MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Butyrate-producing bacterium SM4/1

Total Repeats: 30397

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_021024	GCT	2	6	3056519	3056524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30002	NC_021024	ATCCTC	2	12	3056547	3056558	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
30003	NC_021024	CGG	2	6	3056615	3056620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30004	NC_021024	TCC	2	6	3057011	3057016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30005	NC_021024	AGG	2	6	3057082	3057087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30006	NC_021024	CT	3	6	3057109	3057114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30007	NC_021024	GCG	2	6	3057188	3057193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30008	NC_021024	CT	3	6	3057295	3057300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30009	NC_021024	TG	3	6	3057401	3057406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30010	NC_021024	AATTC	2	10	3057420	3057429	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30011	NC_021024	TCC	2	6	3057510	3057515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30012	NC_021024	CTC	2	6	3057557	3057562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30013	NC_021024	CCCG	2	8	3057567	3057574	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30014	NC_021024	GCC	2	6	3057579	3057584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30015	NC_021024	TCC	2	6	3057662	3057667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30016	NC_021024	TGT	2	6	3057686	3057691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30017	NC_021024	ACC	2	6	3057746	3057751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30018	NC_021024	CGC	2	6	3057974	3057979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30019	NC_021024	TCC	2	6	3059267	3059272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30020	NC_021024	CT	3	6	3059325	3059330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30021	NC_021024	TC	3	6	3059336	3059341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30022	NC_021024	GGCC	2	8	3059390	3059397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30023	NC_021024	CGGA	2	8	3059401	3059408	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30024	NC_021024	AGCC	2	8	3059409	3059416	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30025	NC_021024	GAA	2	6	3059495	3059500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30026	NC_021024	CCT	2	6	3059510	3059515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30027	NC_021024	GGA	2	6	3059531	3059536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30028	NC_021024	GGAT	2	8	3059716	3059723	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30029	NC_021024	ATA	2	6	3059728	3059733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30030	NC_021024	CCA	2	6	3059771	3059776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30031	NC_021024	N	1284	1284	3059840	3061123	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30032	NC_021024	TAA	2	6	3061163	3061168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30033	NC_021024	TAAT	2	8	3061194	3061201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30034	NC_021024	TCT	2	6	3061215	3061220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30035	NC_021024	CTC	2	6	3061346	3061351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30036	NC_021024	CTC	2	6	3061376	3061381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30037	NC_021024	CCCT	2	8	3061403	3061410	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
30038	NC_021024	TAA	2	6	3061411	3061416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30039	NC_021024	GCT	2	6	3061424	3061429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30040	NC_021024	TG	3	6	3061487	3061492	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30041	NC_021024	TCC	2	6	3061518	3061523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30042	NC_021024	T	6	6	3061642	3061647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30043	NC_021024	AGGC	2	8	3061739	3061746	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30044	NC_021024	CTC	3	9	3061790	3061798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30045	NC_021024	AATG	2	8	3061846	3061853	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30046	NC_021024	CTGAA	2	10	3061863	3061872	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30047	NC_021024	TCCG	2	8	3062034	3062041	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30048	NC_021024	TC	3	6	3062044	3062049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30049	NC_021024	GAT	2	6	3062093	3062098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30050	NC_021024	CTG	2	6	3062102	3062107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30051	NC_021024	CT	3	6	3062110	3062115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30052	NC_021024	TC	3	6	3062174	3062179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30053	NC_021024	GAT	2	6	3062204	3062209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30054	NC_021024	AT	3	6	3062235	3062240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30055	NC_021024	GT	3	6	3062276	3062281	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30056	NC_021024	TCAG	2	8	3062298	3062305	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30057	NC_021024	CCTC	2	8	3062314	3062321	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
30058	NC_021024	CCT	2	6	3062341	3062346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30059	NC_021024	CTC	2	6	3062402	3062407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30060	NC_021024	AG	3	6	3062426	3062431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30061	NC_021024	TC	3	6	3062435	3062440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30062	NC_021024	TCATAC	2	12	3062484	3062495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30063	NC_021024	N	343	343	3062510	3062852	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30064	NC_021024	CAT	2	6	3062865	3062870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30065	NC_021024	CTT	2	6	3062910	3062915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30066	NC_021024	T	6	6	3062980	3062985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30067	NC_021024	TTC	2	6	3062991	3062996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30068	NC_021024	AAG	2	6	3063010	3063015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30069	NC_021024	AGT	2	6	3063167	3063172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30070	NC_021024	TCC	2	6	3063211	3063216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30071	NC_021024	TCC	2	6	3063220	3063225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30072	NC_021024	AGGA	2	8	3063331	3063338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30073	NC_021024	GGGC	2	8	3063410	3063417	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30074	NC_021024	CCT	2	6	3063506	3063511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30075	NC_021024	CAG	2	6	3063516	3063521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30076	NC_021024	CCG	2	6	3063530	3063535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30077	NC_021024	CTC	2	6	3064024	3064029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30078	NC_021024	GTAT	2	8	3064052	3064059	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30079	NC_021024	TCC	2	6	3064068	3064073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30080	NC_021024	GTC	2	6	3064092	3064097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30081	NC_021024	TCA	2	6	3064151	3064156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30082	NC_021024	AGA	2	6	3064165	3064170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30083	NC_021024	CAC	2	6	3064239	3064244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30084	NC_021024	TGA	2	6	3064259	3064264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30085	NC_021024	CAG	2	6	3064281	3064286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30086	NC_021024	A	6	6	3064376	3064381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30087	NC_021024	TGAGCA	2	12	3064393	3064404	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30088	NC_021024	TCT	2	6	3064524	3064529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30089	NC_021024	TGT	2	6	3064828	3064833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30090	NC_021024	N	971	971	3065744	3066714	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30091	NC_021024	GGA	2	6	3066741	3066746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30092	NC_021024	TC	3	6	3066830	3066835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30093	NC_021024	TTTCC	2	10	3068413	3068422	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
30094	NC_021024	TCT	2	6	3068430	3068435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30095	NC_021024	CTC	2	6	3068815	3068820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30096	NC_021024	AT	3	6	3068905	3068910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30097	NC_021024	T	6	6	3068947	3068952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30098	NC_021024	A	7	7	3069820	3069826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30099	NC_021024	GTCT	2	8	3069838	3069845	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30100	NC_021024	TGA	2	6	3069864	3069869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30101	NC_021024	AC	3	6	3069951	3069956	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30102	NC_021024	GCC	2	6	3069981	3069986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30103	NC_021024	T	6	6	3070001	3070006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30104	NC_021024	AGG	2	6	3070046	3070051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30105	NC_021024	ACAGGA	2	12	3070060	3070071	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30106	NC_021024	TCC	2	6	3070088	3070093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30107	NC_021024	GA	3	6	3070131	3070136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30108	NC_021024	AGTA	2	8	3070174	3070181	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30109	NC_021024	CTGC	2	8	3070335	3070342	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30110	NC_021024	ATC	2	6	3070462	3070467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30111	NC_021024	CAG	2	6	3070473	3070478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30112	NC_021024	GCT	2	6	3070555	3070560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30113	NC_021024	TTC	2	6	3070662	3070667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30114	NC_021024	GTCCT	2	10	3070675	3070684	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
30115	NC_021024	N	1426	1426	3070714	3072139	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30116	NC_021024	CGG	2	6	3072148	3072153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30117	NC_021024	T	6	6	3072201	3072206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30118	NC_021024	GAAAA	2	10	3073219	3073228	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30119	NC_021024	A	6	6	3073225	3073230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30120	NC_021024	TCCG	2	8	3073266	3073273	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30121	NC_021024	T	6	6	3073293	3073298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30122	NC_021024	N	896	896	3074195	3075090	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30123	NC_021024	CTC	2	6	3075091	3075096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30124	NC_021024	AT	3	6	3075102	3075107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30125	NC_021024	TTA	2	6	3075115	3075120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30126	NC_021024	TGA	2	6	3077228	3077233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30127	NC_021024	T	6	6	3077418	3077423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30128	NC_021024	TTG	2	6	3077449	3077454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30129	NC_021024	TCG	2	6	3077522	3077527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30130	NC_021024	CAT	2	6	3077531	3077536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30131	NC_021024	ACAA	2	8	3077541	3077548	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30132	NC_021024	ATG	2	6	3077677	3077682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30133	NC_021024	TGC	2	6	3077753	3077758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30134	NC_021024	TTC	2	6	3077902	3077907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30135	NC_021024	ACA	2	6	3077935	3077940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30136	NC_021024	CTA	2	6	3077942	3077947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30138	NC_021024	CAG	2	6	3078104	3078109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30139	NC_021024	TGA	2	6	3078120	3078125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30140	NC_021024	GA	3	6	3078124	3078129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30141	NC_021024	CAG	2	6	3078146	3078151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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30143	NC_021024	CG	3	6	3078236	3078241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30144	NC_021024	CGC	2	6	3078354	3078359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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30152	NC_021024	TCCG	2	8	3078776	3078783	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30153	NC_021024	ATG	2	6	3078786	3078791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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30172	NC_021024	TA	3	6	3081806	3081811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30173	NC_021024	GCAA	2	8	3081843	3081850	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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30243	NC_021024	AC	4	8	3090324	3090331	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30244	NC_021024	N	201	201	3090381	3090581	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30245	NC_021024	AAGA	2	8	3091388	3091395	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30246	NC_021024	T	7	7	3091462	3091468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30247	NC_021024	GAGG	2	8	3091485	3091492	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
30248	NC_021024	GGA	2	6	3091545	3091550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30249	NC_021024	ATA	2	6	3091594	3091599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30250	NC_021024	TAT	2	6	3091630	3091635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30251	NC_021024	TAAT	2	8	3091647	3091654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30252	NC_021024	TA	3	6	3091691	3091696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30253	NC_021024	AT	3	6	3091697	3091702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30254	NC_021024	AGG	2	6	3091887	3091892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30255	NC_021024	GA	3	6	3091921	3091926	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30256	NC_021024	GAG	2	6	3091952	3091957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30257	NC_021024	GA	3	6	3092137	3092142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30258	NC_021024	GCG	2	6	3092172	3092177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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30260	NC_021024	TGG	2	6	3092430	3092435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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30262	NC_021024	GGC	2	6	3092788	3092793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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30264	NC_021024	GGA	2	6	3092842	3092847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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30383	NC_021024	TTCC	2	8	3108351	3108358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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30388	NC_021024	TGATA	2	10	3108447	3108456	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30389	NC_021024	AAG	2	6	3108488	3108493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30390	NC_021024	CGGTGG	2	12	3108494	3108505	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
30391	NC_021024	CGG	2	6	3108531	3108536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30392	NC_021024	AGG	2	6	3108573	3108578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30393	NC_021024	ATA	2	6	3108631	3108636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30394	NC_021024	GAG	2	6	3108645	3108650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30395	NC_021024	GAC	2	6	3108693	3108698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30396	NC_021024	AG	3	6	3108753	3108758	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30397	NC_021024	ATGAC	2	10	3108763	3108772	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

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