MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 11696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020410	CGG	2	6	203974	203979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_020410	TTC	2	6	204021	204026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_020410	A	7	7	204075	204081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_020410	TTC	2	6	204124	204129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_020410	AGG	2	6	204148	204153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_020410	TTA	2	6	205983	205988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_020410	T	6	6	205999	206004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_020410	ATAC	2	8	206021	206028	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_020410	TA	3	6	206057	206062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_020410	TCA	2	6	206154	206159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_020410	AT	3	6	206208	206213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_020410	TGA	2	6	206260	206265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_020410	TA	3	6	206295	206300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_020410	T	6	6	206356	206361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_020410	AAT	2	6	206392	206397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_020410	AGAAA	2	10	206407	206416	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_020410	AAAT	2	8	207567	207574	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_020410	AT	3	6	207612	207617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_020410	T	6	6	207627	207632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_020410	GA	3	6	207641	207646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_020410	GGT	2	6	208695	208700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_020410	TAC	2	6	208716	208721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_020410	CCTA	2	8	208752	208759	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_020410	ACAGC	2	10	208770	208779	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1025	NC_020410	GCT	2	6	208788	208793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_020410	AGAT	2	8	208833	208840	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_020410	GAT	2	6	208888	208893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_020410	GAT	2	6	208910	208915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_020410	CTA	2	6	208932	208937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_020410	TTG	2	6	208946	208951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_020410	TG	3	6	208975	208980	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_020410	AGG	2	6	209028	209033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_020410	ATA	2	6	210064	210069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_020410	A	6	6	210229	210234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_020410	ATT	2	6	210270	210275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_020410	AAT	2	6	210299	210304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_020410	ATG	2	6	210307	210312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_020410	TAA	2	6	210330	210335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_020410	TTG	2	6	210416	210421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_020410	AAT	2	6	210441	210446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_020410	CA	3	6	210485	210490	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_020410	ACT	2	6	210531	210536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_020410	TAA	2	6	210560	210565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_020410	TA	3	6	210599	210604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_020410	AATC	2	8	210610	210617	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1046	NC_020410	TGT	2	6	210657	210662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_020410	AAC	2	6	210712	210717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_020410	AAT	2	6	210726	210731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_020410	A	6	6	210743	210748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_020410	ACA	2	6	210755	210760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_020410	ACA	2	6	212296	212301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_020410	GCC	2	6	212352	212357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_020410	TTC	2	6	212375	212380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_020410	CAT	2	6	213289	213294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_020410	CAT	2	6	213374	213379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_020410	A	6	6	214573	214578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_020410	ATG	2	6	214587	214592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_020410	CCT	2	6	215471	215476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_020410	ATT	2	6	215493	215498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_020410	ATA	2	6	215513	215518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_020410	GGAA	2	8	215521	215528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_020410	GAT	2	6	215533	215538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_020410	A	6	6	215548	215553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_020410	AT	3	6	216735	216740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_020410	TAT	2	6	216790	216795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_020410	TGT	2	6	216810	216815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_020410	ATA	2	6	217359	217364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_020410	TAT	2	6	217427	217432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_020410	TTG	2	6	217479	217484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_020410	A	7	7	217510	217516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_020410	TAT	2	6	217540	217545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_020410	TA	3	6	217569	217574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_020410	ATT	2	6	217653	217658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_020410	AT	3	6	217663	217668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_020410	AGG	2	6	217682	217687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_020410	CT	3	6	219094	219099	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_020410	A	7	7	219145	219151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_020410	CTC	2	6	221689	221694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_020410	TC	3	6	221693	221698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_020410	TGC	2	6	221808	221813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_020410	AGG	2	6	225366	225371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_020410	GCC	2	6	225860	225865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_020410	TC	3	6	225888	225893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_020410	AGGG	2	8	225920	225927	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_020410	CGG	2	6	226194	226199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_020410	ATC	2	6	226238	226243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_020410	GGA	2	6	226283	226288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_020410	GCC	2	6	227000	227005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_020410	AGT	2	6	227328	227333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_020410	AAT	2	6	227422	227427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_020410	AT	3	6	227435	227440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_020410	T	6	6	229140	229145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_020410	A	7	7	229154	229160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_020410	ATGA	2	8	229185	229192	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_020410	T	7	7	229228	229234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_020410	AATG	2	8	229280	229287	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_020410	CTT	2	6	229307	229312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_020410	TCT	2	6	229313	229318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_020410	AAT	2	6	229373	229378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_020410	AAT	2	6	229417	229422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_020410	TAA	2	6	229427	229432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_020410	TAA	2	6	229468	229473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_020410	T	6	6	229491	229496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_020410	TGA	2	6	229558	229563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_020410	ATT	2	6	229564	229569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_020410	TTTA	2	8	229583	229590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_020410	ATT	2	6	229600	229605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_020410	T	6	6	230833	230838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_020410	TGAG	2	8	230854	230861	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_020410	AAATT	2	10	230877	230886	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_020410	TTTG	2	8	231162	231169	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_020410	TAA	2	6	231215	231220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_020410	TAA	2	6	231237	231242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_020410	CCGC	2	8	231249	231256	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1115	NC_020410	A	8	8	231291	231298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_020410	CAT	2	6	231308	231313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_020410	TTC	2	6	232224	232229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_020410	TGT	2	6	232306	232311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_020410	TCC	2	6	233655	233660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_020410	ATG	2	6	233680	233685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_020410	TATG	2	8	233686	233693	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_020410	TCCTT	2	10	233696	233705	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1123	NC_020410	TCCA	2	8	233771	233778	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_020410	T	7	7	233862	233868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_020410	AATA	2	8	233870	233877	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_020410	CGG	2	6	234231	234236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_020410	CT	3	6	234269	234274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_020410	CTT	2	6	235738	235743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_020410	T	6	6	235818	235823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_020410	G	6	6	235829	235834	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_020410	CAT	2	6	235846	235851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_020410	A	7	7	235852	235858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_020410	TCC	2	6	236309	236314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_020410	TTCA	2	8	238580	238587	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1135	NC_020410	CAT	2	6	238646	238651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_020410	AG	3	6	238675	238680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_020410	ACA	2	6	238723	238728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_020410	AGT	3	9	238786	238794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_020410	AGGA	3	12	238906	238917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_020410	GCT	2	6	239398	239403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1141	NC_020410	CAT	2	6	239491	239496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1142	NC_020410	A	6	6	239579	239584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_020410	AT	4	8	240142	240149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1144	NC_020410	GA	3	6	240165	240170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1145	NC_020410	TATC	2	8	241254	241261	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1148	NC_020410	T	6	6	242524	242529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1149	NC_020410	TA	3	6	242541	242546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1150	NC_020410	CAT	2	6	242673	242678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1151	NC_020410	TCAT	2	8	242687	242694	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1152	NC_020410	A	6	6	242789	242794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1153	NC_020410	TAA	2	6	242840	242845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1154	NC_020410	GCT	2	6	244782	244787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1156	NC_020410	GAA	2	6	245101	245106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1157	NC_020410	ACGG	2	8	245112	245119	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1161	NC_020410	T	6	6	246197	246202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1162	NC_020410	GGC	2	6	247505	247510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1163	NC_020410	ACC	2	6	247512	247517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1164	NC_020410	GAAA	2	8	247557	247564	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1165	NC_020410	A	7	7	247621	247627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1172	NC_020410	AT	3	6	251427	251432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1173	NC_020410	A	6	6	251477	251482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1182	NC_020410	AGTA	2	8	256909	256916	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1185	NC_020410	TGC	2	6	256995	257000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1275	NC_020410	A	6	6	276881	276886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1277	NC_020410	TCT	2	6	276905	276910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1418	NC_020410	AATA	2	8	336473	336480	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1419	NC_020410	ACGATT	2	12	336484	336495	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1420	NC_020410	TAA	2	6	336498	336503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_020410	CAT	2	6	336508	336513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1422	NC_020410	A	6	6	336518	336523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1424	NC_020410	TGA	2	6	337821	337826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1442	NC_020410	CTC	2	6	343821	343826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1443	NC_020410	GTA	2	6	343952	343957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_020410	TGA	2	6	343963	343968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1450	NC_020410	AT	3	6	344512	344517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1451	NC_020410	ATAA	2	8	344592	344599	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_020410	AAAT	2	8	344609	344616	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_020410	T	7	7	344655	344661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1454	NC_020410	AAT	2	6	344708	344713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1455	NC_020410	AT	3	6	344738	344743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1456	NC_020410	GAA	2	6	344754	344759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1464	NC_020410	AGG	2	6	370485	370490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1486	NC_020410	T	8	8	379355	379362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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