MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium breve UCC2003

Total Repeats: 7489

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020517	ATC	2	6	107539	107544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_020517	C	6	6	107563	107568	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
503	NC_020517	GGT	2	6	107575	107580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_020517	AT	3	6	108732	108737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020517	GTGAA	2	10	108791	108800	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020517	TC	3	6	108896	108901	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
507	NC_020517	TTG	2	6	109432	109437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_020517	TC	3	6	109445	109450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
509	NC_020517	AGCTT	2	10	109455	109464	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
510	NC_020517	GAG	2	6	109512	109517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_020517	GA	3	6	109541	109546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
512	NC_020517	CTGT	2	8	109586	109593	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
513	NC_020517	CGG	2	6	109626	109631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_020517	AG	3	6	109784	109789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_020517	CCA	2	6	110788	110793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_020517	CAC	2	6	110808	110813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_020517	ATC	2	6	110844	110849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_020517	TAC	2	6	110879	110884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_020517	GCG	2	6	110947	110952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_020517	TGC	2	6	110994	110999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_020517	CCG	2	6	111002	111007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_020517	CGG	2	6	111234	111239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_020517	GTT	2	6	111249	111254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_020517	CGTTCG	2	12	111255	111266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_020517	TGA	2	6	111296	111301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_020517	TACG	2	8	115497	115504	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
527	NC_020517	CTT	2	6	115568	115573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_020517	GGA	2	6	115728	115733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_020517	GAG	2	6	115742	115747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020517	CGG	2	6	115931	115936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_020517	C	6	6	115949	115954	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
532	NC_020517	CAT	2	6	117842	117847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_020517	GCA	2	6	117849	117854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_020517	GGATG	2	10	117856	117865	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
535	NC_020517	CAT	2	6	118960	118965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_020517	CAT	2	6	118980	118985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_020517	ATG	2	6	118997	119002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_020517	TGA	2	6	119027	119032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_020517	GC	3	6	119072	119077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
540	NC_020517	GGTG	2	8	119084	119091	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
541	NC_020517	TGC	2	6	119116	119121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_020517	TGA	2	6	123425	123430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_020517	GTT	2	6	123469	123474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_020517	CAG	2	6	123535	123540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_020517	GCG	2	6	123577	123582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_020517	CTT	2	6	123691	123696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_020517	GCC	2	6	123746	123751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_020517	ACG	2	6	123837	123842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_020517	CGG	2	6	123918	123923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_020517	CA	3	6	124076	124081	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
551	NC_020517	AAT	2	6	125432	125437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_020517	G	6	6	125565	125570	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
553	NC_020517	TGG	2	6	125699	125704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_020517	T	6	6	125745	125750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_020517	GCT	2	6	125760	125765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_020517	AG	4	8	125796	125803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
557	NC_020517	GAA	2	6	127186	127191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_020517	ATCT	2	8	127228	127235	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
559	NC_020517	GAT	2	6	127409	127414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_020517	TAC	2	6	127466	127471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_020517	GGC	2	6	127491	127496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_020517	AGC	2	6	127548	127553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_020517	CTG	2	6	129597	129602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_020517	GCG	2	6	129648	129653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_020517	AGG	2	6	129772	129777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_020517	G	6	6	129776	129781	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
567	NC_020517	CTGA	2	8	129793	129800	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
568	NC_020517	AAT	2	6	129897	129902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_020517	CG	3	6	129950	129955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
570	NC_020517	GCC	2	6	129978	129983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_020517	TGC	2	6	130032	130037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_020517	TGG	2	6	132680	132685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_020517	CAC	2	6	132875	132880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_020517	CATCG	2	10	134389	134398	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
575	NC_020517	CAG	2	6	134409	134414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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577	NC_020517	TTAT	2	8	134476	134483	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_020517	AGC	2	6	134535	134540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_020517	AAGC	2	8	134543	134550	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
580	NC_020517	AGC	2	6	134605	134610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_020517	CCG	2	6	134679	134684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_020517	CGT	2	6	135838	135843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_020517	CGT	2	6	135936	135941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_020517	GGC	2	6	138053	138058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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587	NC_020517	ACG	2	6	139514	139519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_020517	CCG	2	6	139533	139538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_020517	GCA	2	6	141190	141195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_020517	GTT	2	6	141211	141216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_020517	AAC	2	6	141235	141240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_020517	ACGG	2	8	142747	142754	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
593	NC_020517	GAAA	2	8	142769	142776	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
594	NC_020517	GCC	2	6	142799	142804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_020517	GACCA	2	10	142835	142844	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
596	NC_020517	GCT	2	6	142849	142854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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598	NC_020517	GA	3	6	142925	142930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
599	NC_020517	AATG	2	8	142936	142943	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
600	NC_020517	TGA	2	6	142987	142992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_020517	GCG	2	6	144143	144148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_020517	TCA	2	6	144183	144188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_020517	TG	3	6	144253	144258	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
604	NC_020517	TG	3	6	144281	144286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_020517	TG	3	6	144288	144293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
606	NC_020517	GC	3	6	146077	146082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
607	NC_020517	AGT	2	6	146087	146092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_020517	CCGC	2	8	146127	146134	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
609	NC_020517	TGA	2	6	146225	146230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_020517	AAAG	2	8	146235	146242	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
611	NC_020517	AGC	2	6	146243	146248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_020517	GTC	2	6	147916	147921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_020517	C	6	6	149026	149031	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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615	NC_020517	GAG	2	6	149045	149050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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617	NC_020517	ACT	2	6	149146	149151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_020517	CGGC	2	8	149212	149219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
619	NC_020517	TGG	2	6	149240	149245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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621	NC_020517	T	6	6	149277	149282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_020517	GAG	2	6	149310	149315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_020517	TGG	2	6	149396	149401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_020517	TGG	2	6	149448	149453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
625	NC_020517	GAG	2	6	149466	149471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
626	NC_020517	TGG	2	6	149500	149505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
627	NC_020517	CGT	2	6	149511	149516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_020517	AGG	2	6	149676	149681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
629	NC_020517	ATT	2	6	149728	149733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_020517	ATG	2	6	149831	149836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_020517	T	7	7	149843	149849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_020517	AAC	2	6	149912	149917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_020517	AACAG	2	10	149921	149930	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
634	NC_020517	AC	3	6	149979	149984	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
635	NC_020517	CTCA	2	8	151387	151394	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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914	NC_020517	GAATC	2	10	231595	231604	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
915	NC_020517	CA	3	6	233206	233211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
916	NC_020517	GCT	2	6	233239	233244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
917	NC_020517	AGC	2	6	233250	233255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
918	NC_020517	CCAT	2	8	233290	233297	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
919	NC_020517	GAG	2	6	233300	233305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
920	NC_020517	CGA	2	6	237126	237131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
921	NC_020517	CCG	2	6	237149	237154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
922	NC_020517	CCT	2	6	237159	237164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
923	NC_020517	ACC	2	6	237223	237228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
924	NC_020517	GGGACC	2	12	239073	239084	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
925	NC_020517	GAAG	2	8	239099	239106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
926	NC_020517	GTC	2	6	239133	239138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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928	NC_020517	GCG	2	6	239166	239171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
929	NC_020517	GC	3	6	239212	239217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
930	NC_020517	TCG	2	6	239227	239232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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932	NC_020517	CTG	2	6	239253	239258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
933	NC_020517	GCCG	2	8	239301	239308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
934	NC_020517	TGAGC	2	10	239314	239323	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
935	NC_020517	TTGC	2	8	239366	239373	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
936	NC_020517	CCGC	2	8	243133	243140	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
937	NC_020517	CTTGT	2	10	244024	244033	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
938	NC_020517	CGAAA	2	10	244112	244121	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
939	NC_020517	T	6	6	244144	244149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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941	NC_020517	TCA	2	6	244264	244269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
942	NC_020517	TGG	2	6	244302	244307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
943	NC_020517	GGT	2	6	244325	244330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
944	NC_020517	GCA	2	6	244378	244383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
945	NC_020517	CGC	2	6	244461	244466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
946	NC_020517	CGT	2	6	244470	244475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
947	NC_020517	CGT	2	6	244486	244491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
948	NC_020517	T	6	6	244537	244542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
949	NC_020517	A	6	6	244558	244563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
950	NC_020517	CGA	2	6	244615	244620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
951	NC_020517	GGC	2	6	244633	244638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
952	NC_020517	GT	3	6	244643	244648	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
953	NC_020517	GCC	2	6	244653	244658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
954	NC_020517	CGT	2	6	244660	244665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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964	NC_020517	GC	3	6	246552	246557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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973	NC_020517	CTG	2	6	251024	251029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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979	NC_020517	GCG	2	6	251355	251360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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982	NC_020517	CA	3	6	252652	252657	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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998	NC_020517	ATA	2	6	259117	259122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
999	NC_020517	AGA	2	6	259136	259141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1000	NC_020517	GGCTGC	2	12	259155	259166	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding

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