MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Beta proteobacterium CB

Total Repeats: 2739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020417	TATTG	2	10	1923911	1923920	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_020417	GCCC	2	8	1923949	1923956	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2503	NC_020417	TCTATT	2	12	1925404	1925415	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2504	NC_020417	ATA	2	6	1926651	1926656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_020417	A	6	6	1928258	1928263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_020417	AC	3	6	1934190	1934195	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2507	NC_020417	CAAA	2	8	1934254	1934261	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2508	NC_020417	ATGA	2	8	1935754	1935761	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_020417	TAA	2	6	1936199	1936204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_020417	TTA	2	6	1941426	1941431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_020417	AGCG	2	8	1950604	1950611	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2512	NC_020417	ACT	2	6	1950756	1950761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_020417	TAC	2	6	1950773	1950778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2514	NC_020417	TCA	2	6	1952105	1952110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_020417	TAA	2	6	1953023	1953028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_020417	GCT	2	6	1954869	1954874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_020417	ATT	2	6	1961497	1961502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_020417	AT	3	6	1963650	1963655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_020417	TA	4	8	1967702	1967709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_020417	T	6	6	1967710	1967715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_020417	ACTT	2	8	1967719	1967726	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2522	NC_020417	CTC	3	9	1968824	1968832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2523	NC_020417	TGTC	2	8	1968870	1968877	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2524	NC_020417	CTA	2	6	1973344	1973349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_020417	A	6	6	1973358	1973363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_020417	TCA	2	6	1973384	1973389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2527	NC_020417	A	6	6	1973746	1973751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_020417	T	7	7	1973781	1973787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_020417	CAT	2	6	1975432	1975437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_020417	ACC	2	6	1975446	1975451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2531	NC_020417	CTGG	2	8	1975468	1975475	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2532	NC_020417	GTTT	2	8	1975506	1975513	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_020417	ATT	2	6	1975527	1975532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_020417	CTG	2	6	1977121	1977126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_020417	CAT	2	6	1980214	1980219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2536	NC_020417	CTT	2	6	1982044	1982049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2537	NC_020417	TCA	2	6	1982396	1982401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_020417	A	6	6	1982417	1982422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_020417	A	6	6	1983847	1983852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_020417	AAT	2	6	1984143	1984148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_020417	AAT	2	6	1984152	1984157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_020417	AAG	2	6	1984164	1984169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_020417	AT	3	6	1984182	1984187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_020417	ATGA	2	8	1984978	1984985	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_020417	A	7	7	1985006	1985012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_020417	GGT	2	6	1985022	1985027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_020417	TGCAC	2	10	1985639	1985648	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2548	NC_020417	TGC	2	6	1985688	1985693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2549	NC_020417	CTT	2	6	1985823	1985828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2550	NC_020417	TAA	2	6	1986931	1986936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_020417	AAT	2	6	1988301	1988306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_020417	GCA	2	6	1988377	1988382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2553	NC_020417	T	6	6	1989183	1989188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_020417	ATCT	2	8	1989247	1989254	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2555	NC_020417	CAG	2	6	1989800	1989805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2556	NC_020417	TAAG	2	8	1989825	1989832	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_020417	A	6	6	1989849	1989854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_020417	GGT	2	6	1989864	1989869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_020417	TGG	2	6	1989882	1989887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_020417	T	6	6	1991218	1991223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_020417	AAT	2	6	1991252	1991257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_020417	ATT	2	6	1991926	1991931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_020417	CCA	2	6	1991998	1992003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2564	NC_020417	TCA	2	6	1992008	1992013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2565	NC_020417	GGT	2	6	1992849	1992854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_020417	A	7	7	1993248	1993254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_020417	CG	3	6	1993286	1993291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2568	NC_020417	CCA	2	6	1993301	1993306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2569	NC_020417	TATT	2	8	1993334	1993341	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_020417	CAG	2	6	1993414	1993419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2572	NC_020417	CTTA	2	8	1995853	1995860	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2573	NC_020417	AAT	2	6	1996044	1996049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_020417	A	6	6	1996095	1996100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_020417	GGT	2	6	1996110	1996115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_020417	TGG	2	6	1996128	1996133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2579	NC_020417	TCAC	2	8	1996338	1996345	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2580	NC_020417	T	6	6	1996416	1996421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_020417	GGT	2	6	1996457	1996462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_020417	GGT	2	6	1996473	1996478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_020417	CAC	2	6	1996486	1996491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2587	NC_020417	TAA	2	6	1997806	1997811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_020417	TAA	2	6	1997815	1997820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_020417	AATT	2	8	1999120	1999127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2595	NC_020417	AGAAA	2	10	1999345	1999354	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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2599	NC_020417	ATG	2	6	1999496	1999501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_020417	TGC	2	6	1999566	1999571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2601	NC_020417	GC	3	6	1999663	1999668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2602	NC_020417	CGG	2	6	1999843	1999848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2603	NC_020417	TGA	2	6	1999852	1999857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2605	NC_020417	TGG	2	6	1999873	1999878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2608	NC_020417	AGC	2	6	2001531	2001536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_020417	CAG	2	6	2001549	2001554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2619	NC_020417	AGTTA	2	10	2003372	2003381	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_020417	TTAT	2	8	2003394	2003401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_020417	A	6	6	2003443	2003448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2626	NC_020417	TTGTT	2	10	2005245	2005254	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_020417	ATTA	2	8	2005282	2005289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_020417	A	6	6	2005314	2005319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_020417	GGT	2	6	2005329	2005334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_020417	T	6	6	2005334	2005339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.