MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 5726

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020410	ACA	2	6	86	91	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020410	CAA	2	6	128	133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020410	TTG	2	6	292	297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020410	CTA	2	6	334	339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020410	AGG	2	6	439	444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020410	CTA	2	6	1922	1927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020410	TAC	2	6	1929	1934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020410	AGG	2	6	1971	1976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020410	TGC	2	6	3132	3137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020410	TCA	2	6	3163	3168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020410	CTA	2	6	6922	6927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020410	ATT	2	6	7014	7019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020410	TGA	2	6	9581	9586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020410	TGT	2	6	9605	9610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020410	CAA	2	6	9710	9715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020410	ACT	2	6	9802	9807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020410	GGC	2	6	9845	9850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020410	GCG	2	6	9905	9910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020410	CGA	2	6	10090	10095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_020410	GCA	2	6	10164	10169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020410	CGC	2	6	10211	10216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_020410	TGT	2	6	10250	10255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020410	GAA	2	6	10260	10265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020410	GGC	2	6	10284	10289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020410	CAG	2	6	10333	10338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020410	ATT	2	6	10374	10379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020410	AGA	2	6	10474	10479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020410	GGA	2	6	10524	10529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020410	GAG	2	6	10572	10577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020410	TGC	2	6	10669	10674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020410	GAA	2	6	10788	10793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020410	GGT	2	6	10862	10867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020410	GTC	2	6	10876	10881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020410	GGA	2	6	10988	10993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020410	ATC	2	6	11012	11017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020410	CAC	2	6	11223	11228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_020410	GAT	2	6	11294	11299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020410	CCT	2	6	11350	11355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_020410	TTC	2	6	11441	11446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020410	TGT	2	6	11451	11456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020410	CAC	2	6	11661	11666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_020410	GGA	2	6	11746	11751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020410	GCG	2	6	11780	11785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020410	AGG	2	6	11898	11903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020410	CGG	2	6	11954	11959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020410	GGA	2	6	11986	11991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020410	AGT	2	6	12107	12112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020410	AGA	2	6	12188	12193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020410	AGC	2	6	12649	12654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_020410	TTC	2	6	12747	12752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020410	ACC	2	6	12975	12980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_020410	AGG	2	6	13010	13015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020410	TAG	2	6	13118	13123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020410	GAG	2	6	13205	13210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020410	CGG	2	6	13465	13470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_020410	TAC	2	6	13735	13740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020410	CGC	2	6	13765	13770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_020410	CCT	2	6	13823	13828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_020410	GGT	2	6	13959	13964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020410	CGT	2	6	14154	14159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020410	GAG	2	6	14203	14208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020410	GTT	2	6	14257	14262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020410	GAT	2	6	14381	14386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020410	TGG	2	6	14515	14520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020410	CGC	2	6	14618	14623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_020410	TCA	2	6	14650	14655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020410	ATA	2	6	15711	15716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020410	TGA	2	6	18712	18717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020410	ATT	2	6	18757	18762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020410	GTG	2	6	20496	20501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020410	GTT	2	6	20698	20703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020410	TAT	2	6	23339	23344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020410	GGA	2	6	23358	23363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020410	TCC	2	6	23441	23446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_020410	TCC	2	6	24861	24866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_020410	CCT	2	6	26254	26259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_020410	CTG	2	6	26873	26878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_020410	AAG	2	6	26920	26925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020410	CAT	2	6	27464	27469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_020410	GCA	2	6	27672	27677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_020410	TAA	2	6	27867	27872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020410	ATG	2	6	27875	27880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020410	AGG	2	6	27889	27894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020410	TCT	2	6	30816	30821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020410	ATT	2	6	31129	31134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020410	GGT	2	6	31154	31159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020410	TGA	2	6	31177	31182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020410	GAC	2	6	31222	31227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_020410	AAT	2	6	31247	31252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020410	ACT	2	6	31365	31370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020410	GGC	2	6	31408	31413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020410	GCG	2	6	31468	31473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020410	CGA	2	6	31653	31658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_020410	GCA	2	6	31727	31732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_020410	CGC	2	6	31774	31779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_020410	TGT	2	6	31813	31818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020410	GAA	2	6	31823	31828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020410	GGC	2	6	31847	31852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020410	CAG	2	6	31896	31901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_020410	ATT	2	6	31937	31942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020410	AGA	2	6	32037	32042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020410	GGA	2	6	32087	32092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020410	GAG	2	6	32135	32140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020410	TGC	2	6	32232	32237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_020410	GAA	2	6	32351	32356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020410	GGT	2	6	32425	32430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020410	GTC	2	6	32439	32444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_020410	GGA	2	6	32551	32556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020410	ATC	2	6	32575	32580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_020410	CAC	2	6	32786	32791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_020410	GAT	2	6	32857	32862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020410	CCT	2	6	32913	32918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_020410	TTC	2	6	33004	33009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_020410	TGT	2	6	33014	33019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020410	CAC	2	6	33224	33229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_020410	GGA	2	6	33309	33314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020410	GCG	2	6	33343	33348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_020410	AGG	2	6	33461	33466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020410	CGG	2	6	33517	33522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_020410	GGA	2	6	33549	33554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020410	AGT	2	6	33670	33675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020410	AGA	2	6	33751	33756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020410	AGC	2	6	34212	34217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_020410	TTC	2	6	34310	34315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_020410	ACA	2	6	34517	34522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_020410	ACC	2	6	34538	34543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_020410	AGG	2	6	34573	34578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020410	TAG	2	6	34681	34686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020410	GAG	2	6	34768	34773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020410	CGG	2	6	35028	35033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_020410	TAC	2	6	35298	35303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_020410	CGC	2	6	35328	35333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_020410	CCT	2	6	35386	35391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_020410	GGT	2	6	35522	35527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020410	CGT	2	6	35719	35724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_020410	GAG	2	6	35768	35773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020410	GTT	2	6	35822	35827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020410	GAT	2	6	35946	35951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020410	TGG	2	6	36080	36085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020410	CGC	2	6	36184	36189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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279	NC_020410	GAG	2	6	97882	97887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_020410	GGA	2	6	98298	98303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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