MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bdellovibrio exovorus JSS

Total Repeats: 196

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020813	TAAAA	2	10	23979	23988	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020813	AAATT	2	10	25852	25861	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020813	ACAGA	2	10	37084	37093	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_020813	CTTTT	2	10	43424	43433	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_020813	ATCTA	2	10	45064	45073	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_020813	TCTTA	2	10	47968	47977	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_020813	CTTGG	2	10	59736	59745	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_020813	TCTTT	2	10	66173	66182	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_020813	CAACT	2	10	68255	68264	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_020813	CTCGA	2	10	73043	73052	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_020813	TGTGA	2	10	73123	73132	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020813	GTCTT	2	10	75290	75299	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_020813	TACAT	2	10	96806	96815	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_020813	TAAAG	2	10	96822	96831	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020813	AATAT	2	10	96852	96861	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020813	TCAAA	2	10	107751	107760	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_020813	TTCCG	2	10	107791	107800	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_020813	AATTT	2	10	118365	118374	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020813	CTGAA	2	10	128982	128991	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_020813	AAAGA	2	10	130160	130169	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020813	TTAAG	2	10	130230	130239	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020813	ATTTT	2	10	139759	139768	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020813	ACAGT	2	10	139852	139861	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_020813	AAGCA	2	10	175403	175412	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_020813	TTTTA	2	10	197480	197489	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020813	GATCT	2	10	208838	208847	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_020813	ATTTG	2	10	214416	214425	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020813	AAGCC	2	10	232262	232271	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_020813	GAAAT	2	10	234028	234037	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020813	TAAAA	2	10	255510	255519	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020813	TACAA	2	10	257048	257057	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_020813	ATACT	2	10	263868	263877	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_020813	TATAT	2	10	263882	263891	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020813	CTTGT	2	10	299720	299729	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_020813	GCAGA	2	10	301607	301616	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_020813	TTATC	2	10	323273	323282	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_020813	GCCGA	2	10	326247	326256	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_020813	AGAAA	2	10	341598	341607	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020813	GACTA	2	10	367870	367879	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_020813	CAGTC	2	10	369546	369555	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_020813	AGTAT	2	10	387770	387779	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020813	TTTTA	2	10	395948	395957	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020813	CTTCA	2	10	400795	400804	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_020813	AAAAC	2	10	401879	401888	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_020813	ATTAT	2	10	401903	401912	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020813	GTAAA	2	10	402755	402764	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020813	GCACG	2	10	403598	403607	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_020813	CGATA	2	10	409858	409867	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_020813	TATAT	2	10	441579	441588	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020813	GAACT	2	10	449539	449548	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_020813	CTTAA	2	10	476353	476362	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_020813	TCCTG	2	10	484711	484720	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_020813	TTAAC	2	10	498172	498181	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_020813	AAGGG	2	10	503877	503886	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020813	AAGCA	2	10	529584	529593	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_020813	TTAAG	2	10	537248	537257	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020813	GTCGA	2	10	553273	553282	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_020813	TAATT	2	10	553306	553315	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020813	GACAT	2	10	572827	572836	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_020813	ACTGA	2	10	618360	618369	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_020813	GCAGA	2	10	618444	618453	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_020813	AAGTG	2	10	618902	618911	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020813	TAAAT	2	10	674761	674770	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020813	GCTTT	2	10	688071	688080	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_020813	TTTAG	2	10	688683	688692	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020813	TCGTG	2	10	752745	752754	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_020813	CTAGT	2	10	754623	754632	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_020813	AGATT	2	10	756286	756295	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020813	AAGCT	2	10	764871	764880	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_020813	AGCTG	2	10	768974	768983	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_020813	TAATG	2	10	774820	774829	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020813	ATAAA	2	10	786125	786134	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020813	CTTGA	2	10	804048	804057	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_020813	AAAGG	2	10	855466	855475	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020813	TCTTG	2	10	902975	902984	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_020813	TGTTT	2	10	907937	907946	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020813	ACGCA	2	10	924367	924376	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_020813	ATTTA	2	10	956255	956264	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020813	TTGGT	2	10	956868	956877	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020813	TAAAA	2	10	958720	958729	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020813	ATTCT	2	10	976284	976293	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_020813	ATTGA	2	10	981341	981350	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020813	ATTTT	2	10	988459	988468	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020813	TTATC	2	10	991181	991190	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_020813	TTCGA	2	10	1026914	1026923	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_020813	TTAGT	2	10	1028380	1028389	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020813	TTTGA	2	10	1043338	1043347	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020813	TTAAT	2	10	1043550	1043559	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020813	GTCTG	2	10	1094696	1094705	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_020813	AAAAT	2	10	1120014	1120023	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020813	AGAAA	2	10	1120164	1120173	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020813	TTGAA	2	10	1143262	1143271	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020813	ATTAA	2	10	1145962	1145971	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020813	TTTCT	2	10	1146396	1146405	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_020813	TATAA	2	10	1161130	1161139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020813	TGAAT	2	10	1184064	1184073	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020813	GATCT	2	10	1184085	1184094	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_020813	CTTCA	2	10	1184409	1184418	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_020813	GGCCA	2	10	1185336	1185345	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_020813	TTTGA	2	10	1190522	1190531	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020813	ATCCT	2	10	1195625	1195634	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_020813	TTCTT	2	10	1204992	1205001	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_020813	TTTTA	2	10	1210445	1210454	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020813	AAAGC	2	10	1219858	1219867	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_020813	AAAGG	2	10	1219924	1219933	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020813	TTCAA	2	10	1239663	1239672	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_020813	GTTTA	2	10	1257367	1257376	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020813	AAGAA	2	10	1271831	1271840	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020813	GAAGT	2	10	1281640	1281649	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020813	ATTTT	2	10	1288483	1288492	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020813	CTTTA	2	10	1302380	1302389	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_020813	TTATT	2	10	1363448	1363457	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020813	TAGTT	2	10	1367803	1367812	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020813	ACCCA	2	10	1380673	1380682	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
115	NC_020813	AACTT	2	10	1479441	1479450	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_020813	CTTTT	2	10	1484479	1484488	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_020813	ACAAA	2	10	1496322	1496331	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_020813	ATGAA	2	10	1511043	1511052	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020813	GAAAA	2	10	1524510	1524519	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020813	TTAAA	2	10	1525698	1525707	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020813	TTCTT	2	10	1581078	1581087	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_020813	TTGCC	2	10	1588678	1588687	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_020813	CTGAA	2	10	1602358	1602367	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_020813	TGCTA	2	10	1603766	1603775	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_020813	ATCAG	2	10	1621937	1621946	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_020813	GTGAA	2	10	1628780	1628789	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020813	GTGAA	2	10	1628809	1628818	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020813	AAGCC	2	10	1634008	1634017	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_020813	ATTAT	2	10	1658014	1658023	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020813	TATAA	2	10	1658729	1658738	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020813	TAAGC	2	10	1676955	1676964	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_020813	AATTT	2	10	1741730	1741739	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020813	ATTTA	2	10	1760883	1760892	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020813	TTACT	2	10	1773080	1773089	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_020813	CTTCA	2	10	1786530	1786539	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_020813	TATGC	2	10	1795619	1795628	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_020813	AAAAT	2	10	1802916	1802925	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020813	GTATT	2	10	1802962	1802971	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020813	TAACT	2	10	1811872	1811881	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_020813	TGTTA	2	10	1838045	1838054	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020813	ATAAG	2	10	1838327	1838336	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020813	GCATC	2	10	1843907	1843916	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_020813	ATAAC	2	10	1900637	1900646	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_020813	CTTTT	2	10	1918772	1918781	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_020813	ATGAA	2	10	1959222	1959231	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020813	CTTTT	2	10	1982640	1982649	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_020813	GTTTT	2	10	1986531	1986540	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020813	TCAAT	2	10	1992020	1992029	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_020813	TAATT	2	10	2005103	2005112	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_020813	TAAAA	2	10	2110709	2110718	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_020813	AAAGA	2	10	2120032	2120041	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_020813	CTCTG	2	10	2177938	2177947	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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162	NC_020813	CTTCA	2	10	2300281	2300290	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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166	NC_020813	TCTAT	2	10	2336723	2336732	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
167	NC_020813	TTCAC	2	10	2362266	2362275	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
168	NC_020813	TCTAA	2	10	2417227	2417236	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
169	NC_020813	AAAAG	2	10	2430247	2430256	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_020813	ATATA	2	10	2478707	2478716	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_020813	TATTT	2	10	2509911	2509920	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_020813	ATCAC	2	10	2518318	2518327	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
185	NC_020813	ACCAG	2	10	2524643	2524652	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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188	NC_020813	GAATT	2	10	2541126	2541135	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
189	NC_020813	ATCAA	2	10	2554865	2554874	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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191	NC_020813	CTTTA	2	10	2557178	2557187	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
192	NC_020813	CTTTA	2	10	2557193	2557202	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
193	NC_020813	ATTGT	2	10	2574645	2574654	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
194	NC_020813	CTTTG	2	10	2574818	2574827	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
195	NC_020813	TGCTG	2	10	2574955	2574964	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
196	NC_020813	TAATT	2	10	2589427	2589436	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.