MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p1 DNA

Total Repeats: 2354

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021289	CTC	2	6	250294	250299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_021289	AGC	2	6	250365	250370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_021289	AGT	2	6	250580	250585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_021289	ATT	2	6	250606	250611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_021289	TG	3	6	250613	250618	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
506	NC_021289	GCG	2	6	250662	250667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_021289	GC	3	6	250685	250690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
508	NC_021289	AAT	2	6	250762	250767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_021289	GC	3	6	254152	254157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
510	NC_021289	GCA	2	6	254796	254801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_021289	GA	3	6	254805	254810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
512	NC_021289	GCG	2	6	254820	254825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_021289	CG	3	6	254875	254880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
514	NC_021289	CGA	2	6	254897	254902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_021289	GAA	2	6	254909	254914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_021289	CGG	2	6	255017	255022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_021289	CGA	2	6	255099	255104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_021289	AGGATC	2	12	255113	255124	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
519	NC_021289	ATC	2	6	255134	255139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_021289	A	7	7	255154	255160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021289	AGG	2	6	255181	255186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_021289	GC	3	6	255213	255218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
523	NC_021289	GC	3	6	255238	255243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
524	NC_021289	TTCC	2	8	255269	255276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
525	NC_021289	GTA	2	6	255306	255311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_021289	CGTGGG	2	12	256641	256652	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
527	NC_021289	CGA	2	6	256683	256688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_021289	GCTT	2	8	256705	256712	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
529	NC_021289	CG	3	6	256713	256718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
530	NC_021289	GC	3	6	256720	256725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
531	NC_021289	GAC	2	6	259046	259051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_021289	TCG	2	6	260148	260153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_021289	CG	3	6	260175	260180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
534	NC_021289	GGTTC	2	10	260231	260240	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
535	NC_021289	GCG	2	6	260447	260452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_021289	TCAA	2	8	260478	260485	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
537	NC_021289	T	6	6	260506	260511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_021289	GTCA	2	8	260585	260592	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
539	NC_021289	TCT	2	6	260593	260598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_021289	GCA	2	6	260781	260786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_021289	CG	3	6	261352	261357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
542	NC_021289	GCG	2	6	261646	261651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_021289	CGT	2	6	261685	261690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_021289	CG	3	6	262143	262148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
545	NC_021289	CAAA	2	8	262165	262172	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
546	NC_021289	CG	3	6	262173	262178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
547	NC_021289	GC	4	8	262210	262217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
548	NC_021289	GCCT	2	8	262224	262231	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
549	NC_021289	CGGGC	2	10	263717	263726	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
550	NC_021289	CG	3	6	263936	263941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
551	NC_021289	GAC	2	6	265879	265884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_021289	ATGC	2	8	265900	265907	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
553	NC_021289	GCAT	2	8	265909	265916	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
554	NC_021289	GAC	2	6	265945	265950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_021289	T	6	6	268810	268815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_021289	CG	3	6	268838	268843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
557	NC_021289	CCA	2	6	268871	268876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_021289	CA	3	6	268940	268945	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
559	NC_021289	GTT	2	6	268955	268960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_021289	GGC	2	6	269199	269204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_021289	CGT	2	6	269254	269259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_021289	GATGTC	2	12	269261	269272	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
563	NC_021289	CAT	2	6	269318	269323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_021289	TCC	2	6	270612	270617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_021289	GC	3	6	270664	270669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
566	NC_021289	AAG	2	6	271474	271479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_021289	TTA	2	6	272480	272485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_021289	TG	3	6	272516	272521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
569	NC_021289	CTGG	2	8	272551	272558	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
570	NC_021289	AG	3	6	272582	272587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
571	NC_021289	CGG	2	6	273880	273885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_021289	CATCGA	2	12	273925	273936	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_021289	GCC	2	6	273939	273944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_021289	TTCG	2	8	274837	274844	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
575	NC_021289	CCAT	2	8	277263	277270	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
576	NC_021289	AGA	2	6	277285	277290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_021289	GAA	2	6	277438	277443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_021289	GCA	2	6	277447	277452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_021289	CA	3	6	277451	277456	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
580	NC_021289	TCGA	2	8	277499	277506	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
581	NC_021289	GA	3	6	277505	277510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
582	NC_021289	CGC	2	6	280326	280331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_021289	T	6	6	280420	280425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_021289	GGC	2	6	280499	280504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_021289	AAT	2	6	280521	280526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_021289	CG	3	6	289714	289719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
587	NC_021289	CGC	2	6	289786	289791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_021289	CA	3	6	289859	289864	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
589	NC_021289	AAG	2	6	290267	290272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_021289	CG	3	6	290284	290289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
591	NC_021289	CCGC	2	8	290304	290311	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
592	NC_021289	GGCG	2	8	290357	290364	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
593	NC_021289	GC	4	8	290401	290408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
594	NC_021289	TGTT	2	8	291917	291924	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
595	NC_021289	CTT	2	6	291933	291938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_021289	GCC	2	6	291995	292000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_021289	GCT	2	6	292010	292015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_021289	ACCG	2	8	293162	293169	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
599	NC_021289	TTC	2	6	293174	293179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_021289	TC	3	6	293188	293193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
601	NC_021289	T	6	6	293235	293240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_021289	GAAA	2	8	293487	293494	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
603	NC_021289	GCG	2	6	293504	293509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_021289	GCA	2	6	293536	293541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_021289	ATCG	2	8	293566	293573	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
606	NC_021289	GACC	2	8	293618	293625	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
607	NC_021289	GCA	2	6	293632	293637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_021289	GAA	2	6	293640	293645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_021289	AGC	2	6	293658	293663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_021289	AGG	2	6	293784	293789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
611	NC_021289	GAT	2	6	293811	293816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_021289	GGCC	2	8	293865	293872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
613	NC_021289	GCAA	2	8	293922	293929	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
614	NC_021289	TGT	2	6	293960	293965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_021289	ACC	2	6	294074	294079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_021289	AGCG	2	8	297607	297614	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
617	NC_021289	AC	4	8	297637	297644	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
618	NC_021289	TAG	2	6	298700	298705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_021289	CTGC	2	8	298729	298736	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
620	NC_021289	TTA	2	6	298761	298766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_021289	TTA	2	6	299956	299961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_021289	TAA	2	6	299963	299968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_021289	CGGG	2	8	301773	301780	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
624	NC_021289	GCAA	2	8	302303	302310	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
625	NC_021289	TAG	2	6	302361	302366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_021289	TAG	2	6	302381	302386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_021289	CTG	2	6	302493	302498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_021289	ATG	2	6	302822	302827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_021289	TCC	2	6	302828	302833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_021289	TGC	2	6	302851	302856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_021289	GC	3	6	302855	302860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
632	NC_021289	TTCG	2	8	302875	302882	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
633	NC_021289	CG	3	6	302923	302928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
634	NC_021289	GC	3	6	303224	303229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
635	NC_021289	TGCG	2	8	303230	303237	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
636	NC_021289	AAAG	2	8	303264	303271	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
637	NC_021289	CGC	2	6	303277	303282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_021289	GCC	2	6	305965	305970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
639	NC_021289	CGC	2	6	305983	305988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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641	NC_021289	GC	3	6	306821	306826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
642	NC_021289	GC	4	8	306964	306971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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682	NC_021289	GCC	3	9	319848	319856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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