MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 14260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021008	GAC	2	6	518530	518535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_021008	CGA	2	6	518585	518590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_021008	TCG	2	6	518603	518608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_021008	ACG	2	6	518688	518693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_021008	AG	3	6	518776	518781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_021008	CGA	2	6	518798	518803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_021008	CAC	2	6	518804	518809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3008	NC_021008	A	7	7	518825	518831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_021008	GC	3	6	518970	518975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3010	NC_021008	TGG	2	6	519012	519017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_021008	AGC	2	6	519019	519024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_021008	CT	3	6	519036	519041	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3013	NC_021008	GTT	2	6	519103	519108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_021008	CGA	2	6	519161	519166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_021008	GCC	2	6	519201	519206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3016	NC_021008	CATC	2	8	519242	519249	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3017	NC_021008	GTC	2	6	519267	519272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_021008	ACG	2	6	519273	519278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_021008	CTG	2	6	519306	519311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_021008	GGTCTG	2	12	519354	519365	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3021	NC_021008	GAT	2	6	519384	519389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_021008	ATT	2	6	519532	519537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_021008	GA	3	6	519569	519574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_021008	TCG	2	6	519578	519583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_021008	CGA	2	6	521043	521048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_021008	TCCG	2	8	521059	521066	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3027	NC_021008	TTC	2	6	521084	521089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_021008	GGCG	2	8	521689	521696	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3029	NC_021008	TGG	2	6	521701	521706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_021008	GCG	2	6	522655	522660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_021008	GGA	2	6	522724	522729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_021008	CCTA	2	8	522738	522745	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3033	NC_021008	CAG	2	6	522786	522791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_021008	GAC	2	6	522801	522806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_021008	CCG	2	6	522859	522864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3036	NC_021008	ACG	2	6	522949	522954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_021008	CGG	2	6	522962	522967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_021008	CTGT	2	8	522996	523003	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3039	NC_021008	GCC	2	6	523124	523129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_021008	GC	3	6	523131	523136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3041	NC_021008	GCG	2	6	523145	523150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_021008	TTG	2	6	527694	527699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_021008	GCG	2	6	527736	527741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_021008	GTC	2	6	527756	527761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_021008	TCGACT	2	12	527871	527882	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_021008	GT	3	6	527952	527957	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_021008	CTG	2	6	527996	528001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_021008	GCT	2	6	528019	528024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_021008	CTG	2	6	528037	528042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_021008	CTT	2	6	528049	528054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_021008	GCT	2	6	528076	528081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_021008	CGGCTT	2	12	528172	528183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_021008	GGC	2	6	528188	528193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_021008	CCG	2	6	528232	528237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3055	NC_021008	CTTG	2	8	528293	528300	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3056	NC_021008	CAA	2	6	528322	528327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_021008	CCG	3	9	528328	528336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3058	NC_021008	AAC	2	6	528374	528379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_021008	CTG	2	6	528420	528425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_021008	TCG	2	6	528448	528453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_021008	CTG	2	6	528467	528472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_021008	CTG	2	6	528500	528505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_021008	TCG	2	6	528630	528635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_021008	TCG	2	6	528702	528707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_021008	CCG	2	6	528718	528723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3066	NC_021008	CAAA	2	8	528760	528767	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3067	NC_021008	TCG	2	6	528804	528809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_021008	CAA	2	6	528896	528901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_021008	CAC	2	6	528917	528922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3070	NC_021008	CAT	2	6	529045	529050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_021008	AC	3	6	529168	529173	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3072	NC_021008	CCTCGT	2	12	529297	529308	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3073	NC_021008	GGC	2	6	529803	529808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_021008	TAA	2	6	529833	529838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_021008	CG	3	6	531512	531517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3076	NC_021008	CCTT	2	8	531518	531525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3077	NC_021008	GT	3	6	531532	531537	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_021008	GTT	2	6	531554	531559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_021008	ATT	2	6	531564	531569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_021008	CAGT	2	8	531574	531581	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3081	NC_021008	CG	3	6	531657	531662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3082	NC_021008	GCA	2	6	531710	531715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_021008	AG	3	6	531757	531762	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_021008	CCG	2	6	533197	533202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3085	NC_021008	TGT	2	6	533245	533250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_021008	GAT	2	6	533283	533288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_021008	GGC	2	6	533344	533349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_021008	GAA	2	6	533388	533393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_021008	A	6	6	533398	533403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_021008	GA	3	6	533474	533479	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_021008	TCC	2	6	536335	536340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3092	NC_021008	ATT	2	6	536356	536361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_021008	TGC	2	6	536373	536378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_021008	CGT	2	6	536455	536460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_021008	CTG	2	6	536505	536510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_021008	GTT	2	6	536534	536539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_021008	TGGC	2	8	536545	536552	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3098	NC_021008	AACGGT	2	12	536637	536648	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3099	NC_021008	CGA	2	6	536681	536686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_021008	ATC	2	6	536696	536701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_021008	ACG	2	6	536713	536718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_021008	GTG	2	6	536722	536727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_021008	CAG	2	6	536779	536784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_021008	GAT	2	6	536839	536844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_021008	TTC	2	6	536854	536859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_021008	TCC	2	6	536879	536884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3107	NC_021008	TGC	2	6	536891	536896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_021008	GC	3	6	536920	536925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3109	NC_021008	CAG	2	6	536999	537004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_021008	GCC	2	6	537005	537010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3111	NC_021008	CAA	2	6	537019	537024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_021008	CGTT	2	8	537741	537748	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3113	NC_021008	CGT	2	6	537777	537782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_021008	CGC	2	6	537861	537866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3115	NC_021008	CGG	2	6	537900	537905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_021008	CATA	2	8	537917	537924	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3117	NC_021008	ACTC	2	8	537954	537961	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3118	NC_021008	CAC	2	6	537971	537976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3119	NC_021008	GCC	2	6	538049	538054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3120	NC_021008	CA	3	6	538055	538060	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3121	NC_021008	CCA	2	6	538109	538114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3122	NC_021008	CGC	2	6	538122	538127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3123	NC_021008	CCA	2	6	538185	538190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3124	NC_021008	CAAC	2	8	538228	538235	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3125	NC_021008	GCG	2	6	538241	538246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_021008	GGAAT	2	10	540959	540968	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_021008	GTG	2	6	540992	540997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_021008	ATC	2	6	541033	541038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_021008	ACA	2	6	541080	541085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_021008	T	6	6	541107	541112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_021008	AAT	2	6	541119	541124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_021008	AATG	2	8	541202	541209	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_021008	CAAG	2	8	541399	541406	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3134	NC_021008	ATC	2	6	541501	541506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3139	NC_021008	ATG	2	6	541816	541821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3141	NC_021008	ATC	2	6	541918	541923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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