	142602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_021295	AG	3	6	142649	142654	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_021295	GTC	2	6	142695	142700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_021295	GACG	2	8	142701	142708	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1514	NC_021295	TGC	2	6	142717	142722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_021295	CGAG	2	8	142732	142739	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1516	NC_021295	GCC	2	6	142776	142781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1517	NC_021295	CGC	2	6	142932	142937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1518	NC_021295	GCA	2	6	142981	142986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_021295	GGCA	2	8	143239	143246	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1520	NC_021295	CTG	2	6	143285	143290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_021295	CGG	2	6	143292	143297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_021295	GAT	2	6	143374	143379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_021295	TCG	2	6	143408	143413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_021295	GTC	2	6	143477	143482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_021295	TGGA	2	8	143543	143550	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_021295	GC	3	6	143574	143579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1527	NC_021295	GCA	2	6	143583	143588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_021295	CGT	2	6	143638	143643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_021295	TCT	2	6	143689	143694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_021295	GA	3	6	143762	143767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_021295	TCAT	2	8	143793	143800	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1532	NC_021295	CGC	2	6	143808	143813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_021295	CT	3	6	143814	143819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1534	NC_021295	GAC	2	6	143928	143933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_021295	ACA	2	6	143982	143987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_021295	TCGG	2	8	144147	144154	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1537	NC_021295	TGC	2	6	144179	144184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_021295	CGA	2	6	144238	144243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_021295	ACTG	2	8	144323	144330	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1540	NC_021295	CAGC	2	8	144347	144354	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1541	NC_021295	ATG	2	6	144471	144476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_021295	ACGT	2	8	144486	144493	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1543	NC_021295	TTG	2	6	144501	144506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_021295	GGC	2	6	144533	144538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_021295	CG	4	8	144607	144614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1546	NC_021295	CGC	2	6	144628	144633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1547	NC_021295	CAA	2	6	144692	144697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_021295	GCA	2	6	144715	144720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_021295	AGA	2	6	144769	144774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_021295	GCG	3	9	144825	144833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_021295	GAA	3	9	144860	144868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_021295	AAC	2	6	144948	144953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_021295	CGA	2	6	145022	145027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_021295	GGT	2	6	145046	145051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_021295	CTT	2	6	145235	145240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_021295	TTGC	2	8	145257	145264	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1557	NC_021295	CGA	2	6	145340	145345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_021295	GGC	2	6	145614	145619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_021295	GAT	2	6	145627	145632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_021295	CGG	2	6	145803	145808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_021295	TGG	2	6	145850	145855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_021295	AAC	2	6	145871	145876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_021295	GTC	2	6	145916	145921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_021295	ATG	2	6	145967	145972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_021295	GCG	2	6	145973	145978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_021295	CCT	2	6	146088	146093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_021295	CTCGT	2	10	146165	146174	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1568	NC_021295	CG	3	6	146328	146333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1569	NC_021295	TCA	2	6	146390	146395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_021295	GTCC	2	8	146412	146419	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_021295	GAA	2	6	146431	146436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_021295	CGT	2	6	146586	146591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_021295	ATC	2	6	146630	146635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_021295	ATCGA	2	10	146638	146647	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1575	NC_021295	CAT	2	6	146667	146672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_021295	TCG	2	6	146714	146719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_021295	CGA	2	6	146721	146726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_021295	GC	3	6	146727	146732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_021295	CAA	2	6	146745	146750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_021295	TGC	2	6	146761	146766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_021295	CGT	2	6	146901	146906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_021295	GTC	2	6	146932	146937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_021295	ATGCA	2	10	146948	146957	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1584	NC_021295	GAC	2	6	146977	146982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_021295	GC	3	6	146986	146991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1586	NC_021295	TCA	2	6	147020	147025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_021295	TCTCG	2	10	147036	147045	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1588	NC_021295	TCG	2	6	147065	147070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_021295	GC	3	6	147097	147102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_021295	TCG	2	6	147254	147259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_021295	CGACG	2	10	147273	147282	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1592	NC_021295	AGC	2	6	147326	147331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_021295	ACG	2	6	147362	147367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_021295	TGC	2	6	147401	147406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_021295	CG	3	6	147446	147451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1596	NC_021295	TGA	2	6	147464	147469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_021295	T	7	7	147541	147547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_021295	GAG	2	6	147549	147554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_021295	CGT	2	6	147606	147611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_021295	CGT	2	6	147674	147679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_021295	CG	3	6	147700	147705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1602	NC_021295	CGA	3	9	147776	147784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_021295	GCAGC	2	10	147824	147833	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1604	NC_021295	GCT	2	6	147858	147863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_021295	GCTTC	2	10	147890	147899	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1606	NC_021295	CAC	2	6	147936	147941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1607	NC_021295	CGC	4	12	147969	147980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1608	NC_021295	ACA	2	6	148102	148107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_021295	CGG	2	6	148114	148119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_021295	TCG	2	6	148161	148166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_021295	ATG	2	6	148205	148210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_021295	GC	3	6	148218	148223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1613	NC_021295	CTA	2	6	148351	148356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_021295	CGG	2	6	148369	148374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_021295	TTC	2	6	148385	148390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_021295	GC	3	6	148446	148451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1617	NC_021295	GCGCA	2	10	148551	148560	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1618	NC_021295	CAA	2	6	148636	148641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_021295	GC	3	6	148713	148718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_021295	ATCGC	2	10	148731	148740	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1621	NC_021295	CATC	2	8	148752	148759	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1622	NC_021295	CGC	2	6	148828	148833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1623	NC_021295	CGA	2	6	148880	148885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_021295	GC	3	6	148913	148918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1625	NC_021295	GGCC	2	8	148997	149004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1626	NC_021295	TCG	2	6	149023	149028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_021295	CG	3	6	149031	149036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1628	NC_021295	GATC	2	8	149039	149046	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1629	NC_021295	TCG	2	6	149065	149070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_021295	ATC	2	6	149178	149183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_021295	GCC	2	6	149225	149230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1632	NC_021295	CG	5	10	149256	149265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1633	NC_021295	CAG	2	6	149342	149347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_021295	GTG	2	6	149367	149372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_021295	GAG	2	6	149406	149411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_021295	GAT	2	6	149441	149446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1638	NC_021295	CGC	3	9	149546	149554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1642	NC_021295	ACT	2	6	149723	149728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1652	NC_021295	GAG	2	6	150064	150069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1653	NC_021295	CGT	2	6	150114	150119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1655	NC_021295	GGCG	2	8	150153	150160	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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1666	NC_021295	CGC	2	6	150558	150563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1760	NC_021295	CG	3	6	154829	154834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1761	NC_021295	CGG	2	6	154907	154912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1762	NC_021295	CAG	2	6	154965	154970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1765	NC_021295	GGCG	2	8	155042	155049	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1766	NC_021295	GGCCAG	2	12	155112	155123	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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1893	NC_021295	GTC	2	6	160542	160547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1902	NC_021295	GAA	2	6	161110	161115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1903	NC_021295	ACGA	2	8	161165	161172	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1904	NC_021295	GC	3	6	161230	161235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1905	NC_021295	GC	4	8	161249	161256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1906	NC_021295	TTCG	2	8	161287	161294	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1907	NC_021295	CGA	2	6	161304	161309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1908	NC_021295	GC	3	6	161329	161334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1909	NC_021295	CAA	2	6	161339	161344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1910	NC_021295	GTT	2	6	161399	161404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1914	NC_021295	CA	3	6	161607	161612	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1924	NC_021295	AAT	3	9	162060	162068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1925	NC_021295	CAA	2	6	162108	162113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1926	NC_021295	CGCGAT	2	12	162211	162222	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1929	NC_021295	T	6	6	162405	162410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1930	NC_021295	CG	3	6	162458	162463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1931	NC_021295	ATG	2	6	162516	162521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1933	NC_021295	GCC	2	6	162736	162741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1934	NC_021295	ACG	2	6	162756	162761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1936	NC_021295	CT	3	6	162846	162851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1937	NC_021295	ATGC	2	8	162856	162863	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1938	NC_021295	CAA	2	6	162895	162900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1939	NC_021295	GC	3	6	162923	162928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1943	NC_021295	GGC	2	6	163053	163058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1952	NC_021295	CAA	2	6	163591	163596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1983	NC_021295	CTGAC	2	10	165265	165274	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1989	NC_021295	CTCTT	2	10	165494	165503	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1990	NC_021295	TCCC	2	8	165511	165518	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1991	NC_021295	TCC	2	6	165567	165572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1992	NC_021295	CTT	2	6	165588	165593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1996	NC_021295	ACC	2	6	165843	165848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1997	NC_021295	TTC	2	6	165852	165857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1998	NC_021295	AAT	2	6	165869	165874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1999	NC_021295	TC	3	6	165884	165889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2000	NC_021295	AGT	2	6	165965	165970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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