MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium thermophilum RBL67

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020546	GTTCGC	2	12	12445	12456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020546	ACAATC	2	12	17030	17041	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020546	TGATTT	2	12	33364	33375	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020546	TCCTGC	2	12	40562	40573	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020546	CCGGTG	2	12	50619	50630	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020546	CGGTGT	2	12	51285	51296	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_020546	GTGACG	2	12	57133	57144	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_020546	GTGGGC	2	12	62921	62932	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_020546	GGTGCT	2	12	63233	63244	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_020546	ACGTGC	2	12	68966	68977	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020546	TGCGGA	2	12	81548	81559	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020546	GCGTCG	2	12	89303	89314	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020546	ATGTGG	2	12	90459	90470	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020546	AAGAGA	2	12	93528	93539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020546	GATGCC	2	12	122292	122303	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020546	TCCGCA	2	12	129169	129180	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020546	CTGCCG	2	12	131455	131466	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020546	TATGCC	2	12	134465	134476	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020546	TCGTGT	2	12	134864	134875	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_020546	TCGCGG	2	12	136923	136934	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020546	ACGCCG	2	12	141329	141340	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020546	GATTCC	2	12	155739	155750	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020546	TTAACC	2	12	165316	165327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020546	GTGGTT	2	12	181825	181836	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020546	CGTACG	2	12	189770	189781	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020546	TATCGG	2	12	192902	192913	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_020546	CACGCG	2	12	209519	209530	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_020546	CCTGTC	2	12	223932	223943	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_020546	GGCGCT	2	12	228566	228577	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020546	GTGTGC	2	12	229128	229139	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_020546	TGCAGA	2	12	250629	250640	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_020546	GCCAGT	2	12	258371	258382	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020546	GAACGA	2	12	267287	267298	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_020546	GGCGCT	2	12	275406	275417	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020546	GTTGCG	2	12	291435	291446	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_020546	GCAGAA	2	12	314057	314068	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_020546	CTGCCT	2	12	322826	322837	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_020546	TCGCAG	2	12	326638	326649	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020546	CGGTGC	2	12	329078	329089	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020546	GATGCC	2	12	329511	329522	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020546	CCGTTA	2	12	375728	375739	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020546	CCGGTT	2	12	378294	378305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020546	GAAACG	2	12	392382	392393	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_020546	ACCCTG	2	12	408501	408512	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_020546	GTAATT	2	12	410829	410840	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020546	CGTCGG	2	12	439380	439391	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020546	TGGATG	2	12	453962	453973	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020546	TGGATG	2	12	483991	484002	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020546	GCTGGC	2	12	500956	500967	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_020546	TTGCGT	2	12	514529	514540	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_020546	GCAGAA	2	12	521401	521412	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_020546	AGGGAA	2	12	527104	527115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020546	TCGGCA	2	12	527262	527273	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020546	ACAACC	2	12	553523	553534	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020546	TTCTCC	2	12	605329	605340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_020546	ATGCGG	2	12	613039	613050	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_020546	CGGCAG	2	12	613967	613978	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_020546	TTCTGT	2	12	683832	683843	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_020546	TTCTGC	2	12	713377	713388	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_020546	TTCTGC	2	12	713480	713491	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020546	AAAGGA	2	12	726387	726398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020546	GGCAGT	2	12	746891	746902	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_020546	CATGCC	2	12	801472	801483	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020546	CTTGCG	2	12	843164	843175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020546	GACGGA	2	12	850639	850650	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_020546	GACGAT	2	12	852085	852096	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_020546	GGAACG	2	12	860517	860528	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_020546	GTTTCT	2	12	868217	868228	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_020546	GCAGAA	2	12	934886	934897	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_020546	GCGCGG	2	12	984394	984405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020546	ATATCG	2	12	1035766	1035777	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_020546	CGGGAC	2	12	1036263	1036274	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020546	CGGGGC	2	12	1036566	1036577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020546	TCGGTG	2	12	1097011	1097022	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_020546	GCTCCG	2	12	1111538	1111549	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_020546	TGAGAT	2	12	1117357	1117368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020546	ACTTTG	2	12	1121622	1121633	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_020546	AGGGAA	2	12	1150212	1150223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020546	CGGGCA	2	12	1151148	1151159	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_020546	GTTGAG	2	12	1161142	1161153	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020546	CCCACA	2	12	1165561	1165572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_020546	CTGTGG	2	12	1185614	1185625	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_020546	TCGTCA	2	12	1274810	1274821	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020546	AGCCGA	2	12	1281919	1281930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020546	CCATCT	2	12	1327589	1327600	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_020546	GTTCCG	2	12	1334853	1334864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020546	ACCGTC	2	12	1340644	1340655	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
88	NC_020546	GCCGCT	2	12	1343524	1343535	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_020546	TCATGG	2	12	1362964	1362975	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_020546	GGTGTG	2	12	1382322	1382333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020546	GCTTGC	2	12	1411528	1411539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020546	ACGTCC	2	12	1474234	1474245	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_020546	GGGGTC	2	12	1487252	1487263	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_020546	CAGCAC	2	12	1506855	1506866	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_020546	CTCGTT	2	12	1526998	1527009	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_020546	CCAACA	2	12	1533439	1533450	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_020546	CCAGAA	2	12	1533451	1533462	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020546	ACAGGC	2	12	1570360	1570371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020546	GAACCG	2	12	1607262	1607273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_020546	TTGGGC	2	12	1649325	1649336	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_020546	CGAAAC	2	12	1682344	1682355	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_020546	GCCGGC	2	12	1711304	1711315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020546	CCCACA	2	12	1727282	1727293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_020546	GTTGTG	2	12	1765511	1765522	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020546	TTCCGA	2	12	1791231	1791242	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_020546	TGTTGC	2	12	1822709	1822720	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_020546	ACCCGA	2	12	1840066	1840077	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
108	NC_020546	ACTGAC	2	12	1875708	1875719	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_020546	GCAGAA	2	12	1890196	1890207	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_020546	GCGTGG	2	12	1905152	1905163	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_020546	TTGTTC	2	12	1917686	1917697	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_020546	AAGCCC	2	12	1922472	1922483	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
113	NC_020546	AACCGC	2	12	1925766	1925777	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020546	GCGTCG	2	12	1937532	1937543	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_020546	GCCGAA	2	12	1947422	1947433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_020546	TGTCTG	2	12	1968107	1968118	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_020546	GAACAG	2	12	1975897	1975908	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_020546	ATCTGA	2	12	1978264	1978275	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_020546	GTCGGA	2	12	1985705	1985716	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_020546	CGCGGG	2	12	2015290	2015301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_020546	TGACCT	2	12	2023346	2023357	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_020546	TACACC	2	12	2046463	2046474	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_020546	CGAACC	2	12	2049102	2049113	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
124	NC_020546	CAGCAA	2	12	2062629	2062640	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_020546	ATCGCG	2	12	2069490	2069501	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_020546	GTCTGT	2	12	2083296	2083307	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_020546	AATATC	2	12	2089728	2089739	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_020546	CCTGAG	2	12	2100143	2100154	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_020546	CGAAGT	2	12	2115130	2115141	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_020546	GGCTCA	2	12	2128839	2128850	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_020546	TGCGCA	2	12	2151032	2151043	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_020546	CTTCTG	2	12	2182970	2182981	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_020546	GACGCT	2	12	2188724	2188735	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_020546	CATCCG	2	12	2210034	2210045	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020546	AGCAAC	2	12	2238939	2238950	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_020546	GCAACC	2	12	2244055	2244066	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
137	NC_020546	GCCCAC	2	12	2250452	2250463	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_020546	TCGGGG	2	12	2259699	2259710	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_020546	TATCAG	2	12	2286544	2286555	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.