MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium breve UCC2003

Total Repeats: 991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020517	TCCA	2	8	1876	1883	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020517	TTAC	2	8	1919	1926	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_020517	CATA	2	8	1930	1937	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020517	GCAA	2	8	1976	1983	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_020517	AACC	3	12	1987	1998	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_020517	GGAA	2	8	4986	4993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020517	TTCT	2	8	11679	11686	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_020517	ATGT	2	8	11747	11754	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020517	GAAT	2	8	11837	11844	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020517	TGCT	2	8	11878	11885	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020517	ACTG	2	8	12357	12364	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020517	CGGC	2	8	12370	12377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_020517	TTTA	2	8	12612	12619	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020517	TGTA	2	8	19261	19268	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020517	GCCT	2	8	21821	21828	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020517	CCGC	2	8	21921	21928	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_020517	CCAA	2	8	22259	22266	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020517	CCAG	2	8	22268	22275	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_020517	GACC	2	8	22284	22291	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_020517	GGCC	2	8	22333	22340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020517	TATG	2	8	23836	23843	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020517	TAGA	2	8	24477	24484	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020517	CGCC	2	8	24816	24823	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
24	NC_020517	ATCC	2	8	26183	26190	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_020517	GCCC	2	8	26191	26198	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_020517	AAGC	2	8	36757	36764	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020517	GCTG	2	8	37079	37086	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_020517	TGCG	2	8	37636	37643	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_020517	ACGG	2	8	38333	38340	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020517	CTGC	2	8	38387	38394	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_020517	GGGC	2	8	38605	38612	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020517	TCCT	2	8	40909	40916	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020517	TCGT	2	8	41490	41497	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_020517	CAGG	2	8	42653	42660	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_020517	GTTT	2	8	43685	43692	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020517	ACAG	2	8	43820	43827	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_020517	AGAC	2	8	43928	43935	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020517	GGCG	2	8	43996	44003	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
39	NC_020517	TTCC	2	8	45161	45168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_020517	TTCG	2	8	45755	45762	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_020517	TCGG	2	8	45924	45931	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_020517	AGGT	2	8	45975	45982	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020517	GTTC	2	8	46531	46538	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_020517	TCAA	2	8	48248	48255	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_020517	CGCA	2	8	49866	49873	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_020517	GCTG	2	8	52139	52146	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_020517	TGCA	2	8	54235	54242	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_020517	AACC	2	8	55083	55090	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_020517	TTTG	2	8	57261	57268	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020517	GCCG	2	8	61717	61724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_020517	TACA	2	8	61853	61860	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_020517	GCAC	2	8	61980	61987	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_020517	TTGG	2	8	62077	62084	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020517	TGCG	2	8	71015	71022	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_020517	TCAG	2	8	71067	71074	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_020517	GCGT	2	8	73547	73554	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_020517	AAGT	2	8	73557	73564	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020517	CCGT	2	8	76536	76543	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_020517	AGGT	2	8	84565	84572	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020517	TATG	2	8	86393	86400	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020517	GGAA	2	8	87297	87304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020517	CGCT	2	8	89848	89855	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_020517	GCTG	2	8	89890	89897	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_020517	CAAC	2	8	90003	90010	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020517	GTTG	2	8	90018	90025	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020517	TGGG	2	8	90376	90383	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020517	CGGG	2	8	103286	103293	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
68	NC_020517	GTTC	2	8	107390	107397	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_020517	CTGT	2	8	109586	109593	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_020517	TACG	2	8	115497	115504	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_020517	GGTG	2	8	119084	119091	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020517	ATCT	2	8	127228	127235	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_020517	CTGA	2	8	129793	129800	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_020517	ATAA	2	8	134443	134450	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020517	TTAT	2	8	134476	134483	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020517	AAGC	2	8	134543	134550	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_020517	ACGG	2	8	142747	142754	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_020517	GAAA	2	8	142769	142776	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020517	AATG	2	8	142936	142943	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020517	CCGC	2	8	146127	146134	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
81	NC_020517	AAAG	2	8	146235	146242	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020517	CGGC	2	8	149212	149219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020517	CTCA	2	8	151387	151394	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_020517	TTCG	2	8	151403	151410	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_020517	ACAG	2	8	151421	151428	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_020517	GTCC	2	8	151491	151498	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020517	ATAA	2	8	151728	151735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020517	TTTG	2	8	152903	152910	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020517	CGGA	2	8	152947	152954	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_020517	GGAA	2	8	155637	155644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020517	CATG	2	8	159403	159410	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_020517	ACGG	2	8	160584	160591	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_020517	ATTC	2	8	160696	160703	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_020517	TGCG	2	8	162569	162576	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_020517	TGCT	2	8	162669	162676	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_020517	GCTC	2	8	164492	164499	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_020517	CGAT	2	8	171211	171218	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_020517	TCCA	2	8	171358	171365	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020517	GCGG	2	8	178606	178613	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_020517	ACAA	3	12	178753	178764	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_020517	CTGT	2	8	181176	181183	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_020517	AACC	2	8	188793	188800	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020517	CTGA	2	8	191486	191493	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_020517	CTGA	2	8	192683	192690	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_020517	TGTT	2	8	193395	193402	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020517	ATTG	2	8	193786	193793	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020517	TGGC	2	8	194308	194315	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_020517	TTCG	2	8	194515	194522	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_020517	GCTC	2	8	197280	197287	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_020517	GGTC	2	8	201603	201610	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_020517	CTGA	2	8	203258	203265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_020517	AAAC	2	8	203928	203935	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_020517	TGAG	2	8	204082	204089	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020517	AGGT	2	8	204095	204102	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020517	TTGC	2	8	207596	207603	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_020517	AGGT	2	8	208094	208101	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020517	GCGG	2	8	211154	211161	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_020517	CAAG	2	8	212129	212136	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_020517	TCCT	2	8	215087	215094	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_020517	CTGC	2	8	215841	215848	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_020517	GACG	2	8	215943	215950	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_020517	CACG	2	8	218686	218693	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_020517	CGCC	2	8	218710	218717	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
124	NC_020517	CTGC	2	8	218821	218828	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_020517	CGCC	2	8	218925	218932	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
126	NC_020517	ACAA	2	8	218967	218974	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_020517	TGAA	2	8	219258	219265	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020517	TCGC	2	8	224797	224804	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020517	GTTT	2	8	225386	225393	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020517	GGAA	2	8	229930	229937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020517	AAGA	2	8	231573	231580	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020517	TGGA	2	8	231587	231594	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020517	CCAT	2	8	233290	233297	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_020517	GAAG	2	8	239099	239106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020517	GCCG	2	8	239301	239308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_020517	TTGC	2	8	239366	239373	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_020517	CCGC	2	8	243133	243140	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
138	NC_020517	ATGC	2	8	244833	244840	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_020517	GTCC	2	8	246319	246326	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_020517	GCCG	2	8	246539	246546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_020517	TCAG	2	8	248567	248574	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_020517	GCCG	2	8	251156	251163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_020517	GTCT	2	8	258996	259003	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_020517	ACTG	2	8	263286	263293	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_020517	GGGT	2	8	263295	263302	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020517	CTTC	2	8	270890	270897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_020517	GCGG	2	8	270959	270966	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
148	NC_020517	AATG	2	8	275018	275025	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020517	GCAT	2	8	276993	277000	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_020517	AATG	2	8	277098	277105	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020517	GGGT	2	8	277177	277184	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020517	GTCG	2	8	279309	279316	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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169	NC_020517	TCAG	2	8	330582	330589	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
170	NC_020517	TGAG	2	8	333695	333702	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_020517	ATGT	2	8	353979	353986	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_020517	GTGG	2	8	364102	364109	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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