MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus sp. 1NLA3E

Total Repeats: 354

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021171	ATTTTA	2	12	3343	3354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021171	TATTTT	2	12	3505	3516	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021171	TAAAAA	2	12	26609	26620	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021171	CTTTTT	2	12	28551	28562	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021171	TAAAAT	2	12	39375	39386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021171	TGTTTT	2	12	48031	48042	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021171	AAATAG	2	12	71536	71547	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021171	AAGGGC	2	12	76409	76420	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021171	GATAAA	2	12	76719	76730	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021171	GCGCTT	2	12	105346	105357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021171	CTTTTT	2	12	120476	120487	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021171	TGGAAA	2	12	159093	159104	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021171	CATGAA	3	18	163175	163192	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_021171	ATAAAA	2	12	177007	177018	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021171	TAAAAA	2	12	198709	198720	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021171	CATTTT	2	12	215451	215462	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021171	TTATTT	2	12	228459	228470	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021171	AATAAA	2	12	235560	235571	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021171	ATAAAA	2	12	239771	239782	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021171	GTTTCT	2	12	283799	283810	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_021171	TATAAA	2	12	291130	291141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021171	TATCCA	2	12	291356	291367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021171	CAAAAA	2	12	291609	291620	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021171	GATTTT	2	12	303504	303515	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021171	TTAGTA	2	12	320348	320359	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021171	GTACAT	2	12	403185	403196	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021171	AAAAAC	2	12	445656	445667	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021171	AAAAAT	2	12	454224	454235	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021171	TGATTT	2	12	464473	464484	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021171	AAAGGT	2	12	507514	507525	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021171	GAAAAT	2	12	523205	523216	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021171	CTTTTT	2	12	530168	530179	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_021171	TACAAG	2	12	548477	548488	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_021171	AGGTGC	2	12	557075	557086	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021171	TGTTTT	2	12	557602	557613	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021171	ACATAA	2	12	563737	563748	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021171	ATTTTA	2	12	572984	572995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021171	ATTTTA	2	12	575777	575788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021171	ATTTTA	2	12	580449	580460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021171	AAATAG	2	12	581719	581730	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021171	GAATCA	2	12	616565	616576	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021171	AAAACC	2	12	663088	663099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021171	GCTTTT	2	12	665214	665225	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_021171	TTGAGT	2	12	666977	666988	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021171	TAAAAA	2	12	696930	696941	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021171	GATAAT	2	12	709351	709362	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021171	GCGCTT	2	12	751013	751024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021171	GCTTTT	2	12	759214	759225	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021171	TAGCAT	2	12	771098	771109	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_021171	ATATAG	2	12	783509	783520	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021171	GGAAAA	2	12	785296	785307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021171	CTTAAT	2	12	810342	810353	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_021171	AAGAAA	2	12	825961	825972	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021171	TTGCAT	2	12	841253	841264	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_021171	TTTGTA	2	12	859642	859653	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021171	AAGGGC	2	12	899656	899667	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021171	AAATAA	2	12	902790	902801	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021171	AATAAA	2	12	916306	916317	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021171	AAAATA	2	12	919479	919490	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021171	AAGTAT	2	12	919629	919640	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021171	ATAAAG	2	12	925024	925035	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021171	AAATTT	2	12	931708	931719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021171	ACTCCC	2	12	931780	931791	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_021171	CCAGAT	2	12	964036	964047	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021171	TCAAGT	2	12	981664	981675	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_021171	AAGAGA	2	12	986536	986547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021171	TGCGCT	2	12	1004012	1004023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021171	ATATTT	2	12	1025207	1025218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021171	AGCTTC	2	12	1026867	1026878	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021171	TTATAA	2	12	1040607	1040618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021171	AAATAA	2	12	1079045	1079056	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021171	GAAATA	2	12	1084349	1084360	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021171	CGGATA	2	12	1090008	1090019	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021171	GCGGTT	2	12	1126055	1126066	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_021171	ATATTT	2	12	1170798	1170809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021171	GCGCTT	2	12	1181411	1181422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021171	GCGCTT	2	12	1181600	1181611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021171	TAAAAT	2	12	1191591	1191602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021171	AGTAAT	2	12	1196884	1196895	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021171	AATTTT	2	12	1197054	1197065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021171	TTTAAG	2	12	1199291	1199302	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021171	AAAGAT	2	12	1215109	1215120	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021171	ATTTGG	2	12	1215905	1215916	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021171	AAAAAG	2	12	1222323	1222334	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021171	TTAAAC	2	12	1228213	1228224	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_021171	CCGAAA	2	12	1243277	1243288	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021171	CATAAT	2	12	1243335	1243346	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_021171	AATTTT	2	12	1246668	1246679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021171	CTTTTT	2	12	1250925	1250936	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_021171	TAAAAA	2	12	1256146	1256157	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021171	AACCAC	2	12	1263222	1263233	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021171	CCGCTT	2	12	1270821	1270832	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_021171	AACCAG	2	12	1293069	1293080	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021171	TGAAAA	2	12	1309971	1309982	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021171	ACTTCT	2	12	1342522	1342533	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021171	CCTTTT	2	12	1348880	1348891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021171	CTATTT	2	12	1370134	1370145	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_021171	TATTTT	2	12	1422992	1423003	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021171	AGCTCC	2	12	1451507	1451518	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021171	TTCATC	2	12	1478790	1478801	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021171	AAGGTT	2	12	1503430	1503441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021171	TCTTTA	2	12	1506657	1506668	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_021171	TGGAAT	2	12	1529699	1529710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021171	GATAAA	2	12	1532909	1532920	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021171	TTTTAT	2	12	1538019	1538030	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021171	ACAAGA	2	12	1539381	1539392	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_021171	TCTCTT	2	12	1539831	1539842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021171	TTCATT	2	12	1565011	1565022	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_021171	CGAAAG	2	12	1571199	1571210	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_021171	TCAAAA	2	12	1576181	1576192	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_021171	ATTGAT	2	12	1583707	1583718	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021171	TCCTGT	2	12	1589850	1589861	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021171	AAAATT	2	12	1597115	1597126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021171	TAAAAT	2	12	1617672	1617683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021171	TTAAGT	2	12	1618487	1618498	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021171	ATCATT	2	12	1637271	1637282	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_021171	CATAAA	2	12	1647207	1647218	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_021171	TTAAGA	2	12	1657180	1657191	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021171	TTATAA	2	12	1693739	1693750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021171	AGAGCG	2	12	1695124	1695135	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_021171	TCAAAT	2	12	1703634	1703645	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_021171	AGAGCG	2	12	1744385	1744396	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_021171	GCTGGA	2	12	1744450	1744461	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_021171	ATTTTT	2	12	1756616	1756627	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021171	TTTTAA	2	12	1758173	1758184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021171	TAAAAA	2	12	1777821	1777832	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021171	GTTTAT	2	12	1781782	1781793	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021171	AAAATT	2	12	1784602	1784613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021171	TTTTAT	2	12	1826682	1826693	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021171	GAAAAA	2	12	1832129	1832140	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021171	AAATAA	2	12	1845484	1845495	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021171	ATTTAA	2	12	1846835	1846846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021171	ATTTTA	2	12	1904699	1904710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_021171	AAAATA	2	12	3530486	3530497	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_021171	ATTTTT	2	12	3537828	3537839	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_021171	TATAAA	2	12	3568555	3568566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_021171	TTCATA	2	12	3585328	3585339	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
256	NC_021171	TTTTAG	2	12	3606467	3606478	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
257	NC_021171	AAAGCG	2	12	3627340	3627351	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
258	NC_021171	TCTTTA	2	12	3640998	3641009	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
259	NC_021171	TCCAGC	2	12	3650648	3650659	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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281	NC_021171	AAAATA	2	12	3962908	3962919	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.