MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 14260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021008	CCG	2	6	942958	942963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6002	NC_021008	TC	3	6	943012	943017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6003	NC_021008	GGC	2	6	943152	943157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_021008	ACG	2	6	943238	943243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_021008	AGCC	2	8	943386	943393	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6006	NC_021008	TCT	2	6	943412	943417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_021008	CTG	2	6	943427	943432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_021008	TA	3	6	943445	943450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_021008	AT	3	6	943487	943492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_021008	CGGT	2	8	943548	943555	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6011	NC_021008	GAT	2	6	943556	943561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_021008	AGG	2	6	943604	943609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_021008	GCT	2	6	944286	944291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_021008	T	6	6	944343	944348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_021008	AAG	2	6	944352	944357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_021008	CTG	2	6	944372	944377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_021008	ACC	2	6	944409	944414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6018	NC_021008	TTG	2	6	944449	944454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_021008	TAGT	2	8	947342	947349	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_021008	TCA	2	6	947395	947400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_021008	CG	3	6	947424	947429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6022	NC_021008	CGT	2	6	947459	947464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_021008	GGCC	2	8	948021	948028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6024	NC_021008	TTC	2	6	948093	948098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_021008	CGC	2	6	948115	948120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6026	NC_021008	GC	3	6	948155	948160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6027	NC_021008	GC	3	6	948232	948237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6028	NC_021008	CAC	2	6	948252	948257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6029	NC_021008	CCA	2	6	948278	948283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6030	NC_021008	CGA	2	6	948298	948303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_021008	GC	3	6	948315	948320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6032	NC_021008	GAA	2	6	948341	948346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_021008	CGT	2	6	948373	948378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_021008	GCG	2	6	948528	948533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_021008	CGG	2	6	948539	948544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_021008	TCT	2	6	948578	948583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_021008	CG	3	6	948606	948611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6038	NC_021008	CACGG	2	10	948650	948659	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6039	NC_021008	ACG	2	6	948668	948673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_021008	CGC	3	9	948679	948687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6041	NC_021008	CCT	2	6	948707	948712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6042	NC_021008	CGG	2	6	948782	948787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_021008	TTC	2	6	948866	948871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_021008	CGA	3	9	948941	948949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_021008	AG	3	6	950332	950337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_021008	GGA	2	6	951111	951116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_021008	TTC	2	6	951136	951141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_021008	TCA	2	6	951165	951170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_021008	CTG	2	6	951182	951187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_021008	GCG	2	6	951218	951223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_021008	CGA	2	6	951255	951260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_021008	AAG	2	6	951349	951354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_021008	TGG	2	6	951355	951360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_021008	GCA	2	6	951401	951406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_021008	GCAC	2	8	951426	951433	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6056	NC_021008	AC	3	6	951513	951518	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6057	NC_021008	CAT	2	6	951570	951575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_021008	AAG	2	6	951616	951621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_021008	AAG	2	6	951664	951669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_021008	ATG	2	6	951689	951694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_021008	CCG	2	6	951722	951727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6062	NC_021008	CAG	2	6	951799	951804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_021008	GAA	2	6	951811	951816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_021008	CGG	2	6	954278	954283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_021008	TAA	2	6	955383	955388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_021008	GAA	2	6	955405	955410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_021008	T	6	6	955461	955466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_021008	CA	3	6	955500	955505	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6069	NC_021008	GC	3	6	955535	955540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6070	NC_021008	AGG	2	6	955575	955580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_021008	CGG	2	6	956260	956265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_021008	CG	3	6	956281	956286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6073	NC_021008	GGAA	2	8	956293	956300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_021008	GTG	2	6	956306	956311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6077	NC_021008	GA	3	6	956430	956435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_021008	AGG	2	6	956438	956443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6083	NC_021008	AAG	2	6	956559	956564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_021008	GAA	2	6	956612	956617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_021008	GAA	2	6	956624	956629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_021008	TGA	2	6	956684	956689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6092	NC_021008	CGA	3	9	956798	956806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_021008	GAC	2	6	956817	956822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_021008	GAA	2	6	956832	956837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6098	NC_021008	CAT	2	6	956915	956920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6101	NC_021008	CCG	2	6	956965	956970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6102	NC_021008	CTG	2	6	957012	957017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_021008	GGCC	2	8	957056	957063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6104	NC_021008	CAAGCG	2	12	957110	957121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6108	NC_021008	TCGC	2	8	957198	957205	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6109	NC_021008	TTGAT	2	10	957238	957247	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_021008	GAA	2	6	957296	957301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_021008	GTG	2	6	957329	957334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_021008	TGC	2	6	957442	957447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_021008	TCCG	2	8	957623	957630	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6114	NC_021008	TCA	2	6	957706	957711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_021008	GAC	2	6	957753	957758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_021008	GT	3	6	957766	957771	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_021008	CCCGT	2	10	957833	957842	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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6120	NC_021008	GGT	2	6	960318	960323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_021008	TC	3	6	960341	960346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6122	NC_021008	TGC	2	6	960388	960393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_021008	ATC	2	6	960399	960404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_021008	CCG	3	9	960423	960431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6125	NC_021008	CAT	2	6	960454	960459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_021008	CG	3	6	960471	960476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6127	NC_021008	TGA	2	6	960561	960566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_021008	CTA	2	6	961864	961869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6130	NC_021008	CCT	2	6	968428	968433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6131	NC_021008	TCTCT	2	10	968462	968471	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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6133	NC_021008	AAC	2	6	971364	971369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6397	NC_021008	GCTG	2	8	1029918	1029925	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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6399	NC_021008	GTT	2	6	1029982	1029987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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