MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 11696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020410	CCG	2	6	387044	387049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1502	NC_020410	GAA	2	6	387072	387077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_020410	A	7	7	387082	387088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_020410	T	6	6	387099	387104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_020410	GAG	2	6	389967	389972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_020410	CCGG	2	8	391108	391115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_020410	T	6	6	391125	391130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_020410	A	6	6	391131	391136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_020410	GTG	2	6	391228	391233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_020410	CGG	2	6	393930	393935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_020410	GAA	4	12	395391	395402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_020410	G	6	6	397909	397914	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_020410	TGC	2	6	398687	398692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_020410	CTC	2	6	398693	398698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1515	NC_020410	TCC	2	6	400142	400147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1516	NC_020410	GTG	2	6	400150	400155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_020410	CTT	2	6	400176	400181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_020410	ATC	2	6	400190	400195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_020410	TA	3	6	400203	400208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_020410	A	7	7	400225	400231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_020410	TGA	2	6	400253	400258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_020410	TAT	2	6	400309	400314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_020410	GGA	2	6	400337	400342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_020410	CGG	2	6	402454	402459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_020410	GCC	2	6	402469	402474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1526	NC_020410	AGC	2	6	403770	403775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_020410	CGC	2	6	403776	403781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1528	NC_020410	GCCA	2	8	403805	403812	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_020410	GAA	2	6	403855	403860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_020410	T	7	7	403909	403915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_020410	GCG	2	6	403935	403940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_020410	CGC	2	6	403956	403961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_020410	ATAA	2	8	404046	404053	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_020410	AAC	2	6	404054	404059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_020410	GCT	2	6	404144	404149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_020410	A	6	6	404176	404181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_020410	TAT	2	6	405603	405608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_020410	CT	3	6	405609	405614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_020410	T	6	6	405636	405641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_020410	GA	3	6	405649	405654	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_020410	GGA	2	6	405671	405676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_020410	A	6	6	405728	405733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_020410	AGC	2	6	405739	405744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_020410	GAT	2	6	405863	405868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_020410	TGATAA	2	12	405886	405897	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_020410	AT	3	6	405912	405917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_020410	GTT	2	6	405922	405927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_020410	CTT	2	6	411054	411059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_020410	CTT	2	6	411951	411956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_020410	TTTG	2	8	412046	412053	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_020410	A	6	6	412062	412067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_020410	TCAT	2	8	412847	412854	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1553	NC_020410	TCC	2	6	413156	413161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_020410	AACT	2	8	413198	413205	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_020410	GAT	2	6	413267	413272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_020410	TCA	2	6	415093	415098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_020410	AAG	2	6	415106	415111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_020410	ATT	2	6	416463	416468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_020410	CGG	2	6	416476	416481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_020410	T	6	6	418029	418034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_020410	AAT	2	6	418046	418051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_020410	AAG	2	6	418091	418096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_020410	AGG	2	6	418977	418982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_020410	A	8	8	419777	419784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_020410	GAT	2	6	422076	422081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_020410	GGTT	2	8	422095	422102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_020410	TCC	2	6	422687	422692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1568	NC_020410	TGA	2	6	422709	422714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_020410	CCTC	2	8	422716	422723	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1570	NC_020410	CA	3	6	422748	422753	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_020410	TGA	2	6	422760	422765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_020410	A	6	6	422777	422782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_020410	AGA	2	6	422831	422836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_020410	GGA	2	6	422844	422849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_020410	TGA	2	6	423206	423211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_020410	T	8	8	423218	423225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_020410	CTC	2	6	423257	423262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1578	NC_020410	ATG	2	6	423298	423303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_020410	GA	5	10	423315	423324	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_020410	TTAT	2	8	423336	423343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_020410	AGGC	2	8	423354	423361	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1582	NC_020410	AGGG	2	8	423366	423373	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_020410	T	6	6	426422	426427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_020410	GA	4	8	426441	426448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_020410	GCC	2	6	426864	426869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1586	NC_020410	GCG	2	6	426874	426879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_020410	C	6	6	427097	427102	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1588	NC_020410	T	6	6	427121	427126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_020410	GAC	2	6	427157	427162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_020410	A	6	6	427942	427947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_020410	CT	3	6	427966	427971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_020410	T	6	6	427971	427976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_020410	AAAT	2	8	428043	428050	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_020410	CAA	2	6	428067	428072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_020410	AGG	2	6	428129	428134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_020410	GGA	2	6	428915	428920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_020410	TGA	2	6	430963	430968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_020410	TTC	2	6	433492	433497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_020410	GGA	2	6	433532	433537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_020410	CG	3	6	434187	434192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1601	NC_020410	GC	3	6	434209	434214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1602	NC_020410	AAAC	2	8	434230	434237	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1603	NC_020410	A	6	6	434270	434275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_020410	AAT	2	6	434284	434289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_020410	A	6	6	434321	434326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_020410	GGAT	2	8	434339	434346	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_020410	T	7	7	434901	434907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_020410	A	7	7	434954	434960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_020410	A	7	7	434977	434983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_020410	GCC	2	6	437080	437085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1611	NC_020410	GTTT	2	8	438097	438104	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_020410	TTTTTC	2	12	438200	438211	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1613	NC_020410	AAT	2	6	438259	438264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_020410	TAT	2	6	438281	438286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_020410	GCA	2	6	438307	438312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_020410	GT	3	6	440473	440478	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_020410	T	7	7	440478	440484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_020410	GAA	2	6	440511	440516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_020410	T	6	6	440589	440594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_020410	GAAA	2	8	440616	440623	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_020410	T	7	7	440635	440641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_020410	T	7	7	442215	442221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_020410	AAG	2	6	442325	442330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_020410	T	7	7	443742	443748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_020410	A	7	7	443755	443761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_020410	TAA	2	6	443783	443788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_020410	AAG	2	6	443793	443798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_020410	TTC	2	6	444431	444436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_020410	ATT	2	6	444871	444876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_020410	ACA	2	6	444910	444915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_020410	A	6	6	444923	444928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_020410	CTT	2	6	444938	444943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_020410	T	6	6	444942	444947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_020410	A	7	7	444989	444995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_020410	A	6	6	445045	445050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_020410	GAA	2	6	445160	445165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_020410	AT	3	6	445221	445226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_020410	TATT	2	8	445227	445234	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1639	NC_020410	AAGAA	2	10	445240	445249	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1776	NC_020410	GTT	2	6	489229	489234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1977	NC_020410	GCT	2	6	519089	519094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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