MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus subtilis subsp. subtilis str. BAB-1

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020832	TTTCCC	2	12	3134	3145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020832	ATAAAT	2	12	45473	45484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020832	AGGAAA	2	12	241741	241752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020832	GTTTTT	2	12	274666	274677	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020832	AAATGA	2	12	299119	299130	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020832	TTCATT	2	12	329177	329188	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_020832	TTTTTA	2	12	360789	360800	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020832	ATTTTT	2	12	367605	367616	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020832	CCGTTG	2	12	368382	368393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020832	CAGCGG	2	12	369170	369181	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020832	GTTCAG	2	12	375309	375320	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020832	ATGAAA	2	12	381513	381524	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020832	CTCAGC	2	12	384578	384589	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020832	GCCGAA	2	12	384796	384807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020832	ATGATA	2	12	423356	423367	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020832	AGAGAC	2	12	440159	440170	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_020832	TTTTTA	2	12	440643	440654	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020832	TCCTTT	2	12	484548	484559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020832	ATTTTT	2	12	520163	520174	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020832	TTCAAA	2	12	590644	590655	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_020832	TTTTGA	2	12	667589	667600	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020832	CTTTCT	2	12	677130	677141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020832	TCTCCT	2	12	698805	698816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_020832	GTATAG	2	12	715374	715385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020832	TGGGGG	2	12	719800	719811	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020832	TTCTGC	2	12	721248	721259	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020832	ACATAT	2	12	759636	759647	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_020832	TACTTT	2	12	820036	820047	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_020832	CAATGG	2	12	865673	865684	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_020832	ATTTAA	2	12	870439	870450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020832	GAACAA	2	12	908029	908040	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_020832	CTTTTT	2	12	918550	918561	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_020832	GCGGAA	2	12	925431	925442	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_020832	TAAAAA	2	12	952918	952929	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020832	CTTTTT	2	12	971808	971819	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_020832	TCTTTT	2	12	1038557	1038568	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_020832	CGGAAG	2	12	1039441	1039452	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_020832	GAAAAA	2	12	1058679	1058690	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020832	TTTTCA	2	12	1067385	1067396	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_020832	GAATTT	2	12	1067880	1067891	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020832	CTTTTT	2	12	1078772	1078783	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_020832	CGGACC	2	12	1117983	1117994	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020832	GGTTAA	2	12	1193041	1193052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020832	GAAAAA	2	12	1213418	1213429	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020832	TATACT	2	12	1233772	1233783	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_020832	GAAAAG	2	12	1252529	1252540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020832	GTTAAC	2	12	1263631	1263642	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_020832	AAATCA	2	12	1298301	1298312	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_020832	AATTCA	2	12	1349909	1349920	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_020832	ATGAAA	2	12	1391010	1391021	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020832	TCTTTT	2	12	1405839	1405850	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_020832	TACATA	2	12	1406020	1406031	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_020832	ATAATT	2	12	1413208	1413219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020832	AAAGGA	2	12	1423739	1423750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020832	ATCATT	2	12	1442189	1442200	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_020832	ATCATT	2	12	1445622	1445633	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_020832	TTTGCT	2	12	1454117	1454128	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_020832	CTTTTT	2	12	1535343	1535354	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_020832	AATATG	2	12	1682095	1682106	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020832	TCCTTC	2	12	1700849	1700860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_020832	TATAAA	2	12	1744372	1744383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020832	CTTGGC	2	12	1768398	1768409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020832	ATCATG	2	12	1772697	1772708	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_020832	GGGTGC	2	12	1776512	1776523	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_020832	TGATGC	2	12	1779998	1780009	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_020832	TTATGA	2	12	1820583	1820594	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020832	GCTTAG	2	12	1849600	1849611	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_020832	CATCAC	2	12	1862098	1862109	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_020832	ATCGAA	2	12	1862381	1862392	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_020832	TGAAAT	2	12	1884503	1884514	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020832	TTTTAA	2	12	1900399	1900410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020832	AATTTC	2	12	1909756	1909767	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_020832	CTCTAG	2	12	1909906	1909917	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020832	GAATAG	2	12	1950403	1950414	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020832	AACATG	2	12	1951037	1951048	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_020832	AAGAGA	2	12	1971363	1971374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020832	ATCATT	2	12	2002487	2002498	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_020832	CTAATA	2	12	2023444	2023455	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_020832	TCAAAT	2	12	2023963	2023974	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_020832	CTTATC	2	12	2098649	2098660	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_020832	TTATGT	2	12	2123779	2123790	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020832	TTATTT	2	12	2125761	2125772	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020832	ATCTTC	2	12	2250324	2250335	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020832	TTTCGA	2	12	2261082	2261093	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_020832	ATAAAA	2	12	2308970	2308981	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020832	CTTTTC	2	12	2341719	2341730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020832	TTCTAA	2	12	2414900	2414911	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_020832	TGACTT	2	12	2441000	2441011	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_020832	ACAGAC	2	12	2467894	2467905	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_020832	AGTGAA	2	12	2491018	2491029	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020832	TTTTAT	2	12	2498095	2498106	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020832	GAATAT	2	12	2555817	2555828	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020832	GATTTT	2	12	2589328	2589339	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020832	GTTCAC	2	12	2592591	2592602	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_020832	CAAAAA	2	12	2632479	2632490	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_020832	GCCGGA	2	12	2640061	2640072	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_020832	CCCTCT	2	12	2682868	2682879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_020832	CTCTTT	2	12	2730590	2730601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020832	TTTAAG	2	12	2757377	2757388	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020832	TATTCA	2	12	2758025	2758036	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_020832	TGATTT	2	12	2785549	2785560	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020832	CTTATC	2	12	2820130	2820141	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_020832	CATTAT	2	12	2829573	2829584	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_020832	TAAAAA	2	12	2836499	2836510	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020832	AAAAGA	2	12	2863291	2863302	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020832	CTTATA	2	12	2946671	2946682	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_020832	AAAAAG	2	12	2998593	2998604	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020832	TGCTTT	2	12	3048586	3048597	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_020832	TGCAAA	2	12	3049185	3049196	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_020832	ATTATC	2	12	3067748	3067759	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_020832	CGCTGA	2	12	3088175	3088186	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_020832	AAAACG	2	12	3093526	3093537	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_020832	GCCTCC	2	12	3102717	3102728	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_020832	GAAAAA	2	12	3136432	3136443	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020832	CAAAAA	2	12	3276111	3276122	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_020832	GAAGTT	2	12	3277571	3277582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020832	CTCAGT	2	12	3294597	3294608	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_020832	TTTCAT	2	12	3328607	3328618	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_020832	AAACAT	2	12	3350588	3350599	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_020832	CTTTTT	2	12	3356505	3356516	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_020832	AGAACA	2	12	3381866	3381877	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_020832	CAGTAC	2	12	3399721	3399732	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_020832	AAAAAC	2	12	3415089	3415100	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_020832	GTATAT	2	12	3415848	3415859	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020832	GAGATA	2	12	3419064	3419075	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020832	GTATAC	2	12	3504083	3504094	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_020832	TTCTTT	2	12	3539934	3539945	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_020832	TGAGGA	2	12	3589980	3589991	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020832	TCAAAA	2	12	3604037	3604048	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_020832	GCCAGC	2	12	3742463	3742474	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
131	NC_020832	AGTGAT	2	12	3787706	3787717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020832	TGCACC	2	12	3837358	3837369	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
133	NC_020832	TGATAA	2	12	3876814	3876825	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020832	TCGCTC	2	12	3912893	3912904	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020832	TTGCCC	2	12	3921958	3921969	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
136	NC_020832	AGAAAT	2	12	4019335	4019346	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.