MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p1 DNA

Total Repeats: 2354

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021289	CATG	2	8	789891	789898	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1502	NC_021289	CGG	2	6	789901	789906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_021289	TA	3	6	790077	790082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_021289	CG	3	6	790092	790097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1505	NC_021289	T	7	7	790109	790115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_021289	GGC	2	6	790118	790123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_021289	TTTTC	2	10	790938	790947	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1508	NC_021289	GC	3	6	791696	791701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1509	NC_021289	GAA	2	6	792282	792287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_021289	GC	3	6	792302	792307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1511	NC_021289	CA	3	6	792354	792359	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_021289	GTG	2	6	793644	793649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_021289	TG	3	6	793691	793696	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_021289	TG	3	6	793717	793722	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_021289	TCA	2	6	793724	793729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_021289	GAG	2	6	793746	793751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_021289	GAA	2	6	794445	794450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_021289	GC	3	6	795119	795124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_021289	ACG	2	6	795160	795165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_021289	A	6	6	798734	798739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_021289	CG	3	6	798763	798768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_021289	TTC	2	6	798815	798820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_021289	A	6	6	798838	798843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_021289	TAA	2	6	801864	801869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_021289	TTC	2	6	801881	801886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_021289	ACG	2	6	801954	801959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_021289	CAAT	2	8	802010	802017	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1528	NC_021289	ATTC	2	8	802018	802025	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1529	NC_021289	CGA	2	6	802110	802115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_021289	T	6	6	802119	802124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_021289	GC	3	6	802256	802261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1532	NC_021289	CGG	2	6	803294	803299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_021289	GCTCG	2	10	803356	803365	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1534	NC_021289	A	6	6	803372	803377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_021289	CAAAC	2	10	803402	803411	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1536	NC_021289	CAT	2	6	803580	803585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_021289	CG	3	6	803654	803659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1538	NC_021289	GAC	2	6	803687	803692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_021289	TCC	2	6	804215	804220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1540	NC_021289	TCT	2	6	804255	804260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_021289	TGC	2	6	804288	804293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_021289	TTACCG	2	12	804374	804385	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_021289	CGC	2	6	804400	804405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_021289	CGC	2	6	804411	804416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1545	NC_021289	GGCC	2	8	804426	804433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1546	NC_021289	CG	3	6	804503	804508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_021289	ACAT	2	8	804522	804529	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1548	NC_021289	GTTT	2	8	804575	804582	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_021289	CGG	2	6	808166	808171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_021289	CGC	2	6	808172	808177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1551	NC_021289	ACA	3	9	808313	808321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_021289	CCG	2	6	808380	808385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_021289	GAC	2	6	808406	808411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_021289	GTC	2	6	816521	816526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_021289	CAA	2	6	817931	817936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_021289	CAC	2	6	817983	817988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_021289	AC	3	6	817987	817992	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1558	NC_021289	TGC	2	6	819864	819869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_021289	CGGAAG	2	12	824362	824373	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1560	NC_021289	T	6	6	824377	824382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_021289	AAC	2	6	824427	824432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_021289	GC	3	6	828741	828746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1563	NC_021289	GAA	2	6	829698	829703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_021289	AGC	2	6	829716	829721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_021289	CATT	2	8	829733	829740	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1566	NC_021289	CGC	2	6	829743	829748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_021289	GACA	2	8	830519	830526	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1568	NC_021289	TGC	2	6	830543	830548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_021289	GCA	2	6	830586	830591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_021289	TCT	2	6	830650	830655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_021289	ACG	2	6	830658	830663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_021289	ATG	2	6	830703	830708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_021289	CAAC	3	12	830711	830722	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_021289	CT	4	8	831048	831055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1575	NC_021289	AG	4	8	831085	831092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_021289	GGC	2	6	831106	831111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_021289	TGG	2	6	831123	831128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_021289	GCTC	2	8	831143	831150	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_021289	T	6	6	831163	831168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_021289	GAAG	2	8	832028	832035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_021289	TGA	2	6	832099	832104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_021289	T	6	6	832166	832171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_021289	GCGA	2	8	832261	832268	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1584	NC_021289	TCT	2	6	832345	832350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_021289	CAAC	3	12	832406	832417	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1586	NC_021289	CTCAC	2	10	832706	832715	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1587	NC_021289	CTCAC	2	10	833030	833039	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1588	NC_021289	TCAA	2	8	833040	833047	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1589	NC_021289	CTCAC	2	10	833354	833363	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1590	NC_021289	CGG	2	6	837807	837812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_021289	CGT	2	6	838940	838945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_021289	TGA	2	6	838963	838968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_021289	AAT	2	6	842311	842316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_021289	CCG	2	6	843380	843385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1595	NC_021289	T	6	6	844918	844923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_021289	GGA	2	6	845105	845110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_021289	AGC	2	6	845926	845931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_021289	TCT	2	6	852081	852086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_021289	CG	3	6	852101	852106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_021289	GC	3	6	852120	852125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1601	NC_021289	GC	3	6	852779	852784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1602	NC_021289	CAG	2	6	854863	854868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_021289	CT	5	10	854895	854904	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1604	NC_021289	CGG	2	6	854952	854957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_021289	GCG	2	6	854975	854980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_021289	GACG	2	8	855034	855041	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1607	NC_021289	ACG	2	6	855051	855056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_021289	ACGA	2	8	855068	855075	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1609	NC_021289	CGT	2	6	855119	855124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_021289	ATT	2	6	857309	857314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_021289	GTT	2	6	857346	857351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_021289	TGG	2	6	857379	857384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_021289	TGCGA	2	10	857477	857486	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1614	NC_021289	GCG	2	6	859947	859952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_021289	TGACC	2	10	859974	859983	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1616	NC_021289	CGT	2	6	860040	860045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_021289	AGC	2	6	860060	860065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_021289	TTC	2	6	860072	860077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_021289	CGCGC	2	10	860086	860095	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1620	NC_021289	GC	4	8	860092	860099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1621	NC_021289	CTC	2	6	860109	860114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1622	NC_021289	GAC	2	6	860115	860120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_021289	GCG	2	6	861378	861383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_021289	GGC	2	6	863078	863083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_021289	GAT	2	6	863092	863097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_021289	GC	3	6	863123	863128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1627	NC_021289	GCCCG	2	10	863131	863140	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1628	NC_021289	A	6	6	863174	863179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_021289	CGC	2	6	863225	863230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1630	NC_021289	TCAT	2	8	865836	865843	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1631	NC_021289	ACG	2	6	869333	869338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_021289	GCATG	2	10	869345	869354	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1633	NC_021289	GAA	2	6	869461	869466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_021289	CAA	2	6	869470	869475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_021289	TCA	2	6	876434	876439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1636	NC_021289	TCG	2	6	876447	876452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1637	NC_021289	ATC	2	6	876464	876469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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