MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-63

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020392	TTA	2	6	39	44	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020392	TTC	2	6	91	96	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020392	CCA	2	6	98	103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_020392	GAG	2	6	144	149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020392	CAA	2	6	163	168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020392	TTC	2	6	220	225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020392	ATG	2	6	244	249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020392	AAG	2	6	250	255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020392	GTA	2	6	290	295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020392	AGA	3	9	427	435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020392	GAT	2	6	458	463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020392	CAT	3	9	516	524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020392	GAA	2	6	762	767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020392	CTT	2	6	786	791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020392	TCA	2	6	980	985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020392	ATC	2	6	1000	1005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020392	ATG	2	6	1015	1020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020392	ATA	2	6	1090	1095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020392	TCA	3	9	1115	1123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_020392	TCG	2	6	1248	1253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020392	TAA	2	6	1273	1278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020392	GTT	2	6	1356	1361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020392	CTT	2	6	1365	1370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020392	TAA	2	6	1470	1475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020392	TCT	2	6	1485	1490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020392	TCA	2	6	1557	1562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020392	GTA	2	6	1914	1919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020392	TTG	2	6	1942	1947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020392	GAA	2	6	1989	1994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020392	TAT	2	6	2046	2051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020392	TTG	2	6	2065	2070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020392	TAA	2	6	2083	2088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020392	AGA	2	6	2104	2109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020392	TTC	2	6	2191	2196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020392	TCC	2	6	3340	3345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_020392	ACA	2	6	3440	3445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020392	TGT	2	6	3458	3463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020392	ATT	2	6	3464	3469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020392	AAT	2	6	3504	3509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020392	CAT	2	6	5309	5314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020392	TTA	2	6	8912	8917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020392	ATA	2	6	8938	8943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020392	TAC	2	6	8955	8960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020392	TTA	2	6	9145	9150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020392	ATT	2	6	10160	10165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020392	TAA	2	6	10233	10238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020392	AGA	2	6	10536	10541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020392	GTG	2	6	10765	10770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020392	GTG	2	6	10898	10903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020392	AGT	2	6	10904	10909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020392	GGT	2	6	13565	13570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020392	TCC	2	6	16722	16727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_020392	TAT	2	6	16733	16738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020392	TAA	2	6	16771	16776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020392	TCC	2	6	16855	16860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_020392	AGC	2	6	16927	16932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020392	GAT	2	6	16949	16954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020392	GGC	2	6	16966	16971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020392	GTT	2	6	17003	17008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020392	AGG	2	6	17066	17071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020392	ATT	2	6	18346	18351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020392	CCT	2	6	26971	26976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_020392	TCC	2	6	29264	29269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_020392	CCA	2	6	29273	29278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_020392	CCT	2	6	32960	32965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_020392	TAA	2	6	33483	33488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020392	ATA	2	6	33496	33501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020392	CTA	2	6	34131	34136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_020392	AAG	2	6	35352	35357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020392	CTA	2	6	35448	35453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020392	CAT	2	6	35476	35481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020392	CTT	2	6	36302	36307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020392	GAA	2	6	36391	36396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020392	CCT	2	6	36435	36440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_020392	ACC	2	6	36540	36545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_020392	TAA	2	6	36589	36594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020392	TGA	2	6	36619	36624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020392	TTC	2	6	36635	36640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020392	GTA	2	6	36655	36660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020392	TTA	2	6	36665	36670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020392	AGG	2	6	36677	36682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020392	ACA	2	6	36683	36688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_020392	CTT	2	6	38941	38946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020392	CAC	2	6	41346	41351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_020392	TTC	2	6	42997	43002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_020392	TCC	2	6	46072	46077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_020392	TAT	2	6	46078	46083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020392	TCC	2	6	47367	47372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_020392	CAC	2	6	47977	47982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_020392	AAT	2	6	48031	48036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020392	GAC	2	6	48086	48091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020392	GAA	2	6	48169	48174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020392	ATC	2	6	48254	48259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_020392	TCG	2	6	48318	48323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_020392	GGC	2	6	48351	48356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_020392	CCA	2	6	48418	48423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_020392	ATA	3	9	48790	48798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020392	ATA	2	6	48801	48806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020392	TGA	2	6	49206	49211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020392	AAG	2	6	49235	49240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020392	CTA	2	6	49253	49258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_020392	ATT	2	6	49984	49989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020392	AAT	2	6	50247	50252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020392	ATA	2	6	50344	50349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020392	TAT	2	6	53316	53321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020392	TCA	2	6	53408	53413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_020392	TAA	2	6	53477	53482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020392	AGA	2	6	53522	53527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020392	ATA	2	6	53583	53588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020392	TAT	2	6	54874	54879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020392	CTA	2	6	54969	54974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_020392	CCT	2	6	55010	55015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_020392	ACT	2	6	55032	55037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_020392	CTT	2	6	55054	55059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_020392	TCA	2	6	55158	55163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_020392	ACC	2	6	57329	57334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_020392	TCC	2	6	57452	57457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_020392	CAA	2	6	57491	57496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_020392	TTC	2	6	57506	57511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_020392	TTA	2	6	57566	57571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020392	TGT	2	6	57600	57605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020392	AAC	2	6	57606	57611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_020392	TTA	2	6	57752	57757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020392	ATA	2	6	59757	59762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020392	ATA	2	6	59811	59816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020392	ATA	2	6	60070	60075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020392	TAT	2	6	60242	60247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020392	TCA	2	6	60265	60270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_020392	GAT	2	6	60424	60429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020392	CGA	2	6	60436	60441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_020392	GTA	2	6	61530	61535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020392	TTA	2	6	61541	61546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020392	TCT	2	6	63494	63499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_020392	TTC	2	6	63523	63528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_020392	TAA	2	6	63573	63578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020392	TTA	2	6	63725	63730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.