MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p1 DNA

Total Repeats: 2354

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021289	GGA	2	6	521767	521772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_021289	TGA	2	6	521779	521784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_021289	TCGATG	2	12	521826	521837	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1004	NC_021289	CTT	2	6	521880	521885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_021289	GTCC	2	8	523253	523260	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_021289	T	7	7	523428	523434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_021289	CG	3	6	523440	523445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_021289	GAAC	2	8	523460	523467	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_021289	TGC	2	6	523490	523495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_021289	TAAT	2	8	523609	523616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_021289	GC	3	6	523741	523746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_021289	CTC	2	6	523750	523755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_021289	GAC	2	6	523759	523764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_021289	TCAG	2	8	529667	529674	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1015	NC_021289	T	6	6	529687	529692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_021289	ATT	2	6	529752	529757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021289	CCG	2	6	529956	529961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_021289	ATC	2	6	529979	529984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_021289	CTG	2	6	530024	530029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_021289	TTA	2	6	530060	530065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_021289	CTCA	2	8	530224	530231	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_021289	GAAC	2	8	530246	530253	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1023	NC_021289	CAG	2	6	531838	531843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_021289	GCC	3	9	531885	531893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_021289	GGC	2	6	531905	531910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_021289	CCT	2	6	532259	532264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_021289	CG	4	8	532279	532286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_021289	CG	3	6	532309	532314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_021289	AAAC	2	8	532382	532389	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_021289	GGC	2	6	533341	533346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_021289	AG	3	6	534157	534162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_021289	CAT	2	6	534165	534170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_021289	CGT	2	6	534219	534224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_021289	TTG	2	6	534238	534243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_021289	AGCG	2	8	534353	534360	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1036	NC_021289	CGC	2	6	534361	534366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_021289	T	6	6	534857	534862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_021289	AAT	2	6	534897	534902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_021289	AT	3	6	534953	534958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_021289	AGC	2	6	534993	534998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_021289	AGC	2	6	535315	535320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_021289	CA	3	6	535399	535404	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_021289	GAA	2	6	535420	535425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_021289	TC	3	6	540100	540105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_021289	TC	3	6	540144	540149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_021289	ATAAAA	2	12	540167	540178	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_021289	T	7	7	541288	541294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_021289	TCG	2	6	541315	541320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_021289	CGA	2	6	541355	541360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_021289	AGTG	2	8	541369	541376	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_021289	CGTGC	2	10	542068	542077	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1052	NC_021289	AACATG	2	12	542100	542111	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1053	NC_021289	GC	3	6	543748	543753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_021289	GATA	2	8	544761	544768	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_021289	GGAA	2	8	544813	544820	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_021289	ACG	2	6	546806	546811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_021289	TCGA	2	8	546874	546881	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1058	NC_021289	CGA	2	6	546966	546971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_021289	CAG	2	6	547080	547085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_021289	AAG	2	6	547096	547101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_021289	TGA	2	6	547128	547133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_021289	CTA	2	6	547159	547164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_021289	GC	4	8	547181	547188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_021289	CCA	2	6	547199	547204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_021289	ACG	2	6	547206	547211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_021289	CAG	2	6	547275	547280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_021289	TGCG	2	8	547307	547314	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1068	NC_021289	A	7	7	547319	547325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_021289	CCA	2	6	547418	547423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_021289	GCG	2	6	547683	547688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_021289	GATC	2	8	547733	547740	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1072	NC_021289	AGTG	2	8	547747	547754	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_021289	AAG	2	6	547760	547765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_021289	GC	3	6	547798	547803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_021289	ATG	2	6	548869	548874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_021289	CG	3	6	548886	548891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_021289	ATG	2	6	548892	548897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_021289	GC	3	6	548938	548943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_021289	ATC	2	6	548949	548954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_021289	GAT	2	6	548970	548975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_021289	ATC	2	6	548985	548990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_021289	ATG	2	6	549003	549008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_021289	GAC	2	6	550094	550099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_021289	TCA	2	6	550430	550435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_021289	GGCA	2	8	553355	553362	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1086	NC_021289	T	6	6	553371	553376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_021289	CAGG	2	8	553402	553409	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1088	NC_021289	CATG	2	8	553444	553451	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_021289	GAT	2	6	553478	553483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_021289	AAG	2	6	553599	553604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_021289	TCG	2	6	553729	553734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_021289	CAA	2	6	553745	553750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_021289	CGA	2	6	553762	553767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_021289	GCC	2	6	553770	553775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_021289	GCGCC	2	10	555120	555129	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1096	NC_021289	GCA	2	6	555140	555145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_021289	GGC	2	6	555150	555155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_021289	GCG	2	6	555156	555161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_021289	TGA	2	6	556262	556267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_021289	T	8	8	556306	556313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_021289	AAC	2	6	558119	558124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_021289	AG	3	6	558262	558267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_021289	TAC	2	6	558281	558286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_021289	TTC	2	6	558305	558310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_021289	GGA	2	6	558316	558321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_021289	AC	3	6	560559	560564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_021289	TCGG	2	8	560574	560581	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1108	NC_021289	ATG	2	6	560585	560590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_021289	AAG	2	6	560622	560627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_021289	GTA	2	6	561562	561567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_021289	GTC	2	6	561569	561574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_021289	GCC	2	6	561629	561634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_021289	ACG	2	6	563776	563781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_021289	CGCA	2	8	564596	564603	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_021289	CG	3	6	564618	564623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_021289	CG	3	6	564639	564644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_021289	GCGG	2	8	564679	564686	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_021289	TCC	2	6	564692	564697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_021289	GAC	2	6	564699	564704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_021289	GGC	2	6	564725	564730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_021289	CGGG	2	8	564768	564775	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_021289	CCCG	2	8	564796	564803	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1123	NC_021289	A	6	6	564822	564827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_021289	CGC	2	6	564903	564908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_021289	GC	3	6	564937	564942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_021289	CG	3	6	565008	565013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_021289	TA	3	6	567714	567719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_021289	CGGCG	2	10	567736	567745	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1129	NC_021289	GCG	2	6	567761	567766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_021289	CCT	2	6	569525	569530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_021289	GTC	2	6	569570	569575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_021289	GCC	2	6	569598	569603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_021289	CTC	2	6	570797	570802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_021289	GT	3	6	570814	570819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_021289	GC	3	6	570960	570965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1136	NC_021289	GC	3	6	571035	571040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1273	NC_021289	CGC	2	6	668678	668683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1405	NC_021289	GAT	2	6	732414	732419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1406	NC_021289	TGA	2	6	732442	732447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1408	NC_021289	GCTA	2	8	732546	732553	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1409	NC_021289	ACT	2	6	738309	738314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1410	NC_021289	CGTG	2	8	739396	739403	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1411	NC_021289	GCG	2	6	739406	739411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1412	NC_021289	CGT	2	6	739804	739809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1413	NC_021289	CAG	2	6	739850	739855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1414	NC_021289	TGGCG	2	10	739903	739912	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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1420	NC_021289	GTTAT	2	10	740015	740024	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1423	NC_021289	TGA	2	6	740804	740809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1431	NC_021289	TGA	2	6	741259	741264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1432	NC_021289	CCTTTG	2	12	741295	741306	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1433	NC_021289	TCG	2	6	741392	741397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1435	NC_021289	TTCG	2	8	746078	746085	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1439	NC_021289	TGC	2	6	746223	746228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1441	NC_021289	TGA	2	6	747617	747622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1442	NC_021289	ACG	2	6	747642	747647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1443	NC_021289	TCG	2	6	747649	747654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1445	NC_021289	GC	3	6	747753	747758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1446	NC_021289	GCAC	2	8	748441	748448	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1447	NC_021289	CAG	2	6	748460	748465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1449	NC_021289	GCG	3	9	748525	748533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1451	NC_021289	GCC	2	6	750061	750066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1452	NC_021289	CGC	2	6	750105	750110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1454	NC_021289	CGC	2	6	750169	750174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1457	NC_021289	GC	3	6	751177	751182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1458	NC_021289	AGG	2	6	751184	751189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1482	NC_021289	CGG	2	6	768634	768639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1500	NC_021289	GC	3	6	789844	789849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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