MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p2 DNA

Total Repeats: 5027

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021295	CGC	2	6	282503	282508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4502	NC_021295	TTC	2	6	282633	282638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_021295	ATC	2	6	282639	282644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_021295	ATGCA	2	10	282690	282699	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4505	NC_021295	CGG	2	6	282736	282741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_021295	CTCG	2	8	282801	282808	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4507	NC_021295	GCG	2	6	282829	282834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_021295	CGG	2	6	282842	282847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_021295	TCT	2	6	282853	282858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_021295	TTC	2	6	282861	282866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_021295	GGC	2	6	282887	282892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_021295	CA	3	6	282898	282903	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4513	NC_021295	TGG	2	6	282935	282940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_021295	CG	3	6	283047	283052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4515	NC_021295	GC	3	6	283091	283096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4516	NC_021295	CTT	2	6	283112	283117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_021295	CCG	2	6	283222	283227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4518	NC_021295	CGC	2	6	283425	283430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4519	NC_021295	CG	3	6	283662	283667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4520	NC_021295	TTC	2	6	283724	283729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_021295	CA	3	6	283758	283763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4522	NC_021295	AGGA	2	8	284081	284088	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_021295	GTC	2	6	284105	284110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_021295	TTC	2	6	284115	284120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_021295	GT	3	6	284148	284153	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_021295	CG	3	6	284212	284217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4527	NC_021295	TGC	2	6	284250	284255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_021295	GCG	2	6	284265	284270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_021295	CGAA	2	8	284330	284337	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4530	NC_021295	TCGC	2	8	284540	284547	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4531	NC_021295	CA	3	6	284589	284594	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4532	NC_021295	ATTC	2	8	284636	284643	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4533	NC_021295	CGG	2	6	284659	284664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_021295	GGA	2	6	284683	284688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_021295	GCA	2	6	284800	284805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_021295	GAA	2	6	284887	284892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_021295	GGA	2	6	284952	284957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_021295	AGA	2	6	285016	285021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_021295	GTGAA	2	10	285045	285054	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_021295	TCT	2	6	285060	285065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_021295	ACG	2	6	285086	285091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_021295	GT	3	6	285123	285128	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_021295	AAGC	2	8	285157	285164	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4544	NC_021295	CGC	2	6	285271	285276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4545	NC_021295	GAT	2	6	285432	285437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_021295	GAG	2	6	285450	285455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_021295	GGC	2	6	285460	285465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_021295	C	6	6	285637	285642	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4549	NC_021295	CGG	2	6	285670	285675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_021295	CTG	2	6	285678	285683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_021295	GCGAGA	2	12	285685	285696	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4552	NC_021295	CAG	2	6	285713	285718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_021295	AGG	2	6	285719	285724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_021295	CTT	2	6	285737	285742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_021295	CGAA	2	8	285794	285801	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4556	NC_021295	GAG	2	6	285805	285810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_021295	CT	3	6	285864	285869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4558	NC_021295	GGAT	2	8	285988	285995	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_021295	GGC	2	6	286008	286013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_021295	CCT	2	6	286050	286055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4561	NC_021295	CGA	2	6	286118	286123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_021295	CCT	2	6	286142	286147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4563	NC_021295	CTT	2	6	286158	286163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_021295	TCT	2	6	286172	286177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_021295	CGT	2	6	286182	286187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_021295	CG	3	6	286231	286236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4567	NC_021295	ACCAA	2	10	286300	286309	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4568	NC_021295	CAA	2	6	286316	286321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4569	NC_021295	C	6	6	286340	286345	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4570	NC_021295	TCG	2	6	286404	286409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_021295	CCAG	2	8	286421	286428	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4572	NC_021295	AACC	2	8	286430	286437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4573	NC_021295	CAT	2	6	286562	286567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_021295	TCC	2	6	286576	286581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4575	NC_021295	TC	3	6	286606	286611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4576	NC_021295	AACAG	2	10	286669	286678	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4577	NC_021295	CA	3	6	286871	286876	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4578	NC_021295	ATC	2	6	286933	286938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_021295	CAT	2	6	286962	286967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_021295	TCG	2	6	287038	287043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_021295	GCG	2	6	287089	287094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_021295	CGAT	2	8	287149	287156	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4583	NC_021295	GTC	2	6	287198	287203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_021295	CATG	2	8	287237	287244	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4585	NC_021295	GATC	2	8	287254	287261	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4586	NC_021295	GTA	2	6	287307	287312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_021295	ATC	2	6	287386	287391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_021295	TGG	2	6	287503	287508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_021295	GTC	2	6	287517	287522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_021295	CGG	2	6	287533	287538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_021295	AGGCG	2	10	287608	287617	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4592	NC_021295	CTTCG	2	10	287628	287637	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4593	NC_021295	GATC	2	8	287682	287689	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4594	NC_021295	TTC	2	6	287696	287701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_021295	CG	3	6	287765	287770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4596	NC_021295	TCC	2	6	287824	287829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4597	NC_021295	CG	3	6	287838	287843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4598	NC_021295	CGC	2	6	287871	287876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4599	NC_021295	CTTC	2	8	288059	288066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4600	NC_021295	TCGCGC	2	12	288112	288123	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4601	NC_021295	CGA	2	6	288207	288212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_021295	AGC	2	6	288223	288228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_021295	TCGA	2	8	288296	288303	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4604	NC_021295	CAA	2	6	288304	288309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_021295	GCT	2	6	288325	288330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_021295	TGCGA	2	10	288341	288350	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4607	NC_021295	CTG	2	6	288395	288400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_021295	CG	3	6	288422	288427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4609	NC_021295	CGA	2	6	288481	288486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_021295	TCG	2	6	288580	288585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_021295	ATC	2	6	288694	288699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_021295	TCG	2	6	288792	288797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_021295	CG	3	6	288796	288801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4614	NC_021295	GGC	2	6	288814	288819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_021295	CGA	2	6	288880	288885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_021295	CTG	2	6	289004	289009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_021295	TCG	2	6	289060	289065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_021295	TGC	2	6	289090	289095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_021295	ATT	2	6	289118	289123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_021295	GCCAT	2	10	289126	289135	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4621	NC_021295	GGT	2	6	289175	289180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_021295	GAAA	2	8	289189	289196	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_021295	CTT	2	6	289295	289300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_021295	TCAA	2	8	289327	289334	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4625	NC_021295	TGA	2	6	289343	289348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_021295	GGC	2	6	289402	289407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_021295	TGC	2	6	289470	289475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_021295	GGT	2	6	289500	289505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_021295	GGC	3	9	289564	289572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_021295	GGC	2	6	289687	289692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4631	NC_021295	CTGG	2	8	289820	289827	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4632	NC_021295	CGA	2	6	289875	289880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4633	NC_021295	GGC	2	6	289884	289889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4634	NC_021295	CAG	2	6	289897	289902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4635	NC_021295	CGC	2	6	289908	289913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4636	NC_021295	GTTG	2	8	289944	289951	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4904	NC_021295	GCT	2	6	303418	303423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4905	NC_021295	CAC	2	6	303449	303454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4906	NC_021295	CG	3	6	303468	303473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4907	NC_021295	CGG	2	6	303502	303507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4908	NC_021295	GCG	2	6	303709	303714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4927	NC_021295	CG	3	6	304758	304763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4928	NC_021295	GGCG	2	8	304914	304921	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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4935	NC_021295	GTG	2	6	305307	305312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4936	NC_021295	TTC	2	6	305323	305328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4937	NC_021295	CGC	2	6	305358	305363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4938	NC_021295	GCT	2	6	305373	305378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4939	NC_021295	TGA	2	6	305413	305418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4941	NC_021295	GAT	2	6	305518	305523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4942	NC_021295	CTC	2	6	305528	305533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4945	NC_021295	TAC	2	6	305723	305728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4949	NC_021295	TCTCG	2	10	305875	305884	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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4952	NC_021295	CTGGT	2	10	306017	306026	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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4963	NC_021295	GAG	2	6	306433	306438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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