MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 14260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021008	GCG	2	6	1654328	1654333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_021008	N	391	391	1654349	1654739	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_021008	CGG	2	6	1654767	1654772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_021008	GCG	2	6	1654823	1654828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_021008	GCG	2	6	1654878	1654883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_021008	CGC	3	9	1654984	1654992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10007	NC_021008	ATG	2	6	1654999	1655004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_021008	GAA	2	6	1655041	1655046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_021008	CACG	2	8	1655079	1655086	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10010	NC_021008	TGG	2	6	1655163	1655168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_021008	ATG	2	6	1655201	1655206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_021008	GGTCG	2	10	1655218	1655227	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10013	NC_021008	TCG	2	6	1655243	1655248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_021008	CAG	2	6	1655251	1655256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10015	NC_021008	GCT	3	9	1655298	1655306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_021008	TGG	2	6	1655391	1655396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_021008	CCG	2	6	1655398	1655403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10018	NC_021008	AGC	2	6	1655459	1655464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_021008	CGG	2	6	1655495	1655500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10020	NC_021008	TGG	2	6	1655565	1655570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_021008	CAG	2	6	1655587	1655592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10022	NC_021008	GCCGGA	2	12	1655611	1655622	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_021008	GTC	2	6	1655671	1655676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_021008	TTG	2	6	1656924	1656929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_021008	GGCA	2	8	1656957	1656964	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10026	NC_021008	GCCT	2	8	1657018	1657025	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10027	NC_021008	CCGG	2	8	1657035	1657042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10028	NC_021008	CACAC	2	10	1657171	1657180	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
10029	NC_021008	GCG	3	9	1657191	1657199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_021008	GCT	2	6	1657208	1657213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_021008	T	7	7	1659389	1659395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_021008	A	6	6	1660872	1660877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_021008	CGG	2	6	1660963	1660968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10034	NC_021008	ATGA	2	8	1660969	1660976	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_021008	GTC	2	6	1665462	1665467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_021008	TGT	2	6	1667351	1667356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_021008	CTCTG	2	10	1667362	1667371	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10038	NC_021008	GCG	2	6	1667382	1667387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_021008	TAC	2	6	1668357	1668362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10040	NC_021008	TTG	2	6	1668372	1668377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_021008	GC	3	6	1668433	1668438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10042	NC_021008	CCTG	2	8	1668442	1668449	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10043	NC_021008	ACT	2	6	1668463	1668468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_021008	TCT	2	6	1669243	1669248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10045	NC_021008	TGA	2	6	1669396	1669401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_021008	GAA	2	6	1669412	1669417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_021008	AAT	2	6	1669460	1669465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_021008	CAT	2	6	1669482	1669487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_021008	GA	3	6	1669524	1669529	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_021008	GCC	2	6	1669540	1669545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10051	NC_021008	CCAT	2	8	1669548	1669555	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10052	NC_021008	GAC	2	6	1670865	1670870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10053	NC_021008	CG	3	6	1670879	1670884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10054	NC_021008	GCCC	2	8	1670932	1670939	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10055	NC_021008	GTC	2	6	1671017	1671022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10056	NC_021008	TCG	2	6	1671027	1671032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10057	NC_021008	TC	3	6	1671056	1671061	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10058	NC_021008	CAGG	2	8	1675180	1675187	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10059	NC_021008	TTC	2	6	1675195	1675200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_021008	GAT	2	6	1675242	1675247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_021008	CTG	2	6	1675255	1675260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_021008	GCC	2	6	1675261	1675266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10063	NC_021008	GCG	2	6	1675327	1675332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10064	NC_021008	GAG	2	6	1675367	1675372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_021008	GAA	2	6	1675398	1675403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_021008	GCG	2	6	1675472	1675477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10067	NC_021008	CTGG	2	8	1675507	1675514	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10068	NC_021008	CG	3	6	1675586	1675591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10069	NC_021008	CGC	2	6	1675706	1675711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10070	NC_021008	CCGA	2	8	1675833	1675840	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10071	NC_021008	CCG	2	6	1676030	1676035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10072	NC_021008	GCCG	2	8	1676160	1676167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10073	NC_021008	TGC	2	6	1676239	1676244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10074	NC_021008	TGG	2	6	1676273	1676278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_021008	CCG	2	6	1676354	1676359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10076	NC_021008	ACC	2	6	1676436	1676441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10077	NC_021008	GCG	2	6	1676575	1676580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10078	NC_021008	CTG	2	6	1676637	1676642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10079	NC_021008	CG	3	6	1676664	1676669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10080	NC_021008	GGC	2	6	1676670	1676675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10081	NC_021008	CTT	2	6	1676889	1676894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10082	NC_021008	TTC	2	6	1676946	1676951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10083	NC_021008	CAC	2	6	1676987	1676992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10084	NC_021008	ACC	2	6	1677040	1677045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10085	NC_021008	ATGA	2	8	1677172	1677179	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_021008	ATC	2	6	1677204	1677209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10087	NC_021008	AAT	2	6	1677277	1677282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_021008	ACAG	2	8	1677328	1677335	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10089	NC_021008	CCA	2	6	1677398	1677403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10090	NC_021008	TGGA	2	8	1677457	1677464	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_021008	CGGCG	2	10	1677483	1677492	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10092	NC_021008	CAT	2	6	1677494	1677499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10093	NC_021008	GACA	2	8	1677573	1677580	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10094	NC_021008	GAC	2	6	1677598	1677603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_021008	CGT	2	6	1677696	1677701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10096	NC_021008	AG	3	6	1677703	1677708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_021008	CAT	2	6	1677719	1677724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10098	NC_021008	TCA	2	6	1677836	1677841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_021008	TA	3	6	1677861	1677866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_021008	CGA	2	6	1677987	1677992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_021008	CGG	2	6	1678043	1678048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_021008	TGA	2	6	1678061	1678066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_021008	CAT	2	6	1678127	1678132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10104	NC_021008	CTC	2	6	1678137	1678142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10105	NC_021008	CGG	2	6	1678163	1678168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10106	NC_021008	GCC	2	6	1678344	1678349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10107	NC_021008	TTC	2	6	1678359	1678364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10108	NC_021008	GCC	2	6	1678376	1678381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10109	NC_021008	CACGG	2	10	1678386	1678395	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10110	NC_021008	CTC	2	6	1678488	1678493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10111	NC_021008	AAG	2	6	1678495	1678500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_021008	GTG	2	6	1678516	1678521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_021008	CAT	2	6	1678529	1678534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10114	NC_021008	CAG	2	6	1678542	1678547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10115	NC_021008	CA	4	8	1678569	1678576	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10116	NC_021008	ATC	2	6	1678590	1678595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10117	NC_021008	CGG	2	6	1678604	1678609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10118	NC_021008	CAC	2	6	1678623	1678628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10119	NC_021008	CCA	2	6	1678640	1678645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10120	NC_021008	AT	3	6	1678702	1678707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_021008	CG	3	6	1678750	1678755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10122	NC_021008	TCC	2	6	1678756	1678761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10123	NC_021008	GCC	2	6	1678893	1678898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10124	NC_021008	TTG	2	6	1678929	1678934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_021008	CCGGCA	2	12	1678978	1678989	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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10127	NC_021008	ATC	2	6	1679055	1679060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10128	NC_021008	GCA	2	6	1679102	1679107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10130	NC_021008	GTG	2	6	1679203	1679208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10247	NC_021008	ACC	2	6	1699157	1699162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10252	NC_021008	GTG	2	6	1699359	1699364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10253	NC_021008	CAG	2	6	1699367	1699372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10254	NC_021008	TCGGC	2	10	1699429	1699438	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10255	NC_021008	CGGA	2	8	1699450	1699457	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10256	NC_021008	CTT	2	6	1699463	1699468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10365	NC_021008	TGCA	2	8	1718094	1718101	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10366	NC_021008	AG	3	6	1718111	1718116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10367	NC_021008	GCACC	2	10	1721789	1721798	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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10374	NC_021008	GTG	2	6	1726709	1726714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10375	NC_021008	AGGA	2	8	1726752	1726759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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