MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 14260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021008	GGA	2	6	176744	176749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_021008	CCTT	2	8	178394	178401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_021008	GCG	2	6	180390	180395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_021008	TGC	2	6	180403	180408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_021008	CGG	2	6	180410	180415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_021008	CGC	2	6	180418	180423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_021008	ATGG	2	8	180465	180472	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_021008	GCA	2	6	181885	181890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_021008	GTT	2	6	181975	181980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_021008	GTT	2	6	181999	182004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_021008	TCC	2	6	182011	182016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_021008	GCC	2	6	182043	182048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_021008	ATAC	2	8	182049	182056	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_021008	A	6	6	182411	182416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_021008	TCC	2	6	184107	184112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_021008	GAC	2	6	184157	184162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_021008	CGCC	2	8	184225	184232	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1018	NC_021008	CGG	2	6	184248	184253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_021008	TGCG	2	8	184320	184327	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_021008	AGAA	2	8	184630	184637	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_021008	ATT	2	6	184729	184734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021008	CAA	2	6	184795	184800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_021008	TTC	2	6	185496	185501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_021008	TCA	2	6	185539	185544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_021008	CCA	2	6	185547	185552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_021008	CAC	2	6	185553	185558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_021008	GTG	2	6	185592	185597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_021008	AGT	2	6	186312	186317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_021008	G	6	6	186324	186329	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_021008	GCCT	2	8	187459	187466	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_021008	AAGG	2	8	187472	187479	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_021008	GC	3	6	187486	187491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_021008	CGT	2	6	187515	187520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_021008	GGC	2	6	187521	187526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_021008	GCG	2	6	187528	187533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_021008	GATG	2	8	187538	187545	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_021008	CGA	2	6	187565	187570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_021008	GCC	2	6	187609	187614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_021008	TGG	2	6	187618	187623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_021008	GCC	2	6	187725	187730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_021008	CGC	2	6	187748	187753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_021008	ACGC	2	8	187850	187857	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_021008	ATC	2	6	187885	187890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_021008	GCT	2	6	187907	187912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_021008	GC	3	6	187920	187925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_021008	GGA	2	6	187979	187984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_021008	CAC	2	6	187994	187999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_021008	CGT	2	6	188004	188009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_021008	CGA	2	6	188047	188052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_021008	CG	3	6	188166	188171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_021008	TCG	2	6	188260	188265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_021008	CAC	2	6	188291	188296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_021008	GACT	2	8	188332	188339	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1054	NC_021008	TTGCTG	2	12	191093	191104	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1055	NC_021008	GGC	2	6	191116	191121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_021008	CAT	2	6	191163	191168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_021008	CAC	2	6	191212	191217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_021008	CAG	3	9	191231	191239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_021008	CGA	2	6	191254	191259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_021008	TTC	2	6	191326	191331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_021008	TTC	2	6	191422	191427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_021008	GCG	2	6	191445	191450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_021008	CGA	2	6	191458	191463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_021008	AGA	2	6	191466	191471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_021008	GAG	2	6	191480	191485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_021008	TGA	2	6	191487	191492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_021008	ACC	2	6	191528	191533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_021008	GTT	2	6	191604	191609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_021008	T	6	6	191611	191616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_021008	CGG	2	6	192218	192223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_021008	GCCA	2	8	192236	192243	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_021008	GAA	2	6	192249	192254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_021008	GCC	2	6	192258	192263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_021008	GGC	2	6	192287	192292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_021008	GTT	2	6	192402	192407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_021008	GAT	2	6	192486	192491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_021008	CTG	2	6	192510	192515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_021008	CT	3	6	192527	192532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_021008	ATT	2	6	192575	192580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_021008	CA	3	6	192590	192595	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_021008	CGG	2	6	192616	192621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_021008	GGC	2	6	192635	192640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_021008	GGC	2	6	192642	192647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_021008	AGGA	2	8	192718	192725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_021008	GCG	2	6	192733	192738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_021008	GGC	2	6	192753	192758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_021008	CAA	2	6	192797	192802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_021008	CCGGC	2	10	192829	192838	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1089	NC_021008	CGT	2	6	192845	192850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_021008	ATC	2	6	192859	192864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_021008	CTGG	2	8	193046	193053	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1092	NC_021008	TGA	2	6	193117	193122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_021008	GCC	2	6	193248	193253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_021008	GGA	2	6	193274	193279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_021008	ATC	2	6	193324	193329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_021008	GAT	2	6	193368	193373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_021008	CGC	2	6	193382	193387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1098	NC_021008	GCC	2	6	193398	193403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_021008	CGCCCG	2	12	193447	193458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_021008	CGC	2	6	193538	193543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_021008	GCC	2	6	193602	193607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_021008	CCG	2	6	193636	193641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_021008	CTA	2	6	193700	193705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_021008	AGCG	2	8	193743	193750	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_021008	ACC	2	6	193752	193757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_021008	CGG	2	6	193772	193777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_021008	TCA	2	6	193851	193856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_021008	TGA	2	6	193860	193865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_021008	AGG	2	6	193912	193917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_021008	ACA	2	6	193981	193986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_021008	ATT	2	6	193998	194003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_021008	AGAAGC	2	12	194009	194020	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1113	NC_021008	CAG	2	6	194043	194048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_021008	TCGT	2	8	194067	194074	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1115	NC_021008	AAC	2	6	194131	194136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_021008	TGA	2	6	194245	194250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_021008	GAA	2	6	194270	194275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_021008	CGC	2	6	194311	194316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_021008	CATGG	2	10	194330	194339	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1120	NC_021008	TTG	2	6	194477	194482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_021008	GC	3	6	194534	194539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_021008	CA	3	6	195215	195220	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_021008	CGGG	2	8	195258	195265	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1124	NC_021008	CGC	2	6	195268	195273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_021008	TC	3	6	196776	196781	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_021008	CCA	2	6	196813	196818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_021008	ACT	2	6	196820	196825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_021008	AACCG	2	10	196839	196848	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1129	NC_021008	TGA	2	6	199540	199545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_021008	AAG	2	6	199583	199588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_021008	GAC	2	6	199913	199918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_021008	CCGA	2	8	199926	199933	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_021008	TGT	2	6	199951	199956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_021008	TAT	2	6	199982	199987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_021008	CTT	2	6	201663	201668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_021008	TCAG	2	8	201689	201696	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1137	NC_021008	GGA	2	6	201733	201738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1402	NC_021008	CCT	2	6	251632	251637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1403	NC_021008	TCT	2	6	251662	251667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1404	NC_021008	ATC	2	6	251676	251681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1405	NC_021008	ACT	2	6	251683	251688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1423	NC_021008	GCG	2	6	254175	254180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1430	NC_021008	TACT	2	8	256775	256782	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1433	NC_021008	GCCG	2	8	258912	258919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1434	NC_021008	GC	3	6	258920	258925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1435	NC_021008	CAT	2	6	264045	264050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1436	NC_021008	CTT	2	6	264103	264108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1437	NC_021008	ACC	2	6	264125	264130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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