MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 14260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021008	CGTG	2	8	72422	72429	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
502	NC_021008	CGG	2	6	72484	72489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_021008	GAC	2	6	74388	74393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_021008	CGGC	2	8	74426	74433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
505	NC_021008	ATG	2	6	74448	74453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_021008	GTC	2	6	75707	75712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_021008	AGCGC	2	10	75778	75787	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
508	NC_021008	ACA	2	6	77468	77473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_021008	GGA	2	6	77535	77540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_021008	CT	3	6	78359	78364	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
511	NC_021008	GAA	2	6	78378	78383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_021008	GCA	2	6	78424	78429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_021008	GATG	2	8	79355	79362	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_021008	TG	3	6	80401	80406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_021008	CTT	2	6	80415	80420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_021008	A	6	6	80423	80428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_021008	CTT	2	6	80717	80722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_021008	TCA	2	6	81128	81133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_021008	CGG	2	6	81433	81438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_021008	C	6	6	81456	81461	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
521	NC_021008	GAT	2	6	81513	81518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_021008	GA	3	6	81534	81539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
523	NC_021008	CA	3	6	81546	81551	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
524	NC_021008	ACG	2	6	81574	81579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_021008	AGT	2	6	81703	81708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_021008	C	6	6	81726	81731	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
527	NC_021008	CT	3	6	81734	81739	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
528	NC_021008	CGAT	2	8	81777	81784	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
529	NC_021008	ACGC	2	8	81786	81793	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
530	NC_021008	CTTT	2	8	82079	82086	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
531	NC_021008	CCG	2	6	82090	82095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_021008	GCGG	2	8	82173	82180	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
533	NC_021008	ACC	2	6	82189	82194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_021008	A	6	6	82246	82251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_021008	CGC	2	6	82276	82281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_021008	CG	3	6	83599	83604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
537	NC_021008	GAC	2	6	83716	83721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_021008	AC	3	6	83729	83734	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
539	NC_021008	CGC	2	6	83737	83742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_021008	TTG	2	6	84706	84711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_021008	TCT	2	6	84723	84728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_021008	GC	3	6	86864	86869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
543	NC_021008	TCCT	2	8	86870	86877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
544	NC_021008	TCT	2	6	86890	86895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_021008	ATT	2	6	87053	87058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_021008	CAC	2	6	87740	87745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_021008	GCCG	2	8	90037	90044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
548	NC_021008	AT	3	6	90053	90058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_021008	GGGA	2	8	90071	90078	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
550	NC_021008	GAG	2	6	90138	90143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_021008	CGG	2	6	90205	90210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_021008	ACC	2	6	90269	90274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_021008	CGTGCG	2	12	90316	90327	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_021008	TCG	2	6	90339	90344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_021008	CAG	2	6	90353	90358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_021008	CAC	2	6	90394	90399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_021008	CGATG	2	10	90415	90424	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
558	NC_021008	CCG	2	6	90498	90503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_021008	ACA	2	6	90555	90560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_021008	GAG	2	6	90692	90697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_021008	CAG	2	6	90728	90733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_021008	TCC	2	6	90825	90830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_021008	CAG	2	6	90833	90838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_021008	TGG	2	6	90840	90845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021008	TCC	2	6	91453	91458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_021008	GAT	2	6	91462	91467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_021008	GTG	2	6	91468	91473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
568	NC_021008	CGA	2	6	91540	91545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_021008	GAA	2	6	91551	91556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_021008	CTG	2	6	92532	92537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_021008	CCTT	2	8	95940	95947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
572	NC_021008	GTT	2	6	95951	95956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_021008	CTG	2	6	96007	96012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_021008	GGT	2	6	96022	96027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_021008	CGT	3	9	96076	96084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_021008	GGT	2	6	96209	96214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
577	NC_021008	AGC	2	6	96291	96296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_021008	GAA	2	6	96317	96322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_021008	GCA	2	6	96349	96354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_021008	GAA	2	6	96401	96406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_021008	TGG	2	6	96448	96453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_021008	CAC	2	6	96458	96463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_021008	TGCGG	2	10	96490	96499	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
584	NC_021008	CGC	2	6	96565	96570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_021008	TGG	2	6	96595	96600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_021008	TCG	2	6	96606	96611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_021008	AGC	2	6	96657	96662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_021008	GC	3	6	96679	96684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
589	NC_021008	GC	3	6	96726	96731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
590	NC_021008	CGA	2	6	96790	96795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_021008	GTC	3	9	96812	96820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_021008	GGA	2	6	96896	96901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021008	GTC	2	6	97035	97040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_021008	CGG	2	6	97285	97290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_021008	AAC	2	6	97335	97340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_021008	CTG	3	9	97921	97929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_021008	CGGT	2	8	97945	97952	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
598	NC_021008	GTT	2	6	97977	97982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_021008	TGA	2	6	98039	98044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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601	NC_021008	TGATC	2	10	98264	98273	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
602	NC_021008	GGT	2	6	98277	98282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_021008	CGA	2	6	98387	98392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_021008	TGG	2	6	98417	98422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_021008	TAG	2	6	98525	98530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_021008	TTCAAA	2	12	98554	98565	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
607	NC_021008	TAT	2	6	98599	98604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_021008	C	6	6	98650	98655	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
609	NC_021008	GA	3	6	100297	100302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
610	NC_021008	CAC	2	6	101027	101032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_021008	GCC	2	6	101157	101162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_021008	GCA	3	9	101163	101171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_021008	GGT	2	6	101208	101213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_021008	TGAG	2	8	101228	101235	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
615	NC_021008	GTA	2	6	101314	101319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_021008	GCC	2	6	101389	101394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_021008	GTT	2	6	101434	101439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_021008	GTG	2	6	101465	101470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
619	NC_021008	GAG	2	6	101494	101499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_021008	CGC	2	6	101581	101586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_021008	CAT	2	6	101616	101621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_021008	ACC	2	6	101659	101664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_021008	GAA	2	6	101692	101697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_021008	CGC	2	6	101714	101719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_021008	GCA	2	6	101751	101756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_021008	GGC	2	6	101803	101808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_021008	CGC	2	6	101824	101829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_021008	CGG	2	6	102700	102705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_021008	CGC	2	6	102797	102802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_021008	GCT	2	6	102803	102808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_021008	TTCCA	2	10	102883	102892	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
632	NC_021008	GAC	2	6	102927	102932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_021008	TCCGAG	2	12	102933	102944	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_021008	CGG	2	6	102959	102964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_021008	TCG	2	6	102982	102987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_021008	GCG	2	6	102988	102993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_021008	TCG	2	6	103025	103030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_021008	GCCG	2	8	103074	103081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
639	NC_021008	CGC	2	6	103119	103124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
640	NC_021008	TTC	2	6	103187	103192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_021008	GCG	2	6	103363	103368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_021008	CGT	2	6	103379	103384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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771	NC_021008	GGA	2	6	138288	138293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
772	NC_021008	GCC	2	6	138300	138305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
773	NC_021008	ACC	2	6	138367	138372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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