MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus subtilis subsp. subtilis str. BAB-1

Total Repeats: 474

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020832	TCGTG	2	10	10888	10897	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_020832	GAAAA	2	10	30114	30123	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020832	TCGTG	2	10	31363	31372	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_020832	ATAGG	2	10	48490	48499	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020832	AAAGT	2	10	78979	78988	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020832	TCGTG	2	10	91541	91550	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_020832	TCGTG	2	10	96701	96710	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_020832	TATAA	2	10	100698	100707	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020832	ACATG	2	10	110435	110444	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_020832	TGACA	2	10	119228	119237	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_020832	TTACG	2	10	119349	119358	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_020832	TTGTG	2	10	153189	153198	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020832	TTGGG	2	10	154134	154143	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020832	TCGTG	2	10	161452	161461	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_020832	TCGTG	2	10	166611	166620	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_020832	TCGTG	2	10	171770	171779	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_020832	CAATA	2	10	176045	176054	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_020832	TTTTC	2	10	176086	176095	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_020832	TAAAA	2	10	176107	176116	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020832	CCCCT	2	10	190261	190270	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
21	NC_020832	TGCTT	2	10	193141	193150	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_020832	ATAAA	2	10	193160	193169	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020832	ACAAG	2	10	198967	198976	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_020832	CTTGT	2	10	199064	199073	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_020832	TTTCA	2	10	209087	209096	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_020832	AAAGT	2	10	222733	222742	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020832	TTATT	2	10	245727	245736	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020832	AAAGG	2	10	249821	249830	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020832	TTGCT	2	10	267804	267813	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_020832	AGCTG	2	10	268216	268225	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_020832	ATTTG	2	10	273069	273078	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020832	AATTC	2	10	311725	311734	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_020832	GCGCA	2	10	331550	331559	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_020832	GAAAC	2	10	356869	356878	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_020832	AGCTG	2	10	361252	361261	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_020832	GCTGA	2	10	369774	369783	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_020832	ACCGG	2	10	370570	370579	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_020832	ATTTG	2	10	371525	371534	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020832	ATTTG	2	10	372323	372332	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020832	GCATT	2	10	374977	374986	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_020832	AATAC	2	10	375499	375508	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_020832	TCAAA	2	10	382648	382657	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_020832	GACGA	2	10	383159	383168	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_020832	TTGCA	2	10	386151	386160	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_020832	TAAAA	2	10	389572	389581	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020832	TGAAA	2	10	403618	403627	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020832	GACAT	2	10	437227	437236	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_020832	TCACC	2	10	447030	447039	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
49	NC_020832	CAATT	2	10	454978	454987	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_020832	AAAGA	2	10	457110	457119	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020832	ATTTT	2	10	477114	477123	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020832	GGAAG	2	10	484636	484645	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020832	TGTTT	2	10	485533	485542	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020832	ATAAA	2	10	499264	499273	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020832	GGCAA	2	10	520105	520114	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_020832	TACGA	2	10	521005	521014	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_020832	TTATT	2	10	521289	521298	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020832	CAGTA	2	10	525473	525482	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_020832	AAAGA	2	10	526026	526035	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020832	TATAG	2	10	526232	526241	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020832	TATGT	2	10	530893	530902	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020832	AAGGA	2	10	531451	531460	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020832	AATAA	2	10	531605	531614	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020832	ACAAA	2	10	531893	531902	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_020832	AATTA	2	10	532352	532361	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020832	TTTAC	2	10	532514	532523	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_020832	CTTTT	2	10	537304	537313	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_020832	TTATG	2	10	544008	544017	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020832	ATAAA	2	10	544111	544120	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020832	TATCA	2	10	550393	550402	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_020832	TTTCG	2	10	555510	555519	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_020832	CTCTT	2	10	558587	558596	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_020832	TTTTA	2	10	558627	558636	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020832	CAATT	2	10	577802	577811	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_020832	GCAAA	2	10	580322	580331	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_020832	GTACA	2	10	584239	584248	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_020832	GAAGG	2	10	597542	597551	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020832	AAACA	2	10	618846	618855	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_020832	AAACG	2	10	619740	619749	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_020832	CGCTC	2	10	628057	628066	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
81	NC_020832	ATTTT	2	10	635767	635776	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020832	TATCA	2	10	644501	644510	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_020832	GAAAT	2	10	647364	647373	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020832	TGACT	2	10	666316	666325	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_020832	AGGAA	2	10	691819	691828	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020832	CAAAA	2	10	698621	698630	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_020832	GTTTA	2	10	709100	709109	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020832	TGGTA	2	10	709466	709475	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020832	TGAGA	2	10	715945	715954	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020832	GATAA	2	10	719871	719880	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020832	AAATG	2	10	721262	721271	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020832	AACCA	2	10	724020	724029	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_020832	TAAAA	2	10	733344	733353	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020832	AGAAA	2	10	756043	756052	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020832	TTTGA	2	10	759322	759331	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020832	AGGTC	2	10	781942	781951	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_020832	ATGAT	2	10	796604	796613	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020832	TGTCT	2	10	810342	810351	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_020832	ATCTT	2	10	841832	841841	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_020832	GATTT	2	10	842132	842141	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020832	AATTC	2	10	852070	852079	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_020832	ACGGG	2	10	854681	854690	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
103	NC_020832	AGTAA	2	10	858571	858580	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020832	AAACA	2	10	892967	892976	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_020832	TCGTG	2	10	912013	912022	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_020832	AAGTT	2	10	917478	917487	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020832	TTTTA	2	10	917532	917541	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020832	CATCT	2	10	918893	918902	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_020832	GTATA	2	10	930174	930183	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020832	GTTTC	2	10	930422	930431	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_020832	GGGTG	2	10	932429	932438	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020832	ATCAT	2	10	960342	960351	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_020832	TTAAA	2	10	963260	963269	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020832	AATTG	2	10	963586	963595	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020832	ATATT	2	10	985858	985867	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020832	AAATA	2	10	988154	988163	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020832	GAAAG	2	10	992600	992609	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020832	AAAGA	2	10	1000083	1000092	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020832	AGTGG	2	10	1019524	1019533	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020832	GGAAA	2	10	1021187	1021196	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020832	TTCCT	2	10	1026131	1026140	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_020832	AAATT	2	10	1036093	1036102	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020832	ATAAA	2	10	1036719	1036728	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020832	ATTAC	2	10	1036794	1036803	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_020832	AATAA	2	10	1038582	1038591	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020832	AAAAT	2	10	1041319	1041328	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020832	AATAA	2	10	1048025	1048034	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020832	ATTGA	2	10	1054496	1054505	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020832	AAGCG	2	10	1067363	1067372	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_020832	TAGAA	2	10	1067897	1067906	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020832	TTTAA	2	10	1077356	1077365	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020832	CATAA	2	10	1080464	1080473	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_020832	TTTAT	2	10	1089907	1089916	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020832	TTTCA	2	10	1095607	1095616	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_020832	ATTTT	2	10	1115860	1115869	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020832	TTTTC	2	10	1135731	1135740	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_020832	ATTCT	2	10	1169002	1169011	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_020832	CATAC	2	10	1169021	1169030	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
139	NC_020832	TTTCT	2	10	1169173	1169182	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_020832	ATATC	2	10	1181209	1181218	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_020832	CTTTT	2	10	1183458	1183467	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_020832	GAAGG	2	10	1193129	1193138	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020832	AAAGG	2	10	1195173	1195182	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020832	CACAA	2	10	1195272	1195281	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_020832	TCATA	2	10	1199164	1199173	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_020832	AGTGT	2	10	1210894	1210903	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020832	TATGA	2	10	1211786	1211795	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020832	AAGGA	2	10	1216659	1216668	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020832	CCTTG	2	10	1217358	1217367	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
150	NC_020832	TATCA	2	10	1220106	1220115	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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155	NC_020832	ATAAA	2	10	1231652	1231661	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_020832	TATTG	2	10	1232670	1232679	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_020832	AGAGG	2	10	1257340	1257349	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_020832	CATTT	2	10	1263564	1263573	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
165	NC_020832	AATAT	2	10	1266543	1266552	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_020832	GAGCG	2	10	1341626	1341635	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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182	NC_020832	AGATC	2	10	1388511	1388520	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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184	NC_020832	GAAAC	2	10	1407533	1407542	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
185	NC_020832	AAAAT	2	10	1411172	1411181	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_020832	TAAGA	2	10	1476868	1476877	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
190	NC_020832	AACGA	2	10	1485455	1485464	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
191	NC_020832	TAATA	2	10	1492704	1492713	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_020832	ATTAT	2	10	1494486	1494495	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_020832	TAAAA	2	10	1496048	1496057	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_020832	TTATT	2	10	1517916	1517925	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_020832	AAGAG	2	10	1519014	1519023	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
196	NC_020832	CGTCT	2	10	1527532	1527541	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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272	NC_020832	TTGTT	2	10	2118314	2118323	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_020832	TAAAA	2	10	2222947	2222956	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_020832	TTTTA	2	10	2226866	2226875	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_020832	TTACA	2	10	2232615	2232624	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
282	NC_020832	ATTTC	2	10	2244031	2244040	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
283	NC_020832	AAAAC	2	10	2249053	2249062	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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285	NC_020832	CTAAC	2	10	2252000	2252009	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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423	NC_020832	TCCCG	2	10	3516220	3516229	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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462	NC_020832	TGTAT	2	10	3910569	3910578	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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464	NC_020832	ATCGG	2	10	3926024	3926033	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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471	NC_020832	ATTAT	2	10	3992190	3992199	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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473	NC_020832	ACATC	2	10	4021535	4021544	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
474	NC_020832	ATACC	2	10	4021841	4021850	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.