MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium breve UCC2003

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020517	GTCGCC	2	12	21694	21705	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020517	TTCATG	2	12	25873	25884	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_020517	GTCTCC	2	12	41121	41132	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020517	ACGCCG	2	12	41432	41443	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020517	ATGACA	2	12	45271	45282	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_020517	TGGCAA	2	12	61348	61359	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_020517	GATTGG	2	12	71201	71212	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020517	CCTGCC	2	12	82296	82307	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_020517	CTGGTT	2	12	82331	82342	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_020517	CGTTCG	2	12	111255	111266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020517	ATGCAT	2	12	164174	164185	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020517	AGCAAA	2	12	177048	177059	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_020517	ATATGG	2	12	194523	194534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020517	TTGCGT	2	12	211261	211272	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_020517	ACGATT	2	12	224810	224821	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_020517	GTCGAT	2	12	225604	225615	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_020517	GGGACC	2	12	239073	239084	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020517	GGCTGC	2	12	259155	259166	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020517	GATTGG	2	12	268459	268470	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020517	ACGGTG	2	12	279345	279356	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_020517	TTCCCG	2	12	283205	283216	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020517	AAGGCG	2	12	300835	300846	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_020517	CCAAAA	2	12	326346	326357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020517	GATATG	2	12	339178	339189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020517	GTTTCG	2	12	352513	352524	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_020517	CTACGA	2	12	354029	354040	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020517	TGCCGC	2	12	354802	354813	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_020517	TGCATC	2	12	357498	357509	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020517	CGATAC	2	12	365121	365132	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020517	GGGCTT	2	12	372885	372896	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_020517	CGGCCT	2	12	394449	394460	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_020517	GATCAC	2	12	397058	397069	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020517	TAATCC	2	12	407300	407311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020517	GTCGAT	2	12	416090	416101	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_020517	GCGTTC	2	12	427883	427894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020517	GCGGAT	2	12	433720	433731	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_020517	TCGGCA	2	12	434961	434972	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020517	GACGGT	2	12	439296	439307	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_020517	GGCGAG	2	12	455371	455382	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_020517	CTGACG	2	12	507760	507771	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020517	CCCAGC	2	12	554552	554563	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_020517	TCTGCT	2	12	575952	575963	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020517	AGAGGC	2	12	576086	576097	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_020517	GGAACG	2	12	576462	576473	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_020517	TGACGA	2	12	576529	576540	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_020517	CTGGAG	2	12	576566	576577	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_020517	GGCGTG	2	12	607639	607650	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_020517	GGAACA	2	12	607712	607723	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_020517	TGATGG	2	12	617436	617447	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020517	TCAATT	2	12	625008	625019	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_020517	ATGCCG	2	12	628440	628451	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_020517	CCCCTA	2	12	736454	736465	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_020517	TGTTCG	2	12	751161	751172	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_020517	CATGAA	2	12	761140	761151	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_020517	TATTGC	2	12	778822	778833	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_020517	GGATAT	2	12	803602	803613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020517	TTTGAA	2	12	828556	828567	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020517	GCGATG	2	12	853522	853533	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_020517	ATAGGC	2	12	869051	869062	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_020517	CGGGAA	2	12	903441	903452	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_020517	CGCCCG	2	12	906494	906505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_020517	ATGCCG	2	12	907351	907362	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020517	AGGAGA	2	12	950931	950942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020517	GTACAA	2	12	960065	960076	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_020517	ATCTGC	2	12	995338	995349	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020517	CTCGTT	2	12	1044666	1044677	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020517	GAGGAT	2	12	1048366	1048377	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020517	AGTTCA	2	12	1080830	1080841	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_020517	TGGGCG	2	12	1106103	1106114	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_020517	TACCTC	2	12	1119969	1119980	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_020517	TTCTCT	2	12	1133525	1133536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020517	AGCGGG	2	12	1133649	1133660	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_020517	CCGTTC	2	12	1144714	1144725	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020517	TTTTGA	2	12	1183082	1183093	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020517	CCTATT	2	12	1197156	1197167	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020517	ACGGGG	2	12	1216682	1216693	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_020517	AAGTAG	2	12	1239708	1239719	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020517	CAATGA	2	12	1265634	1265645	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_020517	CTTTTC	2	12	1295128	1295139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_020517	AAGGCA	2	12	1342048	1342059	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_020517	CATGAT	2	12	1343077	1343088	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_020517	TTCGCC	2	12	1360306	1360317	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020517	AGGACG	2	12	1379925	1379936	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_020517	GGTACG	2	12	1493144	1493155	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_020517	TTGATG	2	12	1500499	1500510	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020517	GTGGCT	2	12	1562481	1562492	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_020517	GGAAAT	2	12	1583627	1583638	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020517	GGCGAT	2	12	1609252	1609263	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_020517	CCCGGA	2	12	1611661	1611672	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_020517	GCCTGA	2	12	1635608	1635619	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020517	GGTCTG	2	12	1663518	1663529	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_020517	CCGAAG	2	12	1677574	1677585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020517	AACAAA	2	12	1744371	1744382	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_020517	GTAGCC	2	12	1757630	1757641	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_020517	ACCCAC	2	12	1772277	1772288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_020517	ATATCA	2	12	1772650	1772661	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_020517	GGCGAC	2	12	1790430	1790441	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020517	CACGAC	2	12	1790766	1790777	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020517	CAAGCA	2	12	1796310	1796321	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_020517	AAAAGC	2	12	1831590	1831601	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_020517	CATCGT	2	12	1833954	1833965	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_020517	TTACCG	2	12	1867836	1867847	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_020517	GTTAAC	2	12	1877754	1877765	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_020517	CGAACG	2	12	1877911	1877922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_020517	TCCGTA	2	12	1890911	1890922	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_020517	CGTTCG	2	12	1916081	1916092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_020517	CGACAC	2	12	1922474	1922485	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
108	NC_020517	CCCAGG	2	12	1927545	1927556	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_020517	GCATCT	2	12	1993680	1993691	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_020517	GCCCCA	2	12	2042511	2042522	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_020517	CACGGC	2	12	2049570	2049581	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_020517	CATTGC	2	12	2110055	2110066	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_020517	TACGAC	2	12	2110067	2110078	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_020517	CACTCC	2	12	2132724	2132735	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_020517	CGGACA	2	12	2185319	2185330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_020517	AAGCCA	2	12	2185479	2185490	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_020517	CTTCGG	2	12	2202690	2202701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_020517	CCGCAC	2	12	2276716	2276727	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_020517	CGGCAG	2	12	2277154	2277165	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_020517	GCTGTT	2	12	2277849	2277860	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_020517	ACAGTC	2	12	2279415	2279426	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_020517	ACCCAC	2	12	2292291	2292302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_020517	GATGAG	2	12	2292421	2292432	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020517	CCCACT	2	12	2299617	2299628	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_020517	CCCGGA	2	12	2316875	2316886	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
126	NC_020517	CCAGCG	2	12	2340627	2340638	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
127	NC_020517	CGTCAG	2	12	2398754	2398765	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.