MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 11696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020410	TTC	2	6	100115	100120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_020410	ACA	2	6	100322	100327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_020410	ACC	2	6	100343	100348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_020410	G	6	6	100368	100373	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020410	AGG	2	6	100378	100383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020410	GCGA	2	8	100474	100481	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
507	NC_020410	TAG	2	6	100486	100491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_020410	GAG	2	6	100573	100578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_020410	GA	3	6	100596	100601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
510	NC_020410	GA	3	6	100675	100680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_020410	CGG	2	6	100833	100838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_020410	GA	3	6	100931	100936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
513	NC_020410	TAGG	2	8	101049	101056	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_020410	TAC	2	6	101103	101108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_020410	CGC	2	6	101133	101138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_020410	CGGG	2	8	101145	101152	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
517	NC_020410	CCT	2	6	101191	101196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_020410	GGT	2	6	101327	101332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_020410	CGT	2	6	101522	101527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_020410	GAG	2	6	101571	101576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_020410	GTT	2	6	101625	101630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_020410	C	6	6	101698	101703	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
523	NC_020410	GAT	2	6	101749	101754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_020410	ATCG	2	8	101810	101817	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
525	NC_020410	GA	3	6	101862	101867	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
526	NC_020410	TGG	2	6	101883	101888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_020410	CGC	2	6	101986	101991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_020410	TCA	2	6	102018	102023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_020410	T	6	6	102033	102038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020410	TA	3	6	102057	102062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_020410	ATA	2	6	102126	102131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_020410	AGTCAA	2	12	102196	102207	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
533	NC_020410	AGG	2	6	102211	102216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_020410	GATT	2	8	102700	102707	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
535	NC_020410	GA	3	6	102723	102728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_020410	GTT	2	6	102753	102758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_020410	AAG	2	6	102772	102777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_020410	TAT	2	6	102859	102864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_020410	GCT	2	6	102869	102874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_020410	TA	3	6	106830	106835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_020410	ACA	2	6	106864	106869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_020410	TAT	2	6	109369	109374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_020410	CTG	2	6	109416	109421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_020410	A	6	6	109422	109427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020410	AGG	2	6	109439	109444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_020410	TGG	2	6	111758	111763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_020410	AT	3	6	111776	111781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_020410	TTG	2	6	113284	113289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_020410	AGAA	2	8	113321	113328	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
550	NC_020410	GA	4	8	113341	113348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
551	NC_020410	GAA	2	6	113389	113394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_020410	GGC	2	6	113421	113426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_020410	CGC	2	6	113427	113432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_020410	CG	3	6	113489	113494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
555	NC_020410	T	7	7	113532	113538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_020410	GA	3	6	113566	113571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
557	NC_020410	G	6	6	113574	113579	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
558	NC_020410	TCTA	2	8	117359	117366	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
559	NC_020410	G	6	6	117375	117380	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
560	NC_020410	TTA	2	6	118089	118094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_020410	AATG	2	8	118100	118107	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
562	NC_020410	A	6	6	118134	118139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_020410	AAG	2	6	118225	118230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_020410	GCA	2	6	118235	118240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_020410	ATA	2	6	118519	118524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_020410	T	6	6	118551	118556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_020410	TGT	2	6	118561	118566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_020410	A	6	6	118569	118574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_020410	A	6	6	119196	119201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_020410	TA	3	6	119213	119218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_020410	ATA	2	6	119225	119230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_020410	AGCT	2	8	119263	119270	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
573	NC_020410	TCAT	2	8	119281	119288	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
574	NC_020410	AGG	2	6	119345	119350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_020410	AGG	2	6	119863	119868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_020410	TGT	2	6	120616	120621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_020410	ATA	2	6	120627	120632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_020410	CAG	2	6	120651	120656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_020410	TA	4	8	120689	120696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_020410	TTACG	2	10	120706	120715	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
581	NC_020410	TA	3	6	120724	120729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_020410	TCG	2	6	120767	120772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_020410	AGG	2	6	120819	120824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
584	NC_020410	TAAAA	2	10	121346	121355	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_020410	GGA	2	6	121361	121366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_020410	AGG	2	6	121823	121828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_020410	TA	3	6	122483	122488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_020410	AAT	2	6	122507	122512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_020410	TAA	2	6	122550	122555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_020410	T	6	6	122600	122605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_020410	TTA	2	6	122646	122651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_020410	ATA	2	6	122657	122662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_020410	TGAT	2	8	126273	126280	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
594	NC_020410	CTG	2	6	129937	129942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_020410	ATT	2	6	129982	129987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_020410	A	6	6	130006	130011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_020410	GTT	2	6	130020	130025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_020410	ATA	2	6	130046	130051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_020410	GGA	2	6	130086	130091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_020410	TA	3	6	130363	130368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_020410	T	6	6	130396	130401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_020410	ATG	2	6	130407	130412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_020410	ACC	2	6	130414	130419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_020410	AAAT	2	8	130882	130889	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_020410	GGA	2	6	130906	130911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
606	NC_020410	ATA	2	6	131406	131411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_020410	TAA	2	6	131418	131423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_020410	ACT	2	6	133548	133553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_020410	GCTT	2	8	133576	133583	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
610	NC_020410	AGG	2	6	133626	133631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
611	NC_020410	T	7	7	134871	134877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_020410	TAA	2	6	135943	135948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_020410	TAAA	2	8	135976	135983	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_020410	AC	3	6	136058	136063	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
615	NC_020410	AGG	2	6	136135	136140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
616	NC_020410	AGG	2	6	136482	136487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_020410	AGG	2	6	137138	137143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_020410	AGG	2	6	138079	138084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
619	NC_020410	AAAT	2	8	141606	141613	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_020410	AGG	2	6	141624	141629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_020410	AAGG	2	8	141958	141965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
622	NC_020410	ACA	2	6	142566	142571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_020410	A	6	6	142708	142713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_020410	AGG	2	6	142741	142746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
625	NC_020410	TA	3	6	142751	142756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_020410	GAA	2	6	143739	143744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_020410	A	7	7	144124	144130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_020410	AGG	2	6	144858	144863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
629	NC_020410	AG	3	6	146638	146643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
630	NC_020410	GAA	2	6	148128	148133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_020410	GCT	2	6	148144	148149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_020410	TCA	2	6	148167	148172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_020410	ATCA	2	8	148230	148237	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
634	NC_020410	AG	3	6	148340	148345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
635	NC_020410	GAA	2	6	148360	148365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_020410	AGG	2	6	148616	148621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_020410	GAAAAG	2	12	148687	148698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_020410	AAACAA	2	12	148728	148739	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
639	NC_020410	TAAT	2	8	148743	148750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_020410	AGG	2	6	148752	148757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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772	NC_020410	TACAT	2	10	167105	167114	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
773	NC_020410	AGT	2	6	167128	167133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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775	NC_020410	CTC	2	6	167289	167294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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